MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016832	GCT	2	6	480482	480487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016832	TGGT	2	8	480493	480500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016832	GC	3	6	480513	480518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_016832	GCC	2	6	480523	480528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_016832	GC	4	8	480538	480545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_016832	TCA	2	6	480567	480572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016832	TACTG	2	10	481903	481912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_016832	GCGG	2	8	481933	481940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_016832	TTCT	2	8	482209	482216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_016832	AT	3	6	482222	482227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016832	GCAG	2	8	482245	482252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_016832	TAC	2	6	482300	482305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016832	TTTG	2	8	482316	482323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016832	TATCG	2	10	484155	484164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_016832	ACG	2	6	484176	484181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016832	TGA	2	6	484187	484192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016832	TTTCA	2	10	484206	484215	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1518	NC_016832	T	6	6	484242	484247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016832	CCAA	2	8	485218	485225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_016832	TTAA	2	8	485228	485235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016832	AAAG	2	8	485238	485245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016832	CGCTT	2	10	485847	485856	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1523	NC_016832	AGG	2	6	485914	485919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016832	GCGCC	2	10	486887	486896	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1525	NC_016832	T	7	7	486943	486949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016832	TTA	2	6	486997	487002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016832	TCC	2	6	487864	487869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_016832	CGC	2	6	487873	487878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_016832	GGGA	2	8	487882	487889	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016832	ATC	2	6	487917	487922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_016832	TA	3	6	487929	487934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016832	ATG	2	6	487967	487972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016832	TCG	2	6	492861	492866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016832	AAT	2	6	493262	493267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016832	TAA	2	6	493294	493299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016832	CTG	2	6	495401	495406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016832	GGC	2	6	496616	496621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016832	A	8	8	496634	496641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016832	TTC	2	6	496660	496665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_016832	TCT	2	6	497191	497196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_016832	A	7	7	498997	499003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016832	GGC	2	6	499313	499318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016832	AGGTG	2	10	499567	499576	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016832	A	6	6	499596	499601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016832	T	6	6	499618	499623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016832	CCAG	2	8	500666	500673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_016832	AAT	2	6	500717	500722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016832	CGC	2	6	500832	500837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016832	GCG	2	6	500840	500845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016832	TAC	2	6	500881	500886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016832	GC	3	6	500905	500910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_016832	TGG	2	6	500945	500950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016832	TTAT	2	8	500971	500978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016832	TGC	2	6	501878	501883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016832	GTG	2	6	501949	501954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016832	AAC	2	6	501967	501972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_016832	T	6	6	503018	503023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016832	TA	3	6	506343	506348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016832	ATCT	2	8	507290	507297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_016832	GT	3	6	507302	507307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016832	ATT	2	6	508133	508138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016832	TTAA	2	8	508145	508152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016832	GCAA	2	8	508201	508208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_016832	TGA	2	6	508277	508282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016832	CGG	2	6	511705	511710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016832	GTC	2	6	511712	511717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016832	AGCGC	2	10	511731	511740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_016832	A	6	6	511795	511800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016832	T	6	6	511816	511821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016832	TGG	2	6	511826	511831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016832	GTG	2	6	511905	511910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016832	TGA	2	6	511913	511918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016832	CCG	2	6	511929	511934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_016832	CCT	2	6	511939	511944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_016832	GTG	2	6	512022	512027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016832	TGA	2	6	512030	512035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016832	CCG	2	6	512046	512051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_016832	CCT	2	6	512056	512061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_016832	CGG	2	6	512121	512126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_016832	AGT	2	6	512138	512143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016832	TGG	2	6	512144	512149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016832	TGA	2	6	512151	512156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016832	CCG	2	6	512167	512172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_016832	CCT	2	6	512177	512182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_016832	TG	3	6	512224	512229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016832	TGTT	2	8	512283	512290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016832	CGT	2	6	512291	512296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016832	GGCAG	2	10	513916	513925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_016832	TAT	2	6	513938	513943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016832	ACT	2	6	514783	514788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_016832	ATG	2	6	514888	514893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016832	GCATG	2	10	514954	514963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1593	NC_016832	CCA	2	6	514995	515000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_016832	GCATG	2	10	515072	515081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_016832	CCA	2	6	515113	515118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_016832	CGTT	2	8	515198	515205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_016832	GCT	2	6	515210	515215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016832	TTA	2	6	515266	515271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016832	TA	3	6	515283	515288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016832	ATG	2	6	515289	515294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016832	A	7	7	517506	517512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016832	AC	4	8	518828	518835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_016832	TAA	2	6	518838	518843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016832	TACTG	2	10	518888	518897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_016832	ATGAAA	2	12	518901	518912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016832	TGAC	2	8	519097	519104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_016832	AGC	2	6	519120	519125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_016832	GCG	2	6	519132	519137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016832	CAG	2	6	520387	520392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_016832	TC	3	6	520729	520734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_016832	T	6	6	520831	520836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016832	TGC	2	6	524980	524985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016832	TGA	2	6	525016	525021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016832	GTT	3	9	525056	525064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016832	AGT	2	6	525115	525120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016832	AGA	2	6	525121	525126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016832	CGG	2	6	526099	526104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016832	GT	3	6	526132	526137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016832	TCA	2	6	526164	526169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_016832	T	8	8	526218	526225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016832	ACTG	2	8	526255	526262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_016832	ATT	2	6	526264	526269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016832	TCA	2	6	526316	526321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_016832	ATT	2	6	526537	526542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016832	TCG	2	6	526571	526576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_016832	ATG	2	6	526618	526623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016832	ATTT	2	8	526626	526633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016832	GTT	2	6	526673	526678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016832	TCG	2	6	526687	526692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_016832	A	6	6	526695	526700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016832	GAA	2	6	526724	526729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016832	CCA	2	6	526756	526761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_016832	T	6	6	528083	528088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016832	TTA	2	6	528148	528153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_016832	GGA	2	6	528786	528791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1949	NC_016832	TAA	2	6	668872	668877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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