MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016831	ATG	2	6	729675	729680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016831	TGCT	2	8	729783	729790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_016831	TCG	2	6	729808	729813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016831	CCT	2	6	730092	730097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_016831	GCC	2	6	730158	730163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_016831	TTTA	2	8	730229	730236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016831	A	6	6	730257	730262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016831	ATT	2	6	730284	730289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016831	TATC	2	8	730323	730330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_016831	CGAT	2	8	730345	730352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_016831	TGT	2	6	730369	730374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016831	GTG	2	6	732450	732455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016831	AG	3	6	732459	732464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016831	GAAA	2	8	732573	732580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016831	A	6	6	732578	732583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016831	A	6	6	732626	732631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016831	A	6	6	732645	732650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016831	GAG	2	6	732796	732801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016831	CAG	2	6	734875	734880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_016831	A	6	6	736592	736597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016831	GC	3	6	736604	736609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_016831	T	6	6	736616	736621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016831	GAA	2	6	736629	736634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016831	AGG	2	6	739622	739627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016831	GGC	2	6	739636	739641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016831	T	6	6	739779	739784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016831	GGAT	2	8	739785	739792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016831	TCG	2	6	741284	741289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_016831	ACTG	2	8	741323	741330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_016831	T	6	6	741369	741374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016831	T	6	6	741376	741381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016831	TAT	2	6	745921	745926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016831	GCG	2	6	745939	745944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016831	A	6	6	745988	745993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016831	GTT	2	6	745996	746001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016831	TTAT	2	8	746067	746074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016831	TTC	2	6	748762	748767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016831	ATA	2	6	748768	748773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016831	ATT	2	6	748777	748782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016831	TCA	2	6	748829	748834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_016831	CAT	2	6	748876	748881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_016831	CAA	2	6	748923	748928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_016831	AAT	2	6	748971	748976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016831	CATT	2	8	750888	750895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_016831	GCC	2	6	750969	750974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_016831	TTA	2	6	752095	752100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016831	ATG	2	6	752115	752120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016831	TAAC	2	8	752139	752146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_016831	AGTT	2	8	752154	752161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016831	CGC	2	6	752324	752329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_016831	GCG	2	6	752332	752337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016831	TAC	2	6	752373	752378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_016831	GC	3	6	752397	752402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016831	TGG	2	6	752437	752442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016831	T	7	7	752505	752511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016831	ATA	2	6	752526	752531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016831	TTG	2	6	753568	753573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016831	GCA	2	6	753682	753687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_016831	TC	3	6	753691	753696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_016831	CGT	2	6	753697	753702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016831	TTG	2	6	753714	753719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016831	ATT	2	6	753839	753844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016831	GCA	2	6	753880	753885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_016831	AAG	2	6	753901	753906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016831	AAG	2	6	753925	753930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016831	TGA	2	6	754079	754084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016831	CG	5	10	754105	754114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_016831	GAT	2	6	754143	754148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016831	TTA	2	6	754187	754192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016831	ATC	2	6	754232	754237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_016831	ATT	2	6	754246	754251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016831	GAA	2	6	754303	754308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016831	TGGATA	2	12	754382	754393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016831	GAT	2	6	754404	754409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016831	TCG	2	6	754589	754594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016831	GTC	2	6	754620	754625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016831	TAA	2	6	754656	754661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016831	CGAA	2	8	754670	754677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_016831	GAA	2	6	754708	754713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016831	CGT	2	6	754714	754719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_016831	CGCA	2	8	754876	754883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_016831	CGG	2	6	754899	754904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_016831	A	6	6	755035	755040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016831	ATC	2	6	755050	755055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_016831	GC	3	6	756273	756278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_016831	AAG	2	6	758857	758862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016831	A	7	7	758885	758891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016831	ATA	3	9	758930	758938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016831	ATA	2	6	758960	758965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016831	CCG	2	6	760001	760006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3096	NC_016831	TGA	2	6	762251	762256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016831	TCA	2	6	762264	762269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_016831	ACA	2	6	763231	763236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_016831	GA	4	8	765678	765685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016831	CGTAG	2	10	768264	768273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_016831	GCC	2	6	768281	768286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016831	ATC	2	6	769362	769367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_016831	CT	3	6	769722	769727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_016831	T	7	7	769735	769741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016831	GAT	2	6	771201	771206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016831	ATC	2	6	771241	771246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016831	GTT	2	6	771314	771319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016831	GC	3	6	771373	771378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_016831	A	6	6	771390	771395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016831	GCG	2	6	771396	771401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_016831	GC	3	6	771457	771462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_016831	AAT	2	6	771513	771518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016831	GGC	2	6	771568	771573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_016831	GC	3	6	771610	771615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_016831	CGC	2	6	771620	771625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_016831	GAGG	2	8	771648	771655	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016831	CGC	2	6	771691	771696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_016831	CCG	2	6	771718	771723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_016831	G	6	6	771738	771743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016831	CAT	2	6	771778	771783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016831	ATGA	2	8	771826	771833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016831	AGCC	2	8	771909	771916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_016831	TCG	2	6	771917	771922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_016831	ACC	2	6	771952	771957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_016831	CGG	2	6	771978	771983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_016831	GGC	2	6	772037	772042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016831	ACC	2	6	772645	772650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_016831	GCA	2	6	772779	772784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_016831	GCA	2	6	773417	773422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_016831	TTC	2	6	773434	773439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016831	ATG	2	6	773466	773471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016831	ACG	2	6	773516	773521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_016831	CGC	2	6	774500	774505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3135	NC_016831	CGC	2	6	774523	774528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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