MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016831	A	6	6	598314	598319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016831	GAT	2	6	598320	598325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016831	GACA	2	8	598377	598384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_016831	GCAAA	2	10	598403	598412	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2505	NC_016831	GAA	2	6	598427	598432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016831	A	6	6	598468	598473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016831	CGC	2	6	598575	598580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_016831	A	7	7	602054	602060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016831	CAT	2	6	602113	602118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_016831	T	7	7	602128	602134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_016831	ATG	2	6	602138	602143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016831	GAA	2	6	602144	602149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_016831	GAC	2	6	602212	602217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_016831	GTT	3	9	602312	602320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016831	T	6	6	602330	602335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016831	T	7	7	602394	602400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016831	GCA	2	6	602418	602423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_016831	AAG	2	6	602844	602849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016831	TCT	2	6	604119	604124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_016831	TGA	2	6	606724	606729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_016831	ACG	2	6	608052	608057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_016831	AGA	3	9	608078	608086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016831	TTAG	2	8	608139	608146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016831	TGTA	2	8	608167	608174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016831	T	6	6	608210	608215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016831	TGT	2	6	608217	608222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016831	GA	3	6	608242	608247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_016831	TCA	2	6	608255	608260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_016831	CGG	3	9	608328	608336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_016831	G	6	6	608335	608340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_016831	TAAT	2	8	608361	608368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016831	TTAA	2	8	608383	608390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_016831	TTA	2	6	608391	608396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_016831	TAA	2	6	608428	608433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016831	ATT	2	6	608475	608480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_016831	TAA	2	6	608483	608488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_016831	AT	3	6	608598	608603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016831	CAT	2	6	608663	608668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_016831	AT	3	6	608714	608719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_016831	TAT	2	6	608739	608744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_016831	AGTA	2	8	608748	608755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016831	A	6	6	609886	609891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_016831	A	6	6	609907	609912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016831	T	7	7	609926	609932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_016831	GT	4	8	610171	610178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016831	CAA	2	6	610209	610214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_016831	C	6	6	610223	610228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2548	NC_016831	TTAATG	2	12	610261	610272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_016831	ATG	3	9	610270	610278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_016831	A	6	6	610342	610347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_016831	T	8	8	610394	610401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_016831	TCC	2	6	610404	610409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_016831	TGA	2	6	610467	610472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_016831	GCA	3	9	611615	611623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_016831	ACC	2	6	611668	611673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_016831	TTG	2	6	622320	622325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_016831	AAT	2	6	622380	622385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016831	GAT	2	6	622491	622496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016831	TG	3	6	622554	622559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016831	TGA	2	6	625633	625638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016831	CCG	2	6	625648	625653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_016831	CGG	2	6	625660	625665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_016831	TGA	2	6	625673	625678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016831	AAT	2	6	625854	625859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_016831	CAG	2	6	625946	625951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_016831	AAC	2	6	625980	625985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_016831	ATT	2	6	626111	626116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016831	CGG	2	6	626125	626130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_016831	ATA	2	6	626134	626139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_016831	TGG	2	6	626189	626194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_016831	TA	3	6	626245	626250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_016831	ATT	2	6	626413	626418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_016831	ATA	2	6	626438	626443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_016831	CTGTA	2	10	628318	628327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2575	NC_016831	GCCT	2	8	629364	629371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_016831	T	6	6	629371	629376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_016831	A	6	6	629398	629403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_016831	CCGA	2	8	629534	629541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_016831	TCC	2	6	629607	629612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_016831	GGC	2	6	629672	629677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_016831	CGG	2	6	629725	629730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_016831	CGGGC	2	10	629810	629819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2583	NC_016831	GC	3	6	629854	629859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2584	NC_016831	CAA	2	6	629875	629880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_016831	CGT	2	6	629941	629946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_016831	CTT	2	6	629968	629973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_016831	CACG	2	8	630034	630041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_016831	GAT	2	6	630121	630126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016831	CGC	2	6	630208	630213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_016831	TAA	2	6	630257	630262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016831	A	7	7	630311	630317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016831	C	6	6	631212	631217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2593	NC_016831	CCCT	2	8	631235	631242	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2594	NC_016831	T	6	6	631257	631262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_016831	AGGG	2	8	631297	631304	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_016831	AAT	2	6	632632	632637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016831	TGAT	2	8	632670	632677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_016831	AC	3	6	635124	635129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_016831	T	6	6	646078	646083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_016831	ATTAA	2	10	646115	646124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_016831	GTC	2	6	646958	646963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_016831	ACC	2	6	647406	647411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_016831	TCA	2	6	647415	647420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_016831	T	6	6	647481	647486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_016831	ATG	2	6	647527	647532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_016831	TCG	2	6	648229	648234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_016831	TCC	2	6	648243	648248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_016831	TTC	2	6	648261	648266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_016831	TCA	2	6	648303	648308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_016831	ATC	2	6	649595	649600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_016831	T	6	6	649604	649609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016831	T	6	6	649718	649723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_016831	GAA	2	6	651859	651864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016831	TGTA	2	8	651900	651907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_016831	AGAT	2	8	651957	651964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_016831	CTG	2	6	652046	652051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016831	CTG	2	6	652090	652095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_016831	TC	3	6	652104	652109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_016831	TGC	2	6	652110	652115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_016831	GCG	2	6	652171	652176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_016831	ATCT	2	8	652201	652208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2622	NC_016831	GC	3	6	652268	652273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_016831	CGC	2	6	652295	652300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_016831	CTG	2	6	652312	652317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_016831	TGA	2	6	652416	652421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_016831	GCA	2	6	652428	652433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_016831	GAA	2	6	652453	652458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_016831	GCGA	2	8	652483	652490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_016831	AGA	2	6	652491	652496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_016831	TAT	2	6	652557	652562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_016831	GGT	2	6	652659	652664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_016831	GGC	2	6	652683	652688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_016831	ATTGGC	2	12	652777	652788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2634	NC_016831	GCA	2	6	652837	652842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2636	NC_016831	GTT	2	6	652992	652997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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