MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016832	TAA	2	6	219705	219710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016832	AG	3	6	219755	219760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016832	CAT	2	6	219782	219787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016832	CGC	2	6	219791	219796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_016832	AACG	2	8	220795	220802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_016832	ACGC	2	8	221396	221403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
507	NC_016832	TAA	2	6	221416	221421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016832	GA	3	6	225255	225260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016832	TCT	3	9	225263	225271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016832	GTC	2	6	225272	225277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016832	GAA	2	6	225283	225288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016832	TCC	2	6	227962	227967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_016832	ATAA	2	8	227968	227975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016832	TTA	2	6	227990	227995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016832	CCTT	2	8	227998	228005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_016832	GTT	2	6	228014	228019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016832	CGA	2	6	228065	228070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016832	TGC	2	6	228085	228090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_016832	TAA	3	9	228096	228104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016832	TCA	2	6	228130	228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016832	CTC	2	6	228176	228181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_016832	GTA	2	6	228201	228206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016832	TGTC	2	8	228226	228233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_016832	GGC	2	6	228242	228247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016832	AGA	2	6	228260	228265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016832	CGC	2	6	228329	228334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_016832	ACC	2	6	228351	228356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_016832	A	6	6	228376	228381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016832	GGT	2	6	228398	228403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016832	AGATGC	2	12	228415	228426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
531	NC_016832	CAGT	2	8	228435	228442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_016832	AAG	2	6	228445	228450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016832	ATCC	2	8	228612	228619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_016832	GTTGA	2	10	228632	228641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016832	ACT	2	6	228716	228721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016832	GAAA	2	8	228730	228737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016832	TTCAA	2	10	228738	228747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
538	NC_016832	GGAC	2	8	228753	228760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
539	NC_016832	GC	3	6	228839	228844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_016832	AGC	2	6	228855	228860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_016832	TGA	2	6	228916	228921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016832	GAAC	2	8	228955	228962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_016832	CTA	2	6	228973	228978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016832	GGCT	2	8	228980	228987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_016832	ACA	2	6	229062	229067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016832	TGG	2	6	229089	229094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016832	A	6	6	229173	229178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016832	GCG	2	6	229199	229204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016832	ATGCGT	2	12	229337	229348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
550	NC_016832	GC	3	6	229374	229379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_016832	CGG	2	6	229426	229431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016832	AAAC	2	8	229460	229467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_016832	GGAAT	2	10	229492	229501	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016832	CGG	2	6	229519	229524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016832	AT	3	6	229588	229593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016832	ACC	2	6	229605	229610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_016832	GTT	3	9	229793	229801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016832	CCG	2	6	229842	229847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016832	CCAA	2	8	229850	229857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_016832	AGC	2	6	229918	229923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016832	CGT	2	6	230034	230039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016832	GCAGC	2	10	230151	230160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
563	NC_016832	GATG	2	8	230164	230171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016832	GTC	2	6	230174	230179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016832	TAA	2	6	230233	230238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016832	GCT	2	6	230265	230270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016832	GGC	2	6	234140	234145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016832	GTAAGC	2	12	234187	234198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_016832	TCT	2	6	235662	235667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016832	CCA	2	6	242945	242950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_016832	CTT	2	6	242996	243001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016832	TGCTC	2	10	243057	243066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
573	NC_016832	AGG	2	6	243069	243074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016832	CGG	2	6	244241	244246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016832	CGCTT	2	10	244247	244256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
576	NC_016832	AC	3	6	244317	244322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016832	TCA	2	6	244724	244729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016832	AAT	2	6	244744	244749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016832	CCA	2	6	244771	244776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_016832	A	7	7	244785	244791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016832	AGA	2	6	244806	244811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016832	GCG	2	6	244839	244844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016832	GTG	2	6	244992	244997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016832	TAT	2	6	245041	245046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016832	GC	3	6	245059	245064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_016832	G	6	6	246268	246273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016832	ATAA	2	8	247139	247146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016832	TGG	2	6	249850	249855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016832	AGT	2	6	249881	249886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016832	GAT	2	6	250752	250757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016832	AAT	2	6	250764	250769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016832	TCAG	2	8	250792	250799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_016832	T	6	6	250868	250873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016832	GCC	2	6	250921	250926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_016832	CAA	2	6	250970	250975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016832	AC	3	6	251040	251045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_016832	AAC	2	6	251078	251083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016832	AC	4	8	251082	251089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_016832	GGC	2	6	251948	251953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_016832	GTA	2	6	252061	252066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016832	GAG	2	6	253023	253028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016832	CTT	2	6	253043	253048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016832	CT	3	6	253056	253061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016832	GAAA	2	8	253151	253158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016832	TTA	2	6	253934	253939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016832	TG	3	6	253984	253989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016832	GTCTG	2	10	253993	254002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_016832	AGA	2	6	255943	255948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016832	T	6	6	256015	256020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016832	T	6	6	256050	256055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016832	A	6	6	256228	256233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016832	TGT	2	6	256241	256246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016832	TTAG	2	8	259238	259245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016832	GAA	2	6	259246	259251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016832	ATA	2	6	259255	259260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016832	TTA	2	6	263378	263383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016832	AGG	2	6	270905	270910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016832	T	6	6	270928	270933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016832	TTA	2	6	270992	270997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016832	AG	3	6	271588	271593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016832	GGA	2	6	271630	271635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016832	TATT	2	8	271636	271643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016832	GCAG	2	8	271741	271748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_016832	A	6	6	271784	271789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016832	GCCGC	2	10	271846	271855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
626	NC_016832	AGT	2	6	271864	271869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016832	GGC	2	6	271899	271904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016832	GC	3	6	272001	272006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_016832	GC	4	8	272079	272086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_016832	CGG	2	6	272132	272137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016832	CTA	2	6	272195	272200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_016832	GGC	2	6	272314	272319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016832	CTG	2	6	272485	272490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016832	TGG	2	6	272504	272509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016832	TCT	3	9	272540	272548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016832	GCC	2	6	272562	272567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_016832	ATC	2	6	272665	272670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016832	GGC	2	6	272674	272679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016832	GCG	3	9	272687	272695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_016832	CTA	2	6	272730	272735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_016832	GTGCCG	2	12	272761	272772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_016832	GGC	2	6	272818	272823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_016832	AGTT	2	8	272903	272910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
644	NC_016832	ATT	2	6	272969	272974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_016832	GTC	2	6	272986	272991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_016832	GAT	2	6	272992	272997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_016832	CG	3	6	273066	273071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
648	NC_016832	GCCGG	2	10	273076	273085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
649	NC_016832	CGAC	2	8	273134	273141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
650	NC_016832	GCC	2	6	273331	273336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_016832	ACC	2	6	273358	273363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_016832	AGC	3	9	273379	273387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_016832	TAA	2	6	273535	273540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_016832	T	6	6	273596	273601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_016832	GCGCT	2	10	277557	277566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
657	NC_016832	CAC	2	6	277614	277619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_016832	CAA	2	6	277627	277632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
659	NC_016832	CCT	2	6	278090	278095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
660	NC_016832	TCC	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
661	NC_016832	CT	3	6	280029	280034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
662	NC_016832	TAA	2	6	280625	280630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_016832	CAA	2	6	280751	280756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_016832	A	7	7	282536	282542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_016832	GC	3	6	283436	283441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
666	NC_016832	CGC	2	6	283489	283494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
667	NC_016832	AAC	2	6	283654	283659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_016832	ATA	2	6	283701	283706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_016832	AATG	2	8	283714	283721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
670	NC_016832	AAT	2	6	283787	283792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_016832	TGTGT	2	10	284659	284668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
672	NC_016832	TAT	2	6	286361	286366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_016832	AATGA	2	10	286370	286379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
674	NC_016832	ATCA	2	8	286454	286461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
675	NC_016832	CTG	2	6	286489	286494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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677	NC_016832	GGC	2	6	287516	287521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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685	NC_016832	GGA	2	6	287924	287929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_016832	AGCGC	2	10	292845	292854	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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771	NC_016832	ACCC	2	8	292958	292965	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
772	NC_016832	TA	3	6	293000	293005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_016832	AAT	2	6	293492	293497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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789	NC_016832	CAA	2	6	302897	302902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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791	NC_016832	AAT	2	6	302943	302948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_016832	AAGCG	2	10	357227	357236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
911	NC_016832	A	6	6	357362	357367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
912	NC_016832	TAAG	2	8	357393	357400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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