MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016831	T	6	6	898310	898315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016831	AAG	2	6	898370	898375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016831	TAAT	2	8	898442	898449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016831	T	6	6	898449	898454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016831	TAG	2	6	898469	898474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016831	AATT	2	8	898478	898485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016831	TGA	2	6	898491	898496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016831	CAT	2	6	898522	898527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_016831	AT	3	6	898573	898578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016831	TTTC	2	8	898623	898630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_016831	TCA	2	6	898648	898653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_016831	AG	3	6	898704	898709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016831	CGGGT	2	10	898710	898719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_016831	ATT	2	6	898883	898888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016831	GTT	2	6	898930	898935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016831	CTG	2	6	898944	898949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_016831	ATT	2	6	898950	898955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016831	TAAAA	2	10	898999	899008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016831	AAC	2	6	899037	899042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_016831	ATA	2	6	899074	899079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016831	TAA	2	6	899108	899113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016831	AGG	2	6	899115	899120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016831	AAT	2	6	902768	902773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016831	TGTT	2	8	902822	902829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016831	CA	3	6	904060	904065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_016831	CGGA	2	8	904696	904703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_016831	TCCG	2	8	904712	904719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_016831	T	6	6	904758	904763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016831	GAAT	2	8	905861	905868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016831	TTG	2	6	905869	905874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016831	GGC	2	6	906000	906005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_016831	CGAATC	2	12	906057	906068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_016831	GC	3	6	907355	907360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_016831	ATT	2	6	907380	907385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016831	CGT	2	6	907405	907410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_016831	TGA	2	6	918942	918947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016831	CG	3	6	919047	919052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_016831	CGA	2	6	919058	919063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_016831	GGT	2	6	919116	919121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016831	GC	3	6	919130	919135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_016831	TGA	2	6	919191	919196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016831	TA	3	6	919218	919223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016831	CTT	2	6	923218	923223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_016831	AAG	2	6	923269	923274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016831	AAT	2	6	923318	923323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016831	TTTTAT	2	12	923349	923360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016831	ATTTA	2	10	923379	923388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_016831	ATT	2	6	923403	923408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_016831	TAT	2	6	923416	923421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016831	TAT	2	6	923529	923534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016831	AGGC	2	8	923633	923640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_016831	CAA	2	6	923652	923657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016831	GGC	2	6	923664	923669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_016831	ATG	2	6	924575	924580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016831	TAA	2	6	924701	924706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016831	TGTTT	2	10	924726	924735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016831	TAA	2	6	924801	924806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016831	GGTTGT	2	12	924843	924854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_016831	TGA	2	6	924867	924872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_016831	GCA	2	6	924918	924923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_016831	CGA	2	6	925131	925136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_016831	TGAA	2	8	925163	925170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016831	ACT	2	6	925193	925198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_016831	CCG	2	6	925214	925219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_016831	TCT	2	6	925221	925226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_016831	A	6	6	925252	925257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_016831	GCA	2	6	925290	925295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_016831	A	6	6	925348	925353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016831	CGA	2	6	925383	925388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3571	NC_016831	CGC	2	6	925605	925610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_016831	CAG	2	6	925622	925627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016831	TCC	2	6	925645	925650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3577	NC_016831	TGA	2	6	925809	925814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_016831	TTA	2	6	925840	925845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_016831	ATT	2	6	925953	925958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016831	GCT	2	6	926055	926060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_016831	GAC	2	6	926069	926074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_016831	GAG	2	6	926115	926120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016831	AGA	2	6	926132	926137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016831	CCTG	2	8	926138	926145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_016831	CAA	2	6	926157	926162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3588	NC_016831	ATG	2	6	933374	933379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3590	NC_016831	ACA	2	6	942760	942765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_016831	AAGG	2	8	942814	942821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016831	TAG	2	6	943803	943808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_016831	T	6	6	943936	943941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_016831	CCG	2	6	944029	944034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_016831	GCG	2	6	944080	944085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_016831	TCA	2	6	944141	944146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_016831	T	6	6	944167	944172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016831	ATT	2	6	944209	944214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016831	CT	3	6	944230	944235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_016831	GTC	2	6	944281	944286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_016831	GTT	2	6	944325	944330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_016831	GGCG	2	8	944442	944449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_016831	T	7	7	944487	944493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_016831	TAC	2	6	944511	944516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_016831	GGT	3	9	944517	944525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016831	GCG	3	9	944566	944574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_016831	TCAT	2	8	944624	944631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_016831	ATT	2	6	944647	944652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016831	AGGCG	2	10	944664	944673	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3614	NC_016831	GCG	2	6	944759	944764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_016831	TGA	2	6	944798	944803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016831	CGG	2	6	944808	944813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_016831	ATC	2	6	944833	944838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_016831	AGC	2	6	944839	944844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_016831	ATT	2	6	944938	944943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_016831	TGA	2	6	944951	944956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016831	GGC	2	6	945159	945164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_016831	TAT	2	6	945207	945212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016831	GGC	2	6	945423	945428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_016831	GC	4	8	945459	945466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_016831	GCGCG	2	10	945601	945610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3626	NC_016831	GCTG	2	8	945639	945646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_016831	CG	3	6	945657	945662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3629	NC_016831	AGC	2	6	945736	945741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_016831	T	7	7	945750	945756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_016831	CGG	2	6	945841	945846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_016831	A	6	6	945934	945939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_016831	T	6	6	945984	945989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3635	NC_016831	TGG	2	6	946159	946164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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