MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016832	GC	3	6	2656319	2656324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8502	NC_016832	GC	3	6	2656333	2656338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8503	NC_016832	GGC	2	6	2656340	2656345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_016832	CAA	2	6	2656460	2656465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_016832	ACC	2	6	2656479	2656484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8506	NC_016832	GCG	2	6	2656545	2656550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_016832	GCC	2	6	2656554	2656559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_016832	CCG	2	6	2656567	2656572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8509	NC_016832	GCG	2	6	2656624	2656629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_016832	GCA	2	6	2656648	2656653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_016832	TGCGC	2	10	2656684	2656693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8512	NC_016832	CGC	2	6	2656705	2656710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8513	NC_016832	GC	3	6	2656721	2656726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8514	NC_016832	ATCA	2	8	2656742	2656749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8515	NC_016832	ACC	2	6	2656768	2656773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_016832	GCC	2	6	2656790	2656795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8517	NC_016832	CAG	2	6	2656865	2656870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_016832	ACC	2	6	2656902	2656907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_016832	GCCA	2	8	2656957	2656964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8520	NC_016832	CG	3	6	2657071	2657076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8521	NC_016832	GCA	2	6	2657092	2657097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_016832	GTT	2	6	2657098	2657103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_016832	CAG	2	6	2657156	2657161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_016832	GCG	2	6	2657194	2657199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_016832	CAG	2	6	2657225	2657230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_016832	GAT	2	6	2657273	2657278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_016832	CAC	2	6	2657336	2657341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_016832	ACCAG	2	10	2657401	2657410	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8529	NC_016832	CCAGAA	2	12	2657416	2657427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_016832	GC	4	8	2657443	2657450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8531	NC_016832	A	6	6	2657455	2657460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_016832	AAT	2	6	2657503	2657508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_016832	TAAT	2	8	2657555	2657562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_016832	A	8	8	2657565	2657572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_016832	ATA	2	6	2657592	2657597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_016832	GT	3	6	2657634	2657639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_016832	TC	3	6	2657645	2657650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_016832	ATT	2	6	2657670	2657675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_016832	ACC	2	6	2662150	2662155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8540	NC_016832	CATT	2	8	2662170	2662177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_016832	TTA	2	6	2662743	2662748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_016832	ATT	2	6	2662871	2662876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_016832	TA	3	6	2662961	2662966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_016832	TA	3	6	2663408	2663413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_016832	TA	3	6	2663453	2663458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_016832	AC	3	6	2663467	2663472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_016832	ATC	2	6	2663486	2663491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_016832	A	8	8	2663535	2663542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_016832	GCA	2	6	2663544	2663549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_016832	TGC	2	6	2663646	2663651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_016832	TA	3	6	2663675	2663680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_016832	AC	3	6	2663697	2663702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_016832	TGG	2	6	2663706	2663711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_016832	AT	3	6	2663766	2663771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_016832	ATT	2	6	2663791	2663796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_016832	AAAT	2	8	2663809	2663816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_016832	GAA	2	6	2663907	2663912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_016832	CGT	2	6	2663918	2663923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_016832	CCA	2	6	2663951	2663956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_016832	CAGC	2	8	2663969	2663976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8561	NC_016832	GAC	2	6	2663978	2663983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_016832	GAG	2	6	2664001	2664006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_016832	CATT	2	8	2664040	2664047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8564	NC_016832	GTTAGC	2	12	2664165	2664176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8565	NC_016832	GTA	2	6	2664192	2664197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_016832	GGC	2	6	2664234	2664239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_016832	CGG	2	6	2664301	2664306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_016832	TCGG	2	8	2664322	2664329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8569	NC_016832	CGC	2	6	2664344	2664349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8570	NC_016832	CACCG	2	10	2664387	2664396	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8571	NC_016832	TCT	2	6	2664520	2664525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_016832	GGTT	2	8	2664548	2664555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_016832	AGT	2	6	2664821	2664826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_016832	CGC	2	6	2664854	2664859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8575	NC_016832	TCG	2	6	2664991	2664996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_016832	AAT	2	6	2665113	2665118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_016832	GCC	2	6	2665213	2665218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_016832	CCG	2	6	2666291	2666296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8579	NC_016832	CAC	2	6	2666328	2666333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8580	NC_016832	AAT	2	6	2669030	2669035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_016832	AT	3	6	2669052	2669057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_016832	TTA	2	6	2669068	2669073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_016832	AAACA	2	10	2669094	2669103	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8584	NC_016832	AAT	2	6	2669149	2669154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_016832	AAC	2	6	2669160	2669165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_016832	ATA	2	6	2669199	2669204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_016832	A	6	6	2669209	2669214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_016832	ACA	2	6	2669228	2669233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_016832	ACG	2	6	2669242	2669247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_016832	ATA	2	6	2669251	2669256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_016832	TCA	2	6	2669266	2669271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_016832	ATT	2	6	2669300	2669305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_016832	TCC	2	6	2669331	2669336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8594	NC_016832	AAAT	2	8	2669341	2669348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_016832	ATT	2	6	2671578	2671583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_016832	AAG	2	6	2675677	2675682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_016832	CTT	2	6	2675753	2675758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_016832	A	8	8	2675766	2675773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_016832	T	7	7	2675799	2675805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_016832	ACGG	2	8	2675852	2675859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8601	NC_016832	CAGG	2	8	2675887	2675894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8602	NC_016832	TGC	2	6	2676004	2676009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_016832	GAT	2	6	2676025	2676030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_016832	ATT	2	6	2678052	2678057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_016832	GTC	2	6	2678868	2678873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_016832	AC	4	8	2678890	2678897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_016832	GCAC	2	8	2678978	2678985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_016832	CGA	2	6	2680273	2680278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_016832	GCA	2	6	2681125	2681130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_016832	TTC	2	6	2682019	2682024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_016832	CACT	2	8	2682042	2682049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8612	NC_016832	GTTT	2	8	2682067	2682074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_016832	AAT	2	6	2682095	2682100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_016832	CAG	2	6	2683291	2683296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_016832	TGC	2	6	2683365	2683370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_016832	AAT	2	6	2685225	2685230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_016832	TAA	2	6	2685277	2685282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_016832	ACGG	2	8	2685291	2685298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8619	NC_016832	CAGG	2	8	2685326	2685333	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8620	NC_016832	ACC	2	6	2685508	2685513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8621	NC_016832	GCC	2	6	2685522	2685527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8622	NC_016832	TC	3	6	2685601	2685606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_016832	AC	3	6	2685688	2685693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8624	NC_016832	CGT	3	9	2685706	2685714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8626	NC_016832	C	6	6	2685892	2685897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8627	NC_016832	ACG	2	6	2685941	2685946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_016832	TGA	2	6	2686021	2686026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_016832	CCG	2	6	2686049	2686054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8631	NC_016832	CCT	2	6	2686218	2686223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8757	NC_016832	A	6	6	2712269	2712274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8758	NC_016832	T	6	6	2713993	2713998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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