MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016832	GCC	2	6	4472081	4472086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14502	NC_016832	CGTG	2	8	4472130	4472137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14503	NC_016832	AT	3	6	4472173	4472178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_016832	AGC	2	6	4472295	4472300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_016832	GCC	3	9	4472309	4472317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_016832	CGC	2	6	4472383	4472388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_016832	CCAG	2	8	4472393	4472400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14508	NC_016832	CTG	2	6	4472452	4472457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_016832	AGCC	2	8	4472539	4472546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_016832	CTC	2	6	4472656	4472661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14511	NC_016832	CGG	2	6	4472708	4472713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_016832	T	6	6	4472716	4472721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_016832	AGA	2	6	4472735	4472740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_016832	GCG	2	6	4472828	4472833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_016832	GTT	2	6	4472902	4472907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_016832	CAT	2	6	4473004	4473009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_016832	CGG	2	6	4473017	4473022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_016832	GTTGCT	2	12	4473031	4473042	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14519	NC_016832	CAC	2	6	4473049	4473054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14520	NC_016832	GAA	2	6	4473106	4473111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_016832	GCG	2	6	4473124	4473129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_016832	TTG	2	6	4473182	4473187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_016832	GC	3	6	4473200	4473205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14524	NC_016832	CTC	2	6	4473211	4473216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_016832	ACC	2	6	4473252	4473257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14526	NC_016832	CGG	2	6	4473317	4473322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_016832	GCG	2	6	4473331	4473336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_016832	GCA	2	6	4473383	4473388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_016832	TCT	2	6	4473413	4473418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_016832	CAT	2	6	4473426	4473431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_016832	CCTGAT	2	12	4473510	4473521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_016832	CAG	2	6	4473538	4473543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_016832	T	6	6	4473639	4473644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_016832	CAG	2	6	4473703	4473708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_016832	AAT	2	6	4473748	4473753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_016832	GCT	3	9	4473774	4473782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_016832	CG	3	6	4473783	4473788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14538	NC_016832	GAA	2	6	4473856	4473861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_016832	CTGCTC	2	12	4473904	4473915	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14540	NC_016832	CCG	2	6	4473972	4473977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14541	NC_016832	T	7	7	4474000	4474006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_016832	GCG	2	6	4474028	4474033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_016832	GCC	2	6	4474045	4474050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_016832	GGT	2	6	4474051	4474056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_016832	TAATG	2	10	4474064	4474073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_016832	AAG	2	6	4476008	4476013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_016832	CGG	2	6	4476016	4476021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_016832	GTT	2	6	4476041	4476046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_016832	TA	3	6	4477440	4477445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_016832	GTG	2	6	4477491	4477496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_016832	GCGAT	2	10	4477500	4477509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14552	NC_016832	TTA	2	6	4477518	4477523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_016832	CAG	2	6	4477547	4477552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14554	NC_016832	CTG	2	6	4477617	4477622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_016832	TGGC	2	8	4477667	4477674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14556	NC_016832	GGC	2	6	4479130	4479135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_016832	GGC	2	6	4479141	4479146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_016832	TAA	2	6	4479181	4479186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_016832	AAAG	2	8	4479423	4479430	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_016832	CTT	2	6	4479473	4479478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_016832	GCA	2	6	4479511	4479516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_016832	TC	3	6	4479519	4479524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14563	NC_016832	GCA	2	6	4479578	4479583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_016832	TGTA	2	8	4479603	4479610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_016832	TA	3	6	4479609	4479614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_016832	AGT	2	6	4479705	4479710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_016832	GGC	2	6	4479834	4479839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_016832	TCC	2	6	4479993	4479998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14569	NC_016832	T	6	6	4480008	4480013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_016832	A	6	6	4480034	4480039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_016832	GTT	2	6	4480042	4480047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_016832	ATT	2	6	4480048	4480053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_016832	ATC	2	6	4480107	4480112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_016832	TTCTG	2	10	4480125	4480134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14575	NC_016832	G	6	6	4482170	4482175	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_016832	AGGG	2	8	4482186	4482193	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_016832	AT	3	6	4482282	4482287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_016832	TC	3	6	4486457	4486462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14579	NC_016832	ATG	2	6	4488377	4488382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14581	NC_016832	TTA	2	6	4494975	4494980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14583	NC_016832	AT	3	6	4495128	4495133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_016832	AAT	2	6	4495158	4495163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_016832	TC	3	6	4495413	4495418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14586	NC_016832	CAC	2	6	4495438	4495443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14587	NC_016832	TGAC	2	8	4495452	4495459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14588	NC_016832	ATA	2	6	4495467	4495472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_016832	ATT	2	6	4495575	4495580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_016832	TTA	2	6	4495581	4495586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_016832	A	6	6	4495605	4495610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_016832	CAAA	2	8	4495648	4495655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14593	NC_016832	CTT	2	6	4495684	4495689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_016832	AAT	2	6	4495691	4495696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_016832	CAG	2	6	4495699	4495704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14597	NC_016832	TAAC	2	8	4495840	4495847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14598	NC_016832	ATT	2	6	4495854	4495859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_016832	ACA	2	6	4495903	4495908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_016832	TTGT	2	8	4495938	4495945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_016832	A	6	6	4495953	4495958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_016832	T	6	6	4496018	4496023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_016832	A	6	6	4496039	4496044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_016832	AAT	2	6	4496090	4496095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_016832	GTTA	2	8	4496220	4496227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_016832	T	8	8	4496526	4496533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_016832	AAAT	2	8	4499709	4499716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_016832	A	6	6	4499731	4499736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_016832	CA	3	6	4499807	4499812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14610	NC_016832	TG	4	8	4499816	4499823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_016832	TAA	3	9	4499827	4499835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_016832	CAA	2	6	4500913	4500918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_016832	GTG	2	6	4501048	4501053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_016832	CTAT	2	8	4501075	4501082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14615	NC_016832	GTTCG	2	10	4501192	4501201	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14616	NC_016832	TGT	2	6	4501255	4501260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_016832	ACA	2	6	4501290	4501295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_016832	TAT	2	6	4502081	4502086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_016832	GTT	2	6	4502104	4502109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_016832	AT	3	6	4502131	4502136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_016832	TCA	2	6	4502165	4502170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_016832	ATT	2	6	4502225	4502230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_016832	ATT	2	6	4502712	4502717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_016832	ATC	2	6	4502737	4502742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_016832	AGA	2	6	4502743	4502748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_016832	AGC	2	6	4502751	4502756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_016832	AGC	2	6	4502826	4502831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14629	NC_016832	GTTTG	2	10	4502905	4502914	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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