MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 1905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016822	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016822	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016822	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016822	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016822	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016822	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016822	ATTA	2	8	15898	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016822	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016822	CTTT	2	8	25281	25288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016822	TATT	2	8	26644	26651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016822	TCAT	2	8	34619	34626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016822	TCCC	2	8	34649	34656	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016822	TGGC	2	8	34690	34697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016822	AGTG	2	8	36009	36016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016822	GGGC	2	8	45143	45150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016822	ATTT	2	8	49243	49250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016822	GTTT	2	8	49260	49267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016822	TGTT	2	8	53831	53838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016822	TGTT	2	8	56954	56961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016822	TCCA	2	8	75837	75844	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016822	ATTA	2	8	90589	90596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016822	ATTA	2	8	91923	91930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016822	AGGC	2	8	92133	92140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016822	CCCG	2	8	96443	96450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016822	TTAA	2	8	96451	96458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016822	TTGG	2	8	124746	124753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016822	CCGC	2	8	124897	124904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_016822	GAAT	2	8	128971	128978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016822	TCAA	2	8	129162	129169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016822	GATA	2	8	130177	130184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016822	CGGC	2	8	134785	134792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016822	TAAG	2	8	134996	135003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016822	GCGA	2	8	144042	144049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016822	AATT	2	8	148191	148198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016822	GAAT	2	8	148256	148263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016822	ACTT	2	8	154937	154944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016822	AAAT	2	8	164708	164715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016822	ATGA	2	8	164987	164994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016822	TTAT	2	8	165516	165523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016822	TTAA	2	8	166646	166653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016822	ATTC	2	8	166702	166709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016822	AAAT	2	8	167521	167528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016822	ATAA	2	8	167677	167684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016822	TTAC	2	8	171203	171210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016822	GGTT	2	8	174968	174975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016822	CTTT	2	8	177768	177775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016822	GCCC	2	8	195305	195312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016822	GAGC	2	8	201850	201857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016822	GAAA	2	8	203003	203010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016822	ATAA	2	8	203750	203757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016822	AGTT	2	8	209057	209064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016822	AAGG	2	8	222249	222256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016822	AAAC	2	8	228590	228597	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016822	GGCT	2	8	228718	228725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016822	ATCA	2	8	235294	235301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016822	CCGG	2	8	237455	237462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016822	GTAG	2	8	237754	237761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016822	TAAA	2	8	238138	238145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016822	CTGA	2	8	238743	238750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016822	GTAC	2	8	238827	238834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016822	CGTC	2	8	239268	239275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016822	AAAG	2	8	239391	239398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016822	GCTG	2	8	240070	240077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016822	CCTG	2	8	241642	241649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016822	CCGT	2	8	241677	241684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016822	ATTT	2	8	243605	243612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016822	CCTG	2	8	249646	249653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016822	CCGT	2	8	249681	249688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016822	TGTT	2	8	249938	249945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016822	TGTT	2	8	250926	250933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016822	ACAT	2	8	251461	251468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016822	GCCA	2	8	251855	251862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016822	TAAC	2	8	252065	252072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016822	AATG	2	8	252116	252123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016822	ACTG	2	8	254605	254612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016822	AGTC	3	12	255013	255024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016822	GCAG	2	8	255048	255055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016822	CTTT	2	8	255219	255226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016822	TTCT	2	8	255830	255837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016822	CGCC	2	8	255892	255899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_016822	CAGT	2	8	255915	255922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016822	GGCG	2	8	256615	256622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016822	CATC	2	8	256642	256649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016822	ATTC	2	8	256832	256839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016822	CTGT	2	8	256940	256947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016822	CAGC	2	8	257168	257175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016822	ATAA	2	8	257324	257331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016822	CGGA	2	8	257335	257342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016822	GCCA	2	8	257613	257620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016822	ATAA	2	8	272457	272464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016822	ATCG	2	8	272479	272486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016822	GATT	2	8	272661	272668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016822	TGTA	2	8	272895	272902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016822	AGAA	2	8	273588	273595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016822	CTGT	2	8	273710	273717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016822	ATCG	2	8	275359	275366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016822	CATC	2	8	275398	275405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016822	ATTG	2	8	275458	275465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016822	TCTG	2	8	285590	285597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016822	AGGA	2	8	286027	286034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016822	AAAT	2	8	286859	286866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016822	TAAA	2	8	286992	286999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016822	ATAA	2	8	287222	287229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016822	AATC	2	8	293276	293283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016822	TATT	2	8	295523	295530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016822	CGCC	2	8	302387	302394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_016822	GCGT	2	8	303980	303987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016822	GCTG	2	8	304159	304166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016822	GTTT	2	8	304223	304230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016822	CTGG	2	8	304545	304552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016822	CGAA	2	8	304918	304925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016822	AGTA	2	8	308118	308125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016822	CGTT	2	8	311183	311190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016822	ATTA	2	8	314700	314707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016822	TAAA	2	8	314818	314825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016822	AAAT	2	8	314826	314833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016822	AAAT	2	8	315489	315496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016822	CATT	2	8	315797	315804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016822	CCTA	2	8	317250	317257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016822	TCTG	2	8	320436	320443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016822	AGGA	2	8	320873	320880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016822	TAAA	2	8	327253	327260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016822	TAAA	2	8	327284	327291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016822	GAAA	2	8	327470	327477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016822	ATTG	2	8	335424	335431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016822	CAGC	2	8	341995	342002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016822	TCAG	2	8	342007	342014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016822	AGAT	2	8	344195	344202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016822	GGCT	2	8	345590	345597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016822	TTCA	2	8	352171	352178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016822	CTCC	2	8	353481	353488	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_016822	GTTA	2	8	353508	353515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016822	TCTG	2	8	355368	355375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016822	AGGA	2	8	355805	355812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016822	ATAA	2	8	356997	357004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016822	TGAG	2	8	361261	361268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016822	GCGG	2	8	362774	362781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016822	GCCA	2	8	362826	362833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016822	GGTG	2	8	362911	362918	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016822	TTTA	2	8	363206	363213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016822	GCGG	2	8	374479	374486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016822	TATT	2	8	377726	377733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016822	GTAT	2	8	377902	377909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016822	AATT	2	8	377956	377963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016822	AATG	2	8	378260	378267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016822	TGAA	2	8	388112	388119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016822	CAAA	2	8	393075	393082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016822	AAGT	2	8	399746	399753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016822	CAGC	2	8	400507	400514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016822	TATT	2	8	411215	411222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_016822	CTGA	2	8	1223854	1223861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_016822	GATT	2	8	1224114	1224121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_016822	CGGT	2	8	1248355	1248362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_016822	CTGA	2	8	1250823	1250830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
463	NC_016822	TCCT	2	8	1251246	1251253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_016822	CAGA	2	8	1251683	1251690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_016822	TTGA	2	8	1252740	1252747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016822	CTGC	2	8	1256791	1256798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_016822	ACAA	2	8	1256851	1256858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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472	NC_016822	ACTA	2	8	1263039	1263046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NC_016822	ATCG	2	8	1269853	1269860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_016822	CATC	2	8	1269892	1269899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_016822	ATTG	2	8	1269952	1269959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
476	NC_016822	AACC	2	8	1272753	1272760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_016822	CCAG	2	8	1272867	1272874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_016822	TAAT	2	8	1274533	1274540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_016822	ATGA	2	8	1274547	1274554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016822	AATT	2	8	1274820	1274827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_016822	AGCC	2	8	1278571	1278578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_016822	AATC	2	8	1281454	1281461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_016822	CTTT	2	8	1281580	1281587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_016822	ATTT	2	8	1281687	1281694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_016822	TGCT	2	8	1281739	1281746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_016822	TGGG	2	8	1282100	1282107	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
489	NC_016822	GGTT	2	8	1302623	1302630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_016822	ATTT	2	8	1304380	1304387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_016822	AAAG	2	8	1309847	1309854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_016822	AGAT	2	8	1312066	1312073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_016822	CTTT	3	12	1313699	1313710	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_016822	TTAT	2	8	1314565	1314572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_016822	AGTT	2	8	1314655	1314662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_016822	GTTG	2	8	1315933	1315940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
497	NC_016822	TCAG	2	8	1316247	1316254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_016822	TCCT	2	8	1316949	1316956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_016822	CAGA	2	8	1317386	1317393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_016822	TAAA	2	8	1319167	1319174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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