MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 8358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016822	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016822	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016822	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016822	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016822	GAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016822	AAC	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016822	CGT	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016822	CGC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016822	CAG	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016822	AAT	2	6	7408	7413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016822	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016822	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016822	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016822	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016822	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016822	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016822	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016822	AGT	2	6	10547	10552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016822	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016822	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016822	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016822	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016822	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016822	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016822	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016822	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016822	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016822	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016822	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016822	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016822	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016822	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016822	CCG	2	6	16171	16176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016822	TGT	2	6	17101	17106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016822	GTG	2	6	19521	19526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016822	GAT	2	6	19733	19738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016822	ATG	2	6	23754	23759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016822	TAT	2	6	24888	24893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016822	ATT	2	6	24931	24936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016822	TAC	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016822	GTT	2	6	25057	25062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016822	ATT	2	6	25063	25068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016822	TGA	2	6	25109	25114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016822	CTT	2	6	25147	25152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016822	AAG	2	6	25156	25161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016822	CAT	2	6	25172	25177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016822	TAA	2	6	25243	25248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016822	TCA	2	6	25249	25254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016822	TGA	2	6	26526	26531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016822	TCA	2	6	26574	26579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016822	CAT	2	6	26656	26661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016822	CTA	2	6	26662	26667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016822	TGA	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016822	ACT	2	6	26771	26776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016822	TTG	2	6	26838	26843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016822	ATT	2	6	26847	26852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016822	TAA	2	6	26862	26867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016822	CAT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016822	AGC	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016822	CTT	2	6	27528	27533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016822	TGC	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016822	CGC	2	6	32169	32174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016822	AGC	2	6	33620	33625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016822	TCT	2	6	35715	35720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016822	TGT	2	6	35726	35731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016822	TCT	2	6	35791	35796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016822	TGC	2	6	35797	35802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016822	GCC	2	6	35931	35936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016822	TCG	2	6	35950	35955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016822	TCA	2	6	35981	35986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016822	TGA	2	6	40486	40491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016822	TGA	2	6	40542	40547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016822	CAT	2	6	41308	41313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016822	GCA	2	6	41333	41338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016822	CAC	2	6	41340	41345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016822	CAG	2	6	42025	42030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016822	CGC	2	6	42049	42054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016822	GAC	2	6	43476	43481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016822	ATT	2	6	43520	43525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016822	CTG	2	6	43544	43549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016822	GCG	2	6	46209	46214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016822	GCG	2	6	46443	46448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016822	ATT	3	9	49291	49299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016822	ATT	2	6	49415	49420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016822	TGT	2	6	49434	49439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016822	ACC	2	6	49644	49649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016822	ACG	2	6	49657	49662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016822	CGC	2	6	53809	53814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016822	GCC	2	6	53839	53844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016822	ATT	2	6	54459	54464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016822	GCG	2	6	56978	56983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016822	CAG	2	6	57010	57015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016822	CAT	2	6	57035	57040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016822	CGA	2	6	57053	57058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016822	CAA	2	6	62036	62041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016822	CAT	2	6	64416	64421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016822	GTG	2	6	64506	64511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016822	GCG	2	6	65537	65542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016822	ACC	2	6	69198	69203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016822	GTG	2	6	69225	69230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016822	AAT	2	6	75955	75960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016822	TAA	2	6	76048	76053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016822	TCT	2	6	76137	76142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016822	TCG	2	6	81270	81275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016822	AAT	2	6	83090	83095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016822	AGG	2	6	83112	83117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016822	CAT	2	6	83264	83269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016822	CAG	2	6	83302	83307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016822	CTG	2	6	83315	83320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016822	CGC	2	6	83335	83340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016822	TGC	2	6	84477	84482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016822	ATG	2	6	84502	84507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016822	TGT	2	6	85269	85274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016822	ATT	2	6	85278	85283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016822	TGA	2	6	85309	85314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016822	TGC	2	6	90345	90350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016822	GGT	2	6	90351	90356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016822	TGA	2	6	90486	90491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016822	ATT	2	6	90544	90549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016822	GAT	2	6	90626	90631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016822	CAA	2	6	90668	90673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016822	TTC	2	6	90813	90818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016822	ATT	2	6	90822	90827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016822	TAT	2	6	91974	91979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016822	GGA	2	6	91999	92004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016822	TCC	2	6	92027	92032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_016822	TTA	2	6	92042	92047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016822	TGC	2	6	95596	95601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016822	ATG	2	6	95621	95626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016822	TAT	2	6	96420	96425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016822	AAT	2	6	96478	96483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016822	ATT	2	6	96511	96516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016822	TGA	2	6	96709	96714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016822	TGC	2	6	96756	96761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016822	AAC	2	6	96781	96786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016822	TCC	2	6	96854	96859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016822	AAG	2	6	108039	108044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016822	CGA	2	6	112552	112557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_016822	ATA	2	6	209076	209081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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