MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016832	TTATT	2	10	389573	389582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016832	ATT	2	6	389614	389619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016832	AAAT	2	8	389638	389645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016832	TATT	2	8	389660	389667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016832	CTTTT	2	10	389700	389709	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_016832	AT	3	6	389715	389720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016832	GTTA	2	8	389729	389736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016832	ATC	2	6	389750	389755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016832	ATA	2	6	389759	389764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016832	AGC	2	6	389774	389779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016832	TTTA	2	8	389783	389790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016832	ACA	2	6	389791	389796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016832	CTC	2	6	389908	389913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_016832	CCTG	2	8	389914	389921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_016832	A	6	6	389942	389947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016832	GAA	2	6	389948	389953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016832	ACT	2	6	389994	389999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016832	TTA	2	6	390000	390005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016832	TCA	2	6	390089	390094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016832	GGC	2	6	390164	390169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_016832	ATT	2	6	390192	390197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016832	A	6	6	390219	390224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016832	AGA	2	6	390259	390264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016832	GCT	2	6	390316	390321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_016832	GGC	2	6	390323	390328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016832	CG	3	6	390354	390359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_016832	GAA	2	6	390473	390478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016832	CG	4	8	390484	390491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_016832	GCTG	2	8	390513	390520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_016832	TAC	2	6	390563	390568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1032	NC_016832	ATA	2	6	390696	390701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016832	CGC	2	6	390744	390749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_016832	GGC	2	6	390751	390756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016832	TCA	2	6	390834	390839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016832	CCA	2	6	390897	390902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_016832	CAT	2	6	390992	390997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016832	ATT	2	6	391004	391009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016832	CGC	2	6	391036	391041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_016832	GGT	2	6	391060	391065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016832	CAA	2	6	391090	391095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016832	CCTG	2	8	391118	391125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_016832	GCGCA	2	10	391145	391154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_016832	GTG	2	6	391223	391228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016832	CAG	2	6	391241	391246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1047	NC_016832	ACA	2	6	391272	391277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016832	GC	3	6	391317	391322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_016832	GTG	2	6	391343	391348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016832	TGG	2	6	391407	391412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016832	A	6	6	391451	391456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016832	CAC	2	6	391480	391485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_016832	AAG	2	6	391521	391526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_016832	GCC	2	6	391673	391678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_016832	AGA	2	6	391702	391707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016832	TAA	2	6	391723	391728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016832	CTG	2	6	391742	391747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016832	AGC	2	6	391788	391793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016832	GAA	2	6	391799	391804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016832	GC	3	6	391866	391871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016832	GGC	2	6	391921	391926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_016832	GCC	2	6	391937	391942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_016832	CG	3	6	393082	393087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_016832	CCG	2	6	399598	399603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1068	NC_016832	TGC	2	6	399639	399644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1071	NC_016832	AGC	2	6	399733	399738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016832	GCC	2	6	399769	399774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1077	NC_016832	CG	3	6	399932	399937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_016832	GCC	2	6	399963	399968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1081	NC_016832	TCG	2	6	400054	400059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_016832	CGGGC	2	10	400527	400536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1099	NC_016832	TCC	2	6	400917	400922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1102	NC_016832	CGA	2	6	401195	401200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016832	AGA	2	6	401218	401223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016832	CGG	2	6	401285	401290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016832	GTG	2	6	401385	401390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_016832	GTG	2	6	401487	401492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016832	GCT	2	6	401519	401524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016832	GCG	2	6	401617	401622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016832	CTG	3	9	401643	401651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1114	NC_016832	TC	3	6	401816	401821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_016832	A	6	6	401908	401913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_016832	CCA	2	6	402241	402246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_016832	GGC	2	6	402332	402337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_016832	GC	4	8	402384	402391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_016832	CGG	3	9	402418	402426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_016832	CG	3	6	402451	402456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_016832	CGC	2	6	402479	402484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_016832	GCAC	2	8	402508	402515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_016832	ATTA	2	8	402531	402538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016832	GCG	2	6	402610	402615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016832	TTGCC	2	10	402638	402647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1130	NC_016832	GGTGAA	2	12	402728	402739	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016832	CGG	2	6	402841	402846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1133	NC_016832	CGG	2	6	402890	402895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_016832	ATC	2	6	402921	402926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_016832	CGG	2	6	402970	402975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_016832	CGG	2	6	403087	403092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_016832	GTG	2	6	403101	403106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_016832	GTCATC	2	12	408714	408725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_016832	TAC	2	6	408777	408782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_016832	ATC	2	6	408829	408834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_016832	CAA	2	6	408846	408851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1286	NC_016832	AAC	2	6	409522	409527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1288	NC_016832	GCG	2	6	409598	409603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1289	NC_016832	GCG	2	6	409676	409681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1395	NC_016832	T	8	8	429147	429154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_016832	TAA	2	6	431695	431700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_016832	TGT	2	6	433183	433188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_016832	ATA	2	6	447266	447271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_016832	TTG	2	6	447325	447330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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