MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016831	CCT	2	6	2661177	2661182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_016831	GCT	2	6	2661249	2661254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_016831	TAC	2	6	2661848	2661853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_016831	ACC	2	6	2661942	2661947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_016831	AT	3	6	2665337	2665342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_016831	A	6	6	2665348	2665353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_016831	ATG	2	6	2665439	2665444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_016831	CCT	2	6	2665447	2665452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_016831	TGAGAA	2	12	2665463	2665474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_016831	GC	3	6	2666645	2666650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_016831	GAC	2	6	2666693	2666698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_016831	GCG	2	6	2666703	2666708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_016831	AC	3	6	2666725	2666730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_016831	GTG	2	6	2666752	2666757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_016831	GT	3	6	2666818	2666823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_016831	GAA	2	6	2668397	2668402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_016831	AAT	2	6	2668422	2668427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_016831	GGA	2	6	2668451	2668456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_016831	CAAC	2	8	2668502	2668509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11020	NC_016831	CAA	2	6	2669241	2669246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_016831	TGT	2	6	2669256	2669261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_016831	ATT	2	6	2669263	2669268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_016831	ATC	2	6	2669312	2669317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_016831	CCT	2	6	2669331	2669336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_016831	CAAG	2	8	2669338	2669345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11026	NC_016831	T	6	6	2671854	2671859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_016831	ATT	2	6	2671860	2671865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_016831	GAG	2	6	2671898	2671903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_016831	CGG	2	6	2672698	2672703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_016831	GGCA	2	8	2672755	2672762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_016831	CCA	2	6	2672787	2672792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_016831	GC	3	6	2672827	2672832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_016831	GTA	2	6	2672851	2672856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_016831	GCC	2	6	2672890	2672895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_016831	GCG	2	6	2672900	2672905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_016831	TAA	2	6	2673010	2673015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_016831	TTCATC	2	12	2673511	2673522	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_016831	GAG	2	6	2673601	2673606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_016831	CGA	2	6	2673621	2673626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_016831	T	6	6	2673659	2673664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_016831	T	6	6	2673701	2673706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_016831	GAC	2	6	2674751	2674756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_016831	TCA	2	6	2674794	2674799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_016831	TG	3	6	2675850	2675855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_016831	ATC	2	6	2675872	2675877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_016831	ATA	2	6	2675878	2675883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_016831	A	6	6	2675883	2675888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_016831	CATC	2	8	2675931	2675938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_016831	ATT	2	6	2676159	2676164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_016831	CTTA	2	8	2676165	2676172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11051	NC_016831	C	7	7	2676176	2676182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11052	NC_016831	ATT	2	6	2676195	2676200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_016831	GGA	2	6	2676210	2676215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_016831	AACAG	2	10	2676216	2676225	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11055	NC_016831	CTC	2	6	2676272	2676277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_016831	AAT	2	6	2676341	2676346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_016831	CAA	3	9	2676354	2676362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_016831	GAT	2	6	2676552	2676557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_016831	GGA	2	6	2676561	2676566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_016831	GCA	2	6	2676575	2676580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_016831	A	6	6	2677442	2677447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_016831	ATT	2	6	2677451	2677456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_016831	AAAC	2	8	2677531	2677538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_016831	CAAA	2	8	2677583	2677590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11065	NC_016831	ATA	2	6	2677606	2677611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_016831	ATT	2	6	2677632	2677637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_016831	ATA	2	6	2677647	2677652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_016831	A	7	7	2677666	2677672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_016831	ATCA	2	8	2677693	2677700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11070	NC_016831	A	7	7	2681609	2681615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_016831	TAA	2	6	2681642	2681647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_016831	GTT	2	6	2681660	2681665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_016831	AAT	2	6	2681916	2681921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_016831	TCA	2	6	2681978	2681983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_016831	CCA	2	6	2682000	2682005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_016831	CCG	2	6	2682063	2682068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_016831	CGAG	2	8	2682093	2682100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11078	NC_016831	AAC	2	6	2682108	2682113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_016831	TCA	2	6	2682120	2682125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_016831	AAT	2	6	2682142	2682147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_016831	TTC	2	6	2682152	2682157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_016831	A	6	6	2682172	2682177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_016831	TAC	2	6	2682185	2682190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_016831	GTT	2	6	2682229	2682234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_016831	CAC	2	6	2682349	2682354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_016831	AG	3	6	2682381	2682386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_016831	ACAT	2	8	2682427	2682434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_016831	ATT	2	6	2682454	2682459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_016831	CTGA	2	8	2682560	2682567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_016831	CCTT	2	8	2682608	2682615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11091	NC_016831	CAC	2	6	2682645	2682650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_016831	AGC	2	6	2682680	2682685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11094	NC_016831	ACA	2	6	2683180	2683185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_016831	ACG	2	6	2683200	2683205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_016831	CAG	2	6	2683265	2683270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_016831	GTT	2	6	2683273	2683278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_016831	TA	3	6	2683314	2683319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_016831	GCC	2	6	2683354	2683359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11100	NC_016831	TGG	2	6	2683383	2683388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_016831	GTCC	2	8	2683427	2683434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_016831	GAT	2	6	2683459	2683464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_016831	GATT	2	8	2683515	2683522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_016831	GAT	2	6	2683529	2683534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_016831	GA	3	6	2683586	2683591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_016831	TTA	2	6	2683635	2683640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11108	NC_016831	GTA	2	6	2684159	2684164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_016831	ATT	2	6	2684270	2684275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_016831	TAA	2	6	2684294	2684299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_016831	CAC	2	6	2684323	2684328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_016831	TAA	2	6	2684332	2684337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_016831	TTC	2	6	2684478	2684483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_016831	TTA	2	6	2684533	2684538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_016831	CAT	2	6	2684557	2684562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_016831	TTGC	2	8	2684572	2684579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_016831	T	6	6	2684587	2684592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_016831	CAT	2	6	2684596	2684601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_016831	TATAA	2	10	2684653	2684662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_016831	A	6	6	2684754	2684759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_016831	AT	3	6	2684804	2684809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_016831	TAT	2	6	2684827	2684832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_016831	A	6	6	2684839	2684844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_016831	CTT	3	9	2684854	2684862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_016831	TC	3	6	2684899	2684904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11126	NC_016831	A	6	6	2684918	2684923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_016831	AAC	2	6	2684934	2684939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11129	NC_016831	C	6	6	2685078	2685083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11243	NC_016831	A	6	6	2703521	2703526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_016831	AACT	2	8	2703563	2703570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11252	NC_016831	TCAG	2	8	2704262	2704269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11253	NC_016831	AT	3	6	2704277	2704282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_016831	T	7	7	2704355	2704361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_016831	TTA	2	6	2704445	2704450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11258	NC_016831	AGAT	2	8	2704511	2704518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11259	NC_016831	ATC	2	6	2704519	2704524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11260	NC_016831	ATTTTT	2	12	2704562	2704573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11388	NC_016831	GCC	2	6	2730450	2730455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11499	NC_016831	CGG	2	6	2757559	2757564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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