MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016831	TAT	2	6	4539328	4539333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_016831	ATA	2	6	4539337	4539342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_016831	TA	3	6	4539341	4539346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_016831	GGA	2	6	4539386	4539391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_016831	TGG	2	6	4539419	4539424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_016831	T	6	6	4539433	4539438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_016831	TCT	2	6	4539444	4539449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_016831	T	7	7	4539455	4539461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_016831	TAA	2	6	4539467	4539472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_016831	GCA	2	6	4539480	4539485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18511	NC_016831	TGG	2	6	4539501	4539506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_016831	TCA	2	6	4539513	4539518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_016831	TAC	2	6	4539648	4539653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_016831	GC	3	6	4539672	4539677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18515	NC_016831	TGG	2	6	4539712	4539717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_016831	AT	3	6	4539734	4539739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_016831	TTG	2	6	4539762	4539767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_016831	CCT	2	6	4539806	4539811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18519	NC_016831	CG	3	6	4539824	4539829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18520	NC_016831	GTGAC	2	10	4539872	4539881	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18521	NC_016831	CCT	2	6	4539912	4539917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18522	NC_016831	TCC	2	6	4539941	4539946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18523	NC_016831	CAG	2	6	4540189	4540194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18524	NC_016831	CCGC	2	8	4540214	4540221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18525	NC_016831	GCC	2	6	4540244	4540249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18526	NC_016831	TCG	2	6	4540265	4540270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18527	NC_016831	CGT	2	6	4540284	4540289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18528	NC_016831	GTT	2	6	4540335	4540340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_016831	TG	3	6	4540346	4540351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_016831	TTCGCT	2	12	4540528	4540539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_016831	AT	3	6	4540721	4540726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_016831	TCA	2	6	4540727	4540732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18533	NC_016831	GGT	2	6	4540765	4540770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_016831	CAG	2	6	4540846	4540851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18535	NC_016831	CAA	2	6	4540944	4540949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18536	NC_016831	GC	3	6	4540977	4540982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18537	NC_016831	TGA	2	6	4540989	4540994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_016831	TCA	2	6	4541040	4541045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_016831	GGT	2	6	4541070	4541075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_016831	CTG	2	6	4541128	4541133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_016831	GATG	2	8	4541146	4541153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_016831	GA	3	6	4541157	4541162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_016831	CGG	2	6	4541303	4541308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_016831	GAT	2	6	4541334	4541339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18545	NC_016831	GGCT	2	8	4541362	4541369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18546	NC_016831	ATGCG	2	10	4541408	4541417	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18547	NC_016831	CAT	3	9	4541443	4541451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18548	NC_016831	GAA	2	6	4541717	4541722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_016831	ATC	2	6	4541731	4541736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_016831	AC	3	6	4541754	4541759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18551	NC_016831	GAT	2	6	4541832	4541837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_016831	GTTGA	2	10	4541864	4541873	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18553	NC_016831	CGT	2	6	4541884	4541889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_016831	GGA	2	6	4541950	4541955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_016831	A	6	6	4542187	4542192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_016831	ATA	2	6	4542812	4542817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_016831	ACG	2	6	4542852	4542857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18558	NC_016831	AAG	2	6	4542869	4542874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_016831	TGA	2	6	4542968	4542973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_016831	CAG	2	6	4542975	4542980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_016831	TAAA	2	8	4543018	4543025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_016831	A	6	6	4543044	4543049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_016831	A	6	6	4543054	4543059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_016831	T	6	6	4543132	4543137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_016831	GGA	2	6	4543155	4543160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_016831	ATC	2	6	4544227	4544232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18567	NC_016831	GA	4	8	4544266	4544273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_016831	AG	3	6	4545439	4545444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_016831	CCTTT	2	10	4545616	4545625	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18570	NC_016831	ATT	3	9	4545655	4545663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_016831	TTG	2	6	4545664	4545669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_016831	GCC	2	6	4547611	4547616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18573	NC_016831	CGG	2	6	4547620	4547625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18574	NC_016831	GCC	2	6	4547652	4547657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18575	NC_016831	CCA	2	6	4547671	4547676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18576	NC_016831	TGC	2	6	4547838	4547843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18577	NC_016831	TGATAT	2	12	4548075	4548086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_016831	T	6	6	4548090	4548095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18579	NC_016831	TTG	2	6	4548191	4548196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18580	NC_016831	TTG	2	6	4548302	4548307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_016831	G	6	6	4548353	4548358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_016831	G	8	8	4549067	4549074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18583	NC_016831	ATAAGC	2	12	4549860	4549871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18584	NC_016831	TCG	2	6	4549891	4549896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18585	NC_016831	CGTC	2	8	4549915	4549922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18586	NC_016831	GCT	2	6	4550117	4550122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18588	NC_016831	TTG	2	6	4550211	4550216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_016831	GCG	2	6	4550371	4550376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18590	NC_016831	GCC	2	6	4550409	4550414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18591	NC_016831	GCT	2	6	4550441	4550446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18592	NC_016831	GCG	2	6	4550501	4550506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18593	NC_016831	CCG	2	6	4550559	4550564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18594	NC_016831	GGC	2	6	4550598	4550603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18595	NC_016831	GA	3	6	4550606	4550611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_016831	GGC	2	6	4550742	4550747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18597	NC_016831	T	7	7	4553140	4553146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_016831	GAT	2	6	4553147	4553152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_016831	GTTG	2	8	4553155	4553162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_016831	GTAT	2	8	4553230	4553237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_016831	GTT	2	6	4553430	4553435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18602	NC_016831	A	6	6	4553436	4553441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_016831	T	6	6	4553447	4553452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_016831	T	6	6	4553467	4553472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_016831	GGTCA	2	10	4553508	4553517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18606	NC_016831	TAA	2	6	4553565	4553570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_016831	A	6	6	4553569	4553574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_016831	AAT	2	6	4553577	4553582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18609	NC_016831	AATT	2	8	4553585	4553592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_016831	ATG	2	6	4553595	4553600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_016831	ATTT	2	8	4553603	4553610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_016831	TGA	2	6	4553618	4553623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_016831	ATC	2	6	4553641	4553646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18614	NC_016831	AT	3	6	4553655	4553660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_016831	AAT	2	6	4553667	4553672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18616	NC_016831	GAGT	2	8	4553697	4553704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_016831	ATGG	2	8	4553765	4553772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18618	NC_016831	TA	3	6	4553820	4553825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18619	NC_016831	ATA	2	6	4553828	4553833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_016831	TTG	3	9	4555222	4555230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18621	NC_016831	ATA	2	6	4555237	4555242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18622	NC_016831	AAGAA	2	10	4555271	4555280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18623	NC_016831	ATTAA	2	10	4555335	4555344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_016831	A	6	6	4556710	4556715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_016831	A	6	6	4558003	4558008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18626	NC_016831	ATG	2	6	4558032	4558037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18627	NC_016831	AGG	2	6	4558437	4558442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18888	NC_016831	TA	3	6	4633968	4633973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18889	NC_016831	AAATA	2	10	4633974	4633983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18890	NC_016831	CTT	2	6	4634005	4634010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18891	NC_016831	TCTGT	2	10	4634011	4634020	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18892	NC_016831	GGC	2	6	4634030	4634035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18901	NC_016831	ACG	2	6	4634248	4634253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18914	NC_016831	CAA	2	6	4636759	4636764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18921	NC_016831	TAA	2	6	4637007	4637012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18922	NC_016831	TGA	2	6	4637016	4637021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18923	NC_016831	TAAAT	2	10	4637044	4637053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18924	NC_016831	TAAA	2	8	4637059	4637066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18925	NC_016831	ATA	2	6	4637957	4637962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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