MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016832	CGA	2	6	2783033	2783038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_016832	CT	3	6	2783079	2783084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9003	NC_016832	GAA	2	6	2783124	2783129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_016832	ATT	2	6	2783145	2783150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_016832	G	6	6	2783186	2783191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_016832	AAC	2	6	2784324	2784329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_016832	T	6	6	2785332	2785337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_016832	TC	3	6	2785384	2785389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_016832	TCA	2	6	2785405	2785410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_016832	TCA	2	6	2785430	2785435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_016832	AAT	2	6	2785463	2785468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_016832	GAA	2	6	2786782	2786787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_016832	TC	3	6	2786953	2786958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9014	NC_016832	T	6	6	2786963	2786968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_016832	GGC	2	6	2787014	2787019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_016832	TAA	2	6	2787103	2787108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_016832	TAA	2	6	2787730	2787735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_016832	CTG	2	6	2787765	2787770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_016832	ACA	2	6	2787780	2787785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_016832	AAT	2	6	2787805	2787810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_016832	AAC	2	6	2787823	2787828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_016832	T	6	6	2790586	2790591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_016832	CAA	2	6	2790599	2790604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_016832	TAG	2	6	2792040	2792045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_016832	TTA	2	6	2792053	2792058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_016832	ATTA	2	8	2792093	2792100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_016832	CCG	2	6	2792782	2792787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_016832	TAA	2	6	2792825	2792830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_016832	T	6	6	2792854	2792859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_016832	ATC	3	9	2792922	2792930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_016832	TAA	2	6	2794571	2794576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_016832	GGC	2	6	2794590	2794595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_016832	GGA	2	6	2795855	2795860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_016832	TCCT	2	8	2795909	2795916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_016832	GGA	2	6	2795989	2795994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_016832	CTG	2	6	2796073	2796078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_016832	GGA	2	6	2796128	2796133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_016832	TCCT	2	8	2796182	2796189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_016832	GGA	2	6	2796262	2796267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_016832	GGA	2	6	2796401	2796406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_016832	ACTT	2	8	2796475	2796482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9042	NC_016832	GGA	2	6	2796540	2796545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_016832	CAC	2	6	2796699	2796704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_016832	GAA	2	6	2796725	2796730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_016832	TCG	2	6	2796744	2796749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_016832	A	6	6	2796844	2796849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_016832	TGA	2	6	2796881	2796886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_016832	GCC	2	6	2796894	2796899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_016832	A	6	6	2796929	2796934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_016832	GCGA	2	8	2796955	2796962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_016832	AG	3	6	2796965	2796970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_016832	TC	3	6	2797224	2797229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_016832	CAT	2	6	2797247	2797252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_016832	CGC	2	6	2797387	2797392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_016832	GCG	2	6	2797403	2797408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_016832	AACG	2	8	2797411	2797418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9057	NC_016832	GCC	2	6	2800093	2800098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_016832	TCG	2	6	2800192	2800197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_016832	ATAAG	2	10	2800248	2800257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_016832	A	6	6	2800793	2800798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_016832	GGC	2	6	2800871	2800876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_016832	CCA	2	6	2800892	2800897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_016832	TGA	2	6	2800903	2800908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_016832	A	6	6	2802646	2802651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_016832	CAG	2	6	2802655	2802660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_016832	TTAT	2	8	2802662	2802669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_016832	GA	3	6	2802733	2802738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_016832	A	7	7	2802756	2802762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_016832	GCACA	2	10	2802771	2802780	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9070	NC_016832	AAAC	2	8	2802786	2802793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9071	NC_016832	AT	3	6	2802856	2802861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_016832	GTC	2	6	2802863	2802868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_016832	CGG	2	6	2802890	2802895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_016832	A	6	6	2802944	2802949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_016832	G	6	6	2802992	2802997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_016832	CTCCC	2	10	2802998	2803007	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9077	NC_016832	C	6	6	2804146	2804151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9078	NC_016832	CT	3	6	2804194	2804199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_016832	CTC	2	6	2804214	2804219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9080	NC_016832	GA	3	6	2804343	2804348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_016832	A	6	6	2806262	2806267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_016832	CGC	2	6	2807092	2807097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_016832	ACA	2	6	2807109	2807114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_016832	AAT	2	6	2807540	2807545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_016832	GGC	2	6	2807560	2807565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_016832	CAT	2	6	2810978	2810983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_016832	ATT	2	6	2811017	2811022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_016832	AAC	2	6	2811079	2811084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_016832	TGAA	2	8	2811098	2811105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_016832	GGT	2	6	2811110	2811115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_016832	GCC	2	6	2813767	2813772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9092	NC_016832	GTG	2	6	2816862	2816867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_016832	AGCC	2	8	2816886	2816893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9094	NC_016832	ATCC	2	8	2817727	2817734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9095	NC_016832	CT	3	6	2821657	2821662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9096	NC_016832	AAG	3	9	2826247	2826255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_016832	GCA	2	6	2829544	2829549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_016832	GCG	2	6	2829576	2829581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_016832	GT	3	6	2829641	2829646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_016832	GAT	2	6	2831859	2831864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_016832	GC	3	6	2831865	2831870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_016832	CT	3	6	2832241	2832246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_016832	ATTT	2	8	2832263	2832270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_016832	TCG	2	6	2832306	2832311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_016832	ATT	2	6	2832329	2832334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_016832	TA	3	6	2832357	2832362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_016832	GAT	2	6	2832383	2832388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_016832	TTG	2	6	2832401	2832406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_016832	CAG	2	6	2835850	2835855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_016832	AAAT	2	8	2835864	2835871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_016832	GTA	2	6	2835881	2835886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_016832	TGT	2	6	2835904	2835909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_016832	AGC	2	6	2835924	2835929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_016832	ACA	2	6	2835947	2835952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_016832	GCT	2	6	2835966	2835971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9117	NC_016832	ATT	2	6	2836035	2836040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_016832	A	6	6	2836067	2836072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_016832	AG	3	6	2836098	2836103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_016832	A	6	6	2836116	2836121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_016832	T	6	6	2836892	2836897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_016832	TTC	2	6	2836928	2836933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_016832	ACT	2	6	2836941	2836946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_016832	TAC	2	6	2836969	2836974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_016832	TAA	2	6	2836980	2836985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_016832	TTA	2	6	2836997	2837002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_016832	TTTAC	2	10	2837067	2837076	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9128	NC_016832	ATGT	2	8	2837120	2837127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_016832	A	7	7	2837206	2837212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_016832	AAT	2	6	2837252	2837257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9132	NC_016832	AAT	2	6	2838206	2838211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9260	NC_016832	GCG	2	6	2885331	2885336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9273	NC_016832	T	6	6	2899385	2899390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9274	NC_016832	TGAA	2	8	2899433	2899440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9283	NC_016832	TACC	2	8	2907112	2907119	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9342	NC_016832	AT	3	6	2922986	2922991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9391	NC_016832	CCAT	2	8	2930883	2930890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9394	NC_016832	ATG	2	6	2931810	2931815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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