MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016831	GAG	2	6	1226770	1226775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016831	GC	3	6	1226797	1226802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_016831	TGA	2	6	1226835	1226840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016831	TG	3	6	1226887	1226892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016831	GC	3	6	1226979	1226984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_016831	A	6	6	1227004	1227009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016831	TTA	2	6	1227063	1227068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016831	CGC	2	6	1227096	1227101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_016831	GCG	2	6	1227112	1227117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016831	GTT	2	6	1227134	1227139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016831	TTC	2	6	1228569	1228574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016831	GCT	2	6	1228587	1228592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_016831	CG	3	6	1228608	1228613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_016831	GA	4	8	1228628	1228635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016831	GA	3	6	1228640	1228645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016831	CGC	2	6	1228673	1228678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_016831	GCC	2	6	1228750	1228755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_016831	CGG	2	6	1228796	1228801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016831	CTT	2	6	1228835	1228840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_016831	ATA	2	6	1228866	1228871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016831	CGG	2	6	1228907	1228912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_016831	TGA	2	6	1229122	1229127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016831	TCA	2	6	1229245	1229250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_016831	TAA	2	6	1229268	1229273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016831	GCC	2	6	1229283	1229288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_016831	GCC	2	6	1229295	1229300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_016831	GCG	2	6	1229315	1229320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_016831	TCAT	2	8	1229401	1229408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_016831	GT	3	6	1229424	1229429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016831	GGCAG	2	10	1229430	1229439	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_016831	ATT	2	6	1229466	1229471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016831	T	7	7	1229470	1229476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016831	TG	3	6	1229479	1229484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016831	GCG	2	6	1229547	1229552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_016831	TAAC	2	8	1229601	1229608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_016831	GCG	2	6	1229679	1229684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_016831	TAA	2	6	1229706	1229711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016831	ATC	2	6	1229864	1229869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_016831	CCG	2	6	1229876	1229881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_016831	AAT	2	6	1229923	1229928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016831	TGA	2	6	1229985	1229990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016831	CAT	2	6	1229997	1230002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016831	CGG	2	6	1230018	1230023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_016831	GGCA	2	8	1230052	1230059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_016831	ATA	2	6	1230096	1230101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016831	CTT	2	6	1230114	1230119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016831	AATA	2	8	1230187	1230194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016831	TGT	2	6	1231482	1231487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016831	AAT	2	6	1231548	1231553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016831	AT	3	6	1231623	1231628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016831	CGA	2	6	1231728	1231733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_016831	AAT	3	9	1234865	1234873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016831	CCT	2	6	1235844	1235849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_016831	CGT	2	6	1235895	1235900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016831	TGA	2	6	1235972	1235977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016831	TGG	2	6	1235982	1235987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016831	AAT	2	6	1236019	1236024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016831	CG	3	6	1236026	1236031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_016831	CCG	2	6	1236032	1236037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_016831	TGAT	2	8	1236122	1236129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016831	CGT	2	6	1236138	1236143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_016831	CCA	3	9	1236192	1236200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_016831	CA	3	6	1236247	1236252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_016831	G	6	6	1236255	1236260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016831	CGT	2	6	1236344	1236349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_016831	GCG	2	6	1236364	1236369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_016831	CGC	2	6	1236420	1236425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_016831	CAGC	2	8	1236499	1236506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_016831	GCT	2	6	1236541	1236546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_016831	CTG	2	6	1236564	1236569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_016831	CAA	2	6	1236596	1236601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016831	A	6	6	1236641	1236646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016831	TGA	2	6	1236650	1236655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016831	TTG	3	9	1236714	1236722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016831	ACA	2	6	1236730	1236735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_016831	GGC	2	6	1236791	1236796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_016831	GCG	2	6	1236859	1236864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_016831	AACC	2	8	1237004	1237011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_016831	CGCTG	2	10	1237045	1237054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_016831	CG	3	6	1237075	1237080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_016831	CAC	2	6	1237142	1237147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_016831	GGC	2	6	1237200	1237205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_016831	TATT	2	8	1237206	1237213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016831	TGC	2	6	1237306	1237311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_016831	GGC	2	6	1237328	1237333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_016831	AGGA	2	8	1237369	1237376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016831	TAA	2	6	1237382	1237387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016831	GCT	2	6	1237403	1237408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_016831	CGAC	2	8	1237413	1237420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_016831	CGCC	2	8	1237531	1237538	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5091	NC_016831	GC	3	6	1237558	1237563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_016831	TGC	2	6	1237591	1237596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_016831	CAG	2	6	1237617	1237622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016831	TGC	2	6	1237729	1237734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016831	AAC	2	6	1237753	1237758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_016831	TAA	2	6	1237766	1237771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016831	TCA	2	6	1237781	1237786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_016831	GC	3	6	1237917	1237922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_016831	TGC	2	6	1237943	1237948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016831	CAG	2	6	1237969	1237974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016831	TTG	2	6	1238101	1238106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016831	GCGCT	2	10	1238153	1238162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5103	NC_016831	TGC	2	6	1238183	1238188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016831	GGCG	2	8	1238229	1238236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_016831	ACC	2	6	1238353	1238358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_016831	GGGCG	2	10	1238413	1238422	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5107	NC_016831	GGT	2	6	1238469	1238474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016831	CGA	2	6	1239213	1239218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_016831	TGG	2	6	1239450	1239455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016831	TCG	2	6	1239504	1239509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_016831	CCG	2	6	1239537	1239542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_016831	GAA	2	6	1240674	1240679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016831	CTA	2	6	1241449	1241454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_016831	GAT	2	6	1241527	1241532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016831	TCA	2	6	1241557	1241562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_016831	TGC	2	6	1242242	1242247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_016831	ATA	2	6	1242264	1242269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016831	TCA	2	6	1245100	1245105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_016831	AT	3	6	1245150	1245155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016831	TAA	2	6	1245184	1245189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016831	TTTA	2	8	1245217	1245224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016831	ATAA	2	8	1245225	1245232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016831	AAAT	2	8	1245368	1245375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016831	GAG	2	6	1245439	1245444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016831	ACT	2	6	1245636	1245641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_016831	GCA	2	6	1245646	1245651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_016831	TTA	2	6	1245711	1245716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016831	AGT	2	6	1245724	1245729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016831	A	6	6	1245786	1245791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016831	CCA	2	6	1248796	1248801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5139	NC_016831	AG	3	6	1249132	1249137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_016831	ACA	2	6	1300170	1300175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_016831	AGT	2	6	1300973	1300978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_016831	ACA	2	6	1301106	1301111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5333	NC_016831	T	6	6	1320743	1320748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_016831	GTGA	2	8	1327599	1327606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_016831	ATT	2	6	1330276	1330281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_016831	ATA	2	6	1333675	1333680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5390	NC_016831	GTT	2	6	1337651	1337656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5454	NC_016831	CCGCG	2	10	1345655	1345664	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5489	NC_016831	CGG	2	6	1358932	1358937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5493	NC_016831	A	6	6	1359159	1359164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_016831	TATT	2	8	1359216	1359223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_016831	CAGC	2	8	1359525	1359532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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