MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016831	CGG	2	6	1121398	1121403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_016831	AAT	2	6	1121429	1121434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016831	AAT	2	6	1121447	1121452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016831	CCG	2	6	1121479	1121484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_016831	CAA	2	6	1121491	1121496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_016831	AAT	2	6	1121498	1121503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016831	CGC	2	6	1121515	1121520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_016831	GGC	2	6	1121553	1121558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_016831	A	6	6	1121627	1121632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016831	TAA	2	6	1121686	1121691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016831	TTG	2	6	1121692	1121697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016831	GCTG	2	8	1121702	1121709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_016831	TTC	2	6	1121746	1121751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_016831	CCG	2	6	1121899	1121904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_016831	TGA	2	6	1121911	1121916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016831	G	6	6	1121950	1121955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016831	TCTT	2	8	1121974	1121981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_016831	GTG	2	6	1121993	1121998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016831	GCA	2	6	1122004	1122009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_016831	ACA	2	6	1122036	1122041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_016831	CTTT	2	8	1122084	1122091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_016831	GCA	2	6	1122094	1122099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_016831	GGGC	2	8	1122170	1122177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_016831	ATG	2	6	1122222	1122227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_016831	ATG	2	6	1122255	1122260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016831	T	6	6	1122292	1122297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016831	TTG	2	6	1122338	1122343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016831	ACTT	2	8	1122515	1122522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_016831	TGG	2	6	1122587	1122592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016831	GCA	2	6	1122657	1122662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016831	AGA	2	6	1122672	1122677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016831	GGC	2	6	1122681	1122686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016831	CAG	3	9	1122697	1122705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_016831	CGG	2	6	1122771	1122776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016831	CGG	2	6	1122804	1122809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_016831	ATT	2	6	1122888	1122893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016831	CGC	2	6	1122909	1122914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_016831	TCG	2	6	1122929	1122934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_016831	ATG	2	6	1122989	1122994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016831	CCG	2	6	1123036	1123041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_016831	AAT	2	6	1124865	1124870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016831	AAC	2	6	1124988	1124993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_016831	AC	3	6	1125080	1125085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_016831	A	8	8	1125121	1125128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016831	CCA	2	6	1126173	1126178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_016831	AATC	2	8	1126265	1126272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_016831	GCC	2	6	1126339	1126344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_016831	ATA	2	6	1126368	1126373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016831	GCC	2	6	1126399	1126404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_016831	ATT	2	6	1126939	1126944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016831	GCC	2	6	1127263	1127268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_016831	CGG	2	6	1127272	1127277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_016831	ATT	2	6	1127397	1127402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016831	CGG	2	6	1127408	1127413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_016831	GATC	2	8	1127469	1127476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_016831	AG	3	6	1127500	1127505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016831	TCC	2	6	1127520	1127525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_016831	CAG	3	9	1127541	1127549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_016831	TG	3	6	1127588	1127593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016831	TCA	2	6	1127614	1127619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_016831	GATC	2	8	1127771	1127778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_016831	TCT	2	6	1127804	1127809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_016831	CTT	2	6	1127837	1127842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_016831	TTGG	2	8	1128022	1128029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016831	ATG	2	6	1128095	1128100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016831	GGC	2	6	1128169	1128174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_016831	TGAT	2	8	1128182	1128189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016831	GCG	3	9	1128238	1128246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_016831	GCG	2	6	1128251	1128256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_016831	CGA	2	6	1128291	1128296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016831	CG	3	6	1128336	1128341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_016831	ACA	2	6	1128392	1128397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_016831	GCG	2	6	1128410	1128415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_016831	CCTG	2	8	1128421	1128428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_016831	TGT	2	6	1128448	1128453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016831	AAC	2	6	1128481	1128486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_016831	TGG	2	6	1128667	1128672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016831	GTG	2	6	1128744	1128749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016831	GTC	2	6	1128837	1128842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_016831	TGC	2	6	1128934	1128939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_016831	CAT	2	6	1129025	1129030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_016831	GCG	2	6	1129087	1129092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_016831	GAT	2	6	1129109	1129114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016831	TGA	2	6	1129205	1129210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016831	CATT	2	8	1130779	1130786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_016831	CCG	2	6	1130787	1130792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_016831	CGTGC	2	10	1130906	1130915	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4588	NC_016831	GGAA	2	8	1130936	1130943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016831	TGG	2	6	1131079	1131084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_016831	CTG	3	9	1131088	1131096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_016831	AGA	2	6	1131296	1131301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016831	CAG	2	6	1131318	1131323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_016831	CGA	2	6	1131329	1131334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_016831	CCG	2	6	1131361	1131366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_016831	CCG	2	6	1131370	1131375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_016831	GCG	2	6	1131409	1131414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_016831	TTG	2	6	1131427	1131432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016831	TCC	2	6	1131543	1131548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_016831	ATT	2	6	1131642	1131647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016831	TTA	2	6	1131655	1131660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016831	T	6	6	1134495	1134500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_016831	A	8	8	1135411	1135418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016831	GAT	2	6	1135424	1135429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016831	AAT	2	6	1135464	1135469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016831	TTA	2	6	1135470	1135475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016831	TGC	2	6	1135479	1135484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_016831	AAT	2	6	1135575	1135580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016831	AAT	2	6	1135663	1135668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016831	CGG	2	6	1135728	1135733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_016831	TTG	2	6	1135780	1135785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016831	TTTC	2	8	1135842	1135849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_016831	CTT	2	6	1135898	1135903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_016831	TCCC	2	8	1135916	1135923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4614	NC_016831	CG	3	6	1135944	1135949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_016831	TC	3	6	1135950	1135955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_016831	GAT	2	6	1136028	1136033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016831	TCT	2	6	1136037	1136042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_016831	TGG	2	6	1136043	1136048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016831	TGC	2	6	1136057	1136062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_016831	GGT	2	6	1136105	1136110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016831	GGC	2	6	1136123	1136128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016831	CAG	2	6	1136143	1136148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_016831	AGAAAA	2	12	1136172	1136183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016831	A	6	6	1136180	1136185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016831	GCC	2	6	1136196	1136201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_016831	GCG	2	6	1136280	1136285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_016831	ATTG	2	8	1136307	1136314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016831	CAT	2	6	1136409	1136414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4630	NC_016831	ATT	2	6	1136455	1136460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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