MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016832	AAC	2	6	858953	858958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016832	ATT	2	6	861961	861966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016832	CA	3	6	861980	861985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_016832	GTG	2	6	861996	862001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016832	GATG	2	8	862060	862067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016832	TGA	2	6	862068	862073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016832	TCC	2	6	862091	862096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_016832	ATT	2	6	862115	862120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016832	CAG	2	6	862151	862156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_016832	GCG	2	6	862157	862162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_016832	CGT	2	6	862198	862203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_016832	AGGA	2	8	862238	862245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_016832	TGG	2	6	862412	862417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_016832	TGA	2	6	862522	862527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016832	CCG	2	6	862528	862533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_016832	ACG	2	6	862597	862602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_016832	GCA	2	6	862625	862630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_016832	CTGG	2	8	862631	862638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_016832	CG	3	6	862646	862651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_016832	CAC	2	6	862709	862714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_016832	CAG	2	6	862716	862721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_016832	ATCG	2	8	862806	862813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_016832	ATTA	2	8	863007	863014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016832	CCG	2	6	863026	863031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_016832	GCA	2	6	863039	863044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_016832	GTG	2	6	863106	863111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016832	TCAA	2	8	863122	863129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2528	NC_016832	GAG	2	6	863169	863174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016832	GAT	2	6	863192	863197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_016832	GGT	2	6	864456	864461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_016832	GTT	2	6	865900	865905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016832	CAT	2	6	865952	865957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_016832	GCA	2	6	865966	865971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_016832	GAA	2	6	866034	866039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016832	AAC	2	6	866942	866947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_016832	TGGT	2	8	866957	866964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_016832	ATA	2	6	866972	866977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016832	TAA	2	6	867125	867130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_016832	CTG	2	6	867165	867170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_016832	TGA	2	6	867216	867221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_016832	GT	3	6	867237	867242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016832	AATT	2	8	867255	867262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_016832	ATGA	2	8	869328	869335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016832	G	9	9	874976	874984	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_016832	T	6	6	876898	876903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016832	A	6	6	879261	879266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_016832	TAT	2	6	879276	879281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_016832	GAT	2	6	879323	879328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_016832	TA	3	6	879395	879400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_016832	GTT	2	6	879426	879431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_016832	TCTT	2	8	879498	879505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_016832	TAT	2	6	879554	879559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_016832	T	6	6	879571	879576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_016832	TAT	2	6	879611	879616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_016832	TAA	2	6	879641	879646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_016832	GCTT	2	8	879654	879661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_016832	ATTT	2	8	879664	879671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016832	TAA	2	6	879734	879739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016832	TATTT	2	10	884699	884708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016832	AAT	3	9	886189	886197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016832	T	8	8	887779	887786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_016832	TAA	2	6	887830	887835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_016832	TA	3	6	887890	887895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016832	CAT	2	6	887938	887943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_016832	TGA	2	6	889159	889164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_016832	GAT	2	6	889170	889175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_016832	AAT	2	6	889192	889197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016832	AT	3	6	889226	889231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_016832	T	7	7	889266	889272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_016832	CTT	2	6	890271	890276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_016832	TGG	2	6	890284	890289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_016832	A	6	6	890318	890323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_016832	T	7	7	890339	890345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_016832	AGCGC	2	10	896563	896572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2575	NC_016832	CG	3	6	897525	897530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_016832	A	9	9	897533	897541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_016832	GAT	2	6	897552	897557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_016832	CAC	2	6	897586	897591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_016832	CA	3	6	897615	897620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_016832	GAT	2	6	897641	897646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_016832	T	6	6	897747	897752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_016832	GTCA	2	8	897777	897784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2583	NC_016832	CGG	2	6	897785	897790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_016832	CAG	2	6	898671	898676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_016832	AATC	2	8	899623	899630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2586	NC_016832	T	6	6	899646	899651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_016832	A	6	6	899711	899716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_016832	T	7	7	899751	899757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016832	CAT	2	6	899768	899773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_016832	GATA	2	8	899803	899810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016832	CTTA	2	8	899811	899818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_016832	GTT	2	6	899829	899834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_016832	T	6	6	899864	899869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_016832	CG	3	6	901267	901272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_016832	TAT	2	6	901273	901278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_016832	T	6	6	901312	901317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016832	GGC	2	6	901345	901350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_016832	TTGA	2	8	902890	902897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_016832	TTG	2	6	902921	902926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_016832	TGATTT	2	12	903059	903070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_016832	A	6	6	903116	903121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_016832	GGAT	2	8	903218	903225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_016832	CCA	2	6	903272	903277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_016832	CGG	2	6	903417	903422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_016832	GGA	2	6	903453	903458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_016832	CGTC	2	8	903518	903525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_016832	CAT	2	6	903623	903628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_016832	GGC	2	6	903663	903668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_016832	CTG	2	6	903675	903680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_016832	GAT	2	6	903711	903716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_016832	ATCA	2	8	903717	903724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_016832	CTG	2	6	903750	903755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_016832	GCG	2	6	903763	903768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_016832	GA	3	6	903806	903811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_016832	TC	3	6	903830	903835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_016832	GCA	2	6	903842	903847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016832	CAT	2	6	903915	903920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_016832	AGC	2	6	903946	903951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_016832	GGC	2	6	904158	904163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_016832	GTT	2	6	904164	904169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_016832	GCT	2	6	904205	904210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_016832	ATA	2	6	904212	904217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_016832	TGG	2	6	904261	904266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_016832	A	7	7	904269	904275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_016832	G	7	7	904326	904332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_016832	ATT	2	6	904487	904492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_016832	ATCC	2	8	904510	904517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_016832	TGA	2	6	904604	904609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_016832	AG	3	6	904637	904642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_016832	T	6	6	904668	904673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_016832	TGT	2	6	904676	904681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_016832	TGT	3	9	904698	904706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_016832	GTA	2	6	904707	904712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_016832	TTCA	2	8	904732	904739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_016832	AT	3	6	904827	904832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_016832	TTTGAA	2	12	904847	904858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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