MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016832	GCA	2	6	1587368	1587373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_016832	ATT	2	6	1587412	1587417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016832	TTTTC	2	10	1587486	1587495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5004	NC_016832	CCA	2	6	1587597	1587602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_016832	ACC	2	6	1587611	1587616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_016832	TGTT	2	8	1587661	1587668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016832	ATTT	2	8	1587694	1587701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016832	TTA	2	6	1587715	1587720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016832	AT	3	6	1587767	1587772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016832	ATT	2	6	1587793	1587798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016832	AAC	2	6	1587833	1587838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016832	TGT	2	6	1587858	1587863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016832	ATAA	2	8	1587878	1587885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016832	ATAG	2	8	1587903	1587910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016832	GAT	2	6	1587990	1587995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016832	TGA	2	6	1588184	1588189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016832	CCT	2	6	1588201	1588206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_016832	TTACC	2	10	1588303	1588312	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5019	NC_016832	ATAG	2	8	1588320	1588327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016832	TTATTT	2	12	1591224	1591235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016832	ATT	2	6	1591261	1591266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016832	CAGTG	2	10	1592880	1592889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5023	NC_016832	ACTGCC	2	12	1592899	1592910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_016832	AGGT	2	8	1592970	1592977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016832	TAAA	2	8	1592983	1592990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016832	AAT	2	6	1593034	1593039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016832	AATA	2	8	1593055	1593062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016832	ATTGC	2	10	1593081	1593090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5029	NC_016832	TAT	2	6	1593091	1593096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016832	AT	3	6	1593108	1593113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016832	ATT	2	6	1593125	1593130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016832	TAA	2	6	1593144	1593149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016832	TAT	3	9	1593176	1593184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016832	TAAT	2	8	1593211	1593218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016832	ACTC	2	8	1593248	1593255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_016832	GTT	2	6	1593287	1593292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016832	ATT	2	6	1593309	1593314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016832	GA	3	6	1593319	1593324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016832	TTTAT	2	10	1594074	1594083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016832	TCC	2	6	1594128	1594133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_016832	TGAA	2	8	1594801	1594808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016832	ACA	2	6	1594821	1594826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016832	TCA	2	6	1594848	1594853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_016832	TGG	2	6	1594865	1594870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016832	TCC	2	6	1595712	1595717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_016832	TCG	2	6	1595757	1595762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016832	T	7	7	1599746	1599752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016832	GTT	2	6	1599755	1599760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016832	AAT	2	6	1599762	1599767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016832	AT	3	6	1599785	1599790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016832	CAA	2	6	1599827	1599832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_016832	ACG	2	6	1600880	1600885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_016832	GGCA	2	8	1600896	1600903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_016832	A	7	7	1601048	1601054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016832	GCC	2	6	1604351	1604356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_016832	CGT	2	6	1604373	1604378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_016832	ATT	2	6	1604397	1604402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016832	CAT	2	6	1604403	1604408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_016832	ATT	2	6	1604423	1604428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016832	T	6	6	1604434	1604439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016832	TG	3	6	1604462	1604467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016832	CGC	2	6	1606040	1606045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_016832	TC	3	6	1606316	1606321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_016832	TAAAA	2	10	1606514	1606523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016832	T	6	6	1606564	1606569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016832	ATA	2	6	1610141	1610146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016832	TCC	2	6	1610151	1610156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_016832	CT	3	6	1610193	1610198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_016832	TAA	2	6	1610789	1610794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016832	A	7	7	1610854	1610860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016832	ATT	2	6	1611150	1611155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016832	TCC	2	6	1611184	1611189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_016832	C	6	6	1611202	1611207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5074	NC_016832	AGC	2	6	1611220	1611225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_016832	AGG	2	6	1611297	1611302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016832	AG	3	6	1611759	1611764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016832	CAT	3	9	1611782	1611790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_016832	GTG	2	6	1612163	1612168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016832	TTAA	2	8	1612174	1612181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_016832	TGC	2	6	1612251	1612256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016832	ACTT	2	8	1612280	1612287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_016832	TCGC	2	8	1612306	1612313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_016832	GCC	2	6	1612316	1612321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_016832	AATT	2	8	1612335	1612342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016832	GA	3	6	1612370	1612375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016832	AAC	2	6	1612377	1612382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_016832	TGCC	2	8	1612422	1612429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_016832	GT	3	6	1612484	1612489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016832	T	6	6	1612489	1612494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016832	ATA	2	6	1612558	1612563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016832	CTG	2	6	1612576	1612581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_016832	GGT	2	6	1612605	1612610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016832	TTC	2	6	1612625	1612630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016832	CAG	2	6	1612658	1612663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016832	CCAG	2	8	1614247	1614254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_016832	CAT	2	6	1614267	1614272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_016832	AAT	2	6	1614307	1614312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016832	ACC	2	6	1614359	1614364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_016832	AC	3	6	1614426	1614431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_016832	TTA	2	6	1614441	1614446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_016832	ATA	2	6	1614448	1614453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016832	CAT	2	6	1614561	1614566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_016832	CTT	2	6	1614606	1614611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016832	ATG	2	6	1614627	1614632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016832	TCG	2	6	1614685	1614690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_016832	CTG	2	6	1614724	1614729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_016832	GCCA	2	8	1614764	1614771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_016832	TGA	2	6	1614823	1614828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016832	ACG	2	6	1614834	1614839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_016832	TGC	2	6	1617181	1617186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_016832	GCG	2	6	1617242	1617247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016832	CAG	2	6	1617309	1617314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016832	TTC	2	6	1617362	1617367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_016832	CGG	3	9	1617371	1617379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_016832	ATA	2	6	1617466	1617471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_016832	A	8	8	1617549	1617556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016832	CGT	2	6	1617576	1617581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_016832	A	6	6	1617610	1617615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_016832	AACGC	2	10	1617634	1617643	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5120	NC_016832	GA	4	8	1617671	1617678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016832	T	6	6	1617731	1617736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016832	TC	3	6	1618809	1618814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_016832	A	6	6	1618853	1618858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016832	GAATA	2	10	1620008	1620017	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016832	TTA	2	6	1620329	1620334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016832	TCC	2	6	1621030	1621035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_016832	GA	3	6	1621271	1621276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016832	CAA	2	6	1621845	1621850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_016832	TCA	2	6	1621884	1621889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_016832	ATT	2	6	1621903	1621908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016832	TCT	2	6	1622769	1622774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_016832	TTCA	2	8	1622829	1622836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5134	NC_016832	TCT	2	6	1624288	1624293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_016832	TGCT	2	8	1637439	1637446	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5262	NC_016832	AGT	2	6	1658199	1658204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_016832	CTT	2	6	1658241	1658246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5265	NC_016832	CGA	2	6	1658263	1658268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5267	NC_016832	AG	3	6	1658418	1658423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_016832	T	7	7	1658471	1658477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_016832	GCAA	2	8	1658506	1658513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5273	NC_016832	A	7	7	1662193	1662199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5285	NC_016832	A	6	6	1663859	1663864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5287	NC_016832	TAT	2	6	1663974	1663979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5297	NC_016832	A	6	6	1664525	1664530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5299	NC_016832	TGC	2	6	1665380	1665385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5300	NC_016832	CTCA	2	8	1665395	1665402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5301	NC_016832	TA	3	6	1665416	1665421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_016832	ATCG	2	8	1665515	1665522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5305	NC_016832	TGC	2	6	1666704	1666709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5310	NC_016832	CTTT	2	8	1668923	1668930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5395	NC_016832	T	6	6	1698004	1698009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5397	NC_016832	TGTAA	2	10	1698226	1698235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_016832	TCT	2	6	1698270	1698275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_016832	TAT	2	6	1698848	1698853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_016832	ATA	2	6	1699394	1699399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_016832	AGG	2	6	1699403	1699408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5496	NC_016832	TCG	2	6	1721410	1721415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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