MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016832	TAA	2	6	1892405	1892410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016832	ACA	2	6	1892468	1892473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016832	TTC	2	6	1892711	1892716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_016832	TAT	2	6	1892945	1892950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016832	ATTA	2	8	1892959	1892966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016832	AG	3	6	1892978	1892983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016832	T	6	6	1893691	1893696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016832	CCGT	2	8	1893706	1893713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_016832	TAA	2	6	1894970	1894975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016832	TCC	2	6	1894979	1894984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_016832	CT	3	6	1895021	1895026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_016832	TAA	2	6	1895617	1895622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016832	CA	3	6	1896026	1896031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_016832	CGG	3	9	1896061	1896069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016832	GCC	2	6	1896076	1896081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_016832	CAC	2	6	1896115	1896120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_016832	T	6	6	1896135	1896140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016832	CCA	2	6	1896198	1896203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_016832	CAGCT	2	10	1896277	1896286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6020	NC_016832	GCG	2	6	1896287	1896292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016832	CGC	2	6	1896401	1896406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_016832	CAT	2	6	1896417	1896422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016832	AGA	2	6	1896440	1896445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016832	CTT	2	6	1896464	1896469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016832	GAA	2	6	1896505	1896510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016832	CTGG	2	8	1896617	1896624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_016832	ATC	2	6	1896629	1896634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016832	TGTA	2	8	1898258	1898265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016832	ATT	2	6	1898852	1898857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016832	GC	3	6	1899565	1899570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_016832	T	7	7	1899573	1899579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016832	GCA	2	6	1899591	1899596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_016832	CGGG	2	8	1900112	1900119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6034	NC_016832	CCGC	2	8	1900128	1900135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6035	NC_016832	A	7	7	1902262	1902268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016832	GAT	2	6	1905618	1905623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016832	GATT	2	8	1905736	1905743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016832	T	8	8	1906278	1906285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016832	T	7	7	1906316	1906322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016832	ATC	2	6	1906372	1906377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016832	ATG	2	6	1906390	1906395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016832	T	6	6	1906411	1906416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016832	A	6	6	1907674	1907679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016832	T	6	6	1907695	1907700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016832	T	6	6	1908227	1908232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016832	GAA	2	6	1908241	1908246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016832	C	6	6	1908336	1908341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6048	NC_016832	ACA	2	6	1908346	1908351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016832	A	6	6	1908356	1908361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016832	AATAA	2	10	1910175	1910184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016832	TCC	2	6	1910836	1910841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_016832	TGG	2	6	1911010	1911015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016832	A	6	6	1911141	1911146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016832	AAC	2	6	1911157	1911162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_016832	ATT	2	6	1911226	1911231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016832	TTG	2	6	1918764	1918769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016832	CT	3	6	1920490	1920495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_016832	TTA	2	6	1920543	1920548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016832	AAT	2	6	1920553	1920558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016832	AAC	2	6	1920602	1920607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_016832	TAT	2	6	1921700	1921705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016832	AATA	2	8	1921742	1921749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016832	TCA	2	6	1921795	1921800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016832	A	7	7	1921807	1921813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016832	A	6	6	1924483	1924488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016832	CGAGAT	2	12	1924667	1924678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6067	NC_016832	TTA	2	6	1924685	1924690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016832	CCAT	2	8	1924726	1924733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_016832	CA	3	6	1924738	1924743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_016832	AACA	2	8	1924792	1924799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_016832	GACA	2	8	1924848	1924855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_016832	TA	3	6	1924878	1924883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016832	TGGC	2	8	1924891	1924898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_016832	AAGTA	2	10	1925261	1925270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_016832	AGCC	2	8	1925303	1925310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_016832	AT	3	6	1925434	1925439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016832	ATT	2	6	1925476	1925481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016832	AGT	2	6	1925488	1925493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016832	GAA	2	6	1925605	1925610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_016832	TAT	2	6	1925635	1925640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_016832	AAGT	2	8	1925644	1925651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016832	ATA	3	9	1925671	1925679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016832	AGTT	2	8	1925687	1925694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_016832	CTA	2	6	1925698	1925703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_016832	T	6	6	1925804	1925809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016832	CAT	2	6	1925824	1925829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6088	NC_016832	TAA	2	6	1925897	1925902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016832	ACA	2	6	1925903	1925908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_016832	GATT	2	8	1925921	1925928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_016832	TGA	2	6	1925951	1925956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016832	GTT	2	6	1926000	1926005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016832	ATT	2	6	1926056	1926061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016832	TGA	2	6	1926062	1926067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_016832	TTA	2	6	1926085	1926090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016832	CA	3	6	1926101	1926106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_016832	TAG	2	6	1926113	1926118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016832	ATA	2	6	1926141	1926146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016832	AATG	2	8	1926153	1926160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016832	TA	4	8	1926222	1926229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016832	ATC	2	6	1926315	1926320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_016832	CCT	2	6	1926322	1926327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_016832	CTTCA	2	10	1926330	1926339	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6104	NC_016832	CAT	2	6	1926382	1926387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016832	AAT	2	6	1926389	1926394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016832	AGCC	2	8	1926579	1926586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_016832	AGT	2	6	1926591	1926596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016832	AT	3	6	1926622	1926627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016832	TAAT	2	8	1926651	1926658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016832	TAA	2	6	1926668	1926673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016832	ATA	2	6	1926871	1926876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016832	TCAC	2	8	1926877	1926884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_016832	AGAAA	2	10	1926945	1926954	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016832	ATA	2	6	1927007	1927012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016832	AGT	2	6	1927018	1927023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_016832	T	6	6	1927023	1927028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016832	AGT	3	9	1927111	1927119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016832	CCT	2	6	1931403	1931408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_016832	CAC	2	6	1931413	1931418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_016832	ATCA	2	8	1931541	1931548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_016832	TGGT	2	8	1931624	1931631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016832	CAA	2	6	1932332	1932337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016832	A	7	7	1932408	1932414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016832	CGG	2	6	1932424	1932429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_016832	TGGTA	2	10	1932433	1932442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016832	GTC	2	6	1932466	1932471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_016832	TCA	2	6	1932480	1932485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_016832	ATCT	2	8	1932502	1932509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_016832	AGC	2	6	1932655	1932660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_016832	TC	3	6	1932712	1932717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6132	NC_016832	CTG	2	6	1932791	1932796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6392	NC_016832	A	6	6	2004851	2004856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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