MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016832	T	6	6	993352	993357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016832	ATTT	2	8	993361	993368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016832	GCG	2	6	995542	995547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016832	TCA	2	6	995590	995595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_016832	TCG	2	6	999259	999264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016832	CCT	2	6	999266	999271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_016832	CG	3	6	1003953	1003958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_016832	GGTTG	2	10	1003987	1003996	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016832	T	6	6	1004049	1004054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016832	CTG	2	6	1004203	1004208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016832	A	6	6	1004212	1004217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016832	ACA	2	6	1004560	1004565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016832	GACGC	2	10	1004611	1004620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3014	NC_016832	GC	3	6	1004663	1004668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_016832	CTG	2	6	1005034	1005039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_016832	ATAA	2	8	1005043	1005050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016832	ATC	2	6	1005051	1005056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_016832	ATA	2	6	1005120	1005125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016832	ATT	2	6	1005126	1005131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016832	T	6	6	1005158	1005163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016832	TA	3	6	1005197	1005202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016832	GAC	2	6	1005227	1005232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_016832	CCG	2	6	1005291	1005296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_016832	AAG	2	6	1006789	1006794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016832	TAC	2	6	1006801	1006806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016832	TAA	2	6	1006832	1006837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016832	GGC	2	6	1006885	1006890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3029	NC_016832	TCT	2	6	1006920	1006925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016832	TTC	2	6	1006926	1006931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_016832	TCT	2	6	1006934	1006939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_016832	TTC	2	6	1006940	1006945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_016832	GCC	2	6	1007398	1007403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_016832	GAA	2	6	1008942	1008947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016832	CGC	2	6	1011285	1011290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_016832	GATT	2	8	1012948	1012955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016832	T	6	6	1012996	1013001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016832	GAAA	2	8	1013022	1013029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016832	TTG	2	6	1013094	1013099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_016832	ACG	2	6	1013161	1013166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_016832	ATT	2	6	1013191	1013196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016832	CTG	2	6	1013197	1013202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016832	AAT	2	6	1013212	1013217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016832	G	6	6	1013222	1013227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016832	A	6	6	1013449	1013454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_016832	CAG	2	6	1013549	1013554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3051	NC_016832	TGA	2	6	1013701	1013706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016832	TGCAGA	2	12	1013746	1013757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3053	NC_016832	CGCT	2	8	1013766	1013773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016832	TCT	2	6	1013819	1013824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016832	CGG	2	6	1013836	1013841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_016832	GC	3	6	1013892	1013897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_016832	AGC	2	6	1013914	1013919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_016832	AAT	2	6	1013967	1013972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016832	CG	3	6	1014003	1014008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_016832	TAT	2	6	1014014	1014019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016832	TTA	2	6	1014037	1014042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016832	CAGC	2	8	1014055	1014062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016832	GCGG	2	8	1014073	1014080	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_016832	CAGC	2	8	1014128	1014135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_016832	GGC	2	6	1014149	1014154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_016832	CTT	2	6	1014333	1014338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_016832	GCA	2	6	1015207	1015212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3073	NC_016832	GCC	2	6	1016725	1016730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_016832	T	6	6	1016785	1016790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016832	ATA	2	6	1016812	1016817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_016832	ATT	2	6	1019351	1019356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016832	TA	4	8	1019429	1019436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016832	TCAT	2	8	1019462	1019469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_016832	AAT	2	6	1019470	1019475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016832	TATCAA	2	12	1019479	1019490	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3086	NC_016832	ATT	2	6	1020718	1020723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_016832	ACA	2	6	1020852	1020857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_016832	T	7	7	1020896	1020902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016832	AAT	2	6	1021517	1021522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016832	ACA	2	6	1021526	1021531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_016832	TC	3	6	1022748	1022753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_016832	ACA	2	6	1024842	1024847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016832	CGC	2	6	1025420	1025425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_016832	GTGA	2	8	1025444	1025451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016832	GCA	2	6	1025507	1025512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_016832	GCTG	2	8	1025668	1025675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_016832	A	7	7	1025683	1025689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016832	TGG	2	6	1025785	1025790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016832	AAT	2	6	1025878	1025883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_016832	ACC	2	6	1025908	1025913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016832	T	7	7	1025923	1025929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016832	A	6	6	1025986	1025991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016832	ACA	2	6	1026017	1026022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_016832	CT	3	6	1026276	1026281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_016832	TA	3	6	1026358	1026363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016832	A	7	7	1026363	1026369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016832	A	7	7	1026403	1026409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016832	TA	3	6	1026450	1026455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016832	TTAA	2	8	1026483	1026490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016832	TCA	2	6	1026512	1026517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_016832	TAA	2	6	1026569	1026574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016832	TAT	2	6	1026632	1026637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016832	A	6	6	1028184	1028189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016832	CA	3	6	1028261	1028266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_016832	TTG	2	6	1028282	1028287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016832	CTGG	2	8	1028295	1028302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_016832	GGT	2	6	1028309	1028314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016832	TAA	2	6	1028339	1028344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016832	GCG	2	6	1028400	1028405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016832	A	6	6	1028406	1028411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016832	AACCGC	2	12	1028413	1028424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_016832	A	7	7	1028484	1028490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016832	CTG	2	6	1028535	1028540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_016832	T	6	6	1028573	1028578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016832	CGG	2	6	1028622	1028627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016832	TC	3	6	1028668	1028673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_016832	TG	3	6	1028679	1028684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016832	TCC	2	6	1028721	1028726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_016832	TCC	2	6	1028749	1028754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_016832	CTGC	2	8	1028796	1028803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_016832	A	7	7	1028804	1028810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016832	TCA	2	6	1028853	1028858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_016832	TCGC	2	8	1031003	1031010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3145	NC_016832	TGTAG	2	10	1032602	1032611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3155	NC_016832	T	6	6	1033551	1033556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_016832	TATT	2	8	1067900	1067907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_016832	TTG	2	6	1067984	1067989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_016832	GGA	2	6	1068015	1068020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_016832	TCA	2	6	1070777	1070782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_016832	AGCGC	2	10	1070810	1070819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3253	NC_016832	AC	3	6	1070829	1070834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_016832	TCA	2	6	1072202	1072207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_016832	AG	3	6	1072312	1072317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_016832	AAACT	2	10	1072359	1072368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3257	NC_016832	GAT	2	6	1072437	1072442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_016832	TGTTT	2	10	1074772	1074781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_016832	TG	3	6	1074782	1074787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_016832	CAG	2	6	1074830	1074835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_016832	AG	3	6	1075836	1075841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_016832	AAC	2	6	1077355	1077360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3397	NC_016832	TTG	2	6	1103569	1103574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3399	NC_016832	GGC	2	6	1103718	1103723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3441	NC_016832	AAT	2	6	1113944	1113949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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