MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016832	GTG	2	6	1725084	1725089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016832	GA	3	6	1725166	1725171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016832	GAG	2	6	1725201	1725206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016832	AAT	2	6	1725218	1725223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016832	AGC	2	6	1725244	1725249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_016832	GTG	2	6	1725266	1725271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016832	TTCGA	2	10	1725330	1725339	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5508	NC_016832	GC	3	6	1725385	1725390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_016832	CAC	2	6	1725412	1725417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_016832	CAT	2	6	1725418	1725423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_016832	TTCGA	2	10	1725511	1725520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5512	NC_016832	GA	3	6	1725529	1725534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016832	CAC	2	6	1725594	1725599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_016832	ATCA	2	8	1725627	1725634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_016832	CCG	2	6	1727441	1727446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_016832	GA	3	6	1727466	1727471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016832	TG	3	6	1734146	1734151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016832	CT	3	6	1734163	1734168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_016832	GC	3	6	1734260	1734265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_016832	GGA	3	9	1734288	1734296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016832	TA	4	8	1734305	1734312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016832	AAATT	2	10	1734332	1734341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016832	CAA	2	6	1734368	1734373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_016832	CT	3	6	1734438	1734443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_016832	TGT	2	6	1734459	1734464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_016832	A	8	8	1734479	1734486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016832	CGC	2	6	1734498	1734503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_016832	TTGAT	2	10	1735935	1735944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_016832	GTC	2	6	1736000	1736005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_016832	TTA	2	6	1736027	1736032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_016832	A	6	6	1736058	1736063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_016832	TGTC	2	8	1736086	1736093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_016832	CGG	2	6	1736123	1736128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016832	TTA	2	6	1741011	1741016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_016832	GAG	2	6	1741025	1741030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016832	GAAA	2	8	1741107	1741114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_016832	A	7	7	1741112	1741118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016832	A	6	6	1741142	1741147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_016832	A	7	7	1741153	1741159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016832	CTT	2	6	1741182	1741187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016832	ATAA	2	8	1742332	1742339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016832	TCC	2	6	1742343	1742348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_016832	CT	3	6	1742385	1742390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_016832	TAA	2	6	1742981	1742986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016832	GTTTTT	2	12	1743072	1743083	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016832	CTG	2	6	1744413	1744418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_016832	T	6	6	1744438	1744443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016832	CGC	2	6	1746004	1746009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5550	NC_016832	TATTT	2	10	1747201	1747210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_016832	TG	3	6	1749247	1749252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_016832	TTC	2	6	1749265	1749270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016832	TTA	2	6	1749297	1749302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016832	TTC	2	6	1751521	1751526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_016832	CCG	2	6	1752731	1752736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_016832	ACA	2	6	1755339	1755344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016832	TTA	2	6	1755345	1755350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016832	CAA	2	6	1755456	1755461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_016832	GGT	2	6	1755476	1755481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016832	GGT	2	6	1755519	1755524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016832	A	6	6	1757625	1757630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016832	GCC	2	6	1757646	1757651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_016832	ACA	2	6	1757666	1757671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_016832	CTT	2	6	1757687	1757692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_016832	GAC	2	6	1758895	1758900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5567	NC_016832	CGGAT	2	10	1758994	1759003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5568	NC_016832	T	7	7	1759026	1759032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_016832	TGT	2	6	1759051	1759056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5571	NC_016832	GCT	2	6	1759095	1759100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_016832	GA	3	6	1759121	1759126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5574	NC_016832	A	6	6	1759140	1759145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016832	AAG	2	6	1759188	1759193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5577	NC_016832	AAC	2	6	1761959	1761964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_016832	T	7	7	1761968	1761974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_016832	CGG	2	6	1766209	1766214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5585	NC_016832	A	6	6	1770794	1770799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_016832	GTTT	2	8	1771320	1771327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_016832	AG	3	6	1771335	1771340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_016832	TTA	2	6	1774141	1774146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5597	NC_016832	A	7	7	1774293	1774299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_016832	ATA	2	6	1778167	1778172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_016832	TTA	2	6	1778262	1778267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_016832	CAAG	2	8	1778475	1778482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_016832	CCG	2	6	1778509	1778514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_016832	CCG	2	6	1778535	1778540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_016832	TGCC	2	8	1778580	1778587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_016832	CGA	2	6	1778625	1778630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_016832	GGT	2	6	1778962	1778967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_016832	TGA	2	6	1778985	1778990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5616	NC_016832	A	6	6	1779282	1779287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016832	GCA	2	6	1779339	1779344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_016832	CG	4	8	1779359	1779366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_016832	ATAA	2	8	1779404	1779411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_016832	CTGG	2	8	1779586	1779593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_016832	ATG	2	6	1779672	1779677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5750	NC_016832	CGATC	2	10	1831578	1831587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5753	NC_016832	GCGG	2	8	1834287	1834294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5760	NC_016832	T	7	7	1835832	1835838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5761	NC_016832	GATT	2	8	1836329	1836336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5762	NC_016832	T	6	6	1836873	1836878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5765	NC_016832	TAA	2	6	1836976	1836981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5902	NC_016832	A	6	6	1870201	1870206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5903	NC_016832	ATG	2	6	1870267	1870272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5905	NC_016832	TAC	2	6	1873569	1873574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5906	NC_016832	GCGCT	2	10	1873587	1873596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5933	NC_016832	CTG	2	6	1877718	1877723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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