MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016822	ATT	2	6	1427596	1427601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016822	CAA	2	6	1427631	1427636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016822	TAA	2	6	1427672	1427677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016822	TGC	2	6	1427684	1427689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016822	AAAAC	2	10	1427690	1427699	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_016822	TGAG	2	8	1427729	1427736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016822	CCG	2	6	1428000	1428005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_016822	GTCAC	2	10	1428399	1428408	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4009	NC_016822	A	6	6	1430941	1430946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016822	TAA	2	6	1430947	1430952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016822	TGC	2	6	1430971	1430976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_016822	AGGA	2	8	1430977	1430984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016822	T	6	6	1431002	1431007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016822	A	6	6	1431012	1431017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016822	TCA	2	6	1431030	1431035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016822	AAC	2	6	1431728	1431733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016822	AAGG	2	8	1433165	1433172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016822	GCG	2	6	1433196	1433201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016822	CAT	2	6	1433945	1433950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_016822	GCA	2	6	1433970	1433975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016822	GGGGA	2	10	1434112	1434121	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016822	GTAATA	2	12	1434131	1434142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016822	ATGT	2	8	1435743	1435750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016822	C	6	6	1437102	1437107	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4025	NC_016822	TAC	2	6	1437109	1437114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_016822	TTC	2	6	1439204	1439209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_016822	A	6	6	1439218	1439223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016822	GAAT	2	8	1441187	1441194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016822	AT	3	6	1441217	1441222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016822	TAGA	2	8	1441250	1441257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016822	GT	3	6	1441351	1441356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016822	T	6	6	1441382	1441387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016822	TGAATG	2	12	1441908	1441919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016822	AATGG	2	10	1441932	1441941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016822	TAG	2	6	1441964	1441969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016822	AT	4	8	1442002	1442009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016822	ATAA	2	8	1442071	1442078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016822	GTA	2	6	1442083	1442088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016822	ATAA	2	8	1442174	1442181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016822	TTAA	2	8	1442205	1442212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016822	CT	3	6	1442219	1442224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_016822	GA	3	6	1442228	1442233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016822	AAC	2	6	1442808	1442813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_016822	TTA	2	6	1443441	1443446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016822	ATTA	2	8	1443474	1443481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016822	ATT	2	6	1443493	1443498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016822	TTA	2	6	1443972	1443977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016822	A	7	7	1444015	1444021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016822	TCCAT	2	10	1444078	1444087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_016822	TTTC	2	8	1444101	1444108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_016822	TAC	2	6	1444148	1444153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_016822	TCG	2	6	1444154	1444159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016822	CTC	2	6	1444164	1444169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_016822	GTA	2	6	1444170	1444175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016822	TAC	2	6	1444229	1444234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_016822	ACT	2	6	1444339	1444344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_016822	ATG	2	6	1444345	1444350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016822	T	6	6	1444390	1444395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016822	AG	3	6	1444415	1444420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016822	ATTT	2	8	1445172	1445179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016822	GA	3	6	1445245	1445250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016822	AAT	2	6	1445729	1445734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016822	T	6	6	1445736	1445741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016822	ACT	2	6	1445788	1445793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_016822	GAT	2	6	1445815	1445820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016822	AT	4	8	1445850	1445857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016822	TA	3	6	1445871	1445876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016822	GTTA	2	8	1445934	1445941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016822	AGT	2	6	1446657	1446662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016822	TTG	2	6	1446758	1446763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016822	CTC	2	6	1447105	1447110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_016822	TA	3	6	1447123	1447128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016822	CAGT	2	8	1447141	1447148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_016822	ACA	2	6	1449599	1449604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_016822	TAGT	2	8	1450714	1450721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016822	TGA	2	6	1451193	1451198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016822	TCA	2	6	1451212	1451217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016822	CAA	2	6	1451224	1451229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_016822	TCA	2	6	1451247	1451252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_016822	TTAA	2	8	1451261	1451268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016822	ATT	2	6	1451280	1451285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016822	TAT	3	9	1451404	1451412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016822	AAC	2	6	1451420	1451425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_016822	GCC	3	9	1451522	1451530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_016822	TGA	2	6	1451561	1451566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016822	TAA	2	6	1451587	1451592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016822	TGA	2	6	1451606	1451611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016822	AAG	2	6	1451644	1451649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016822	GAT	2	6	1451661	1451666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016822	TA	3	6	1451704	1451709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016822	TG	4	8	1451798	1451805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016822	TAAA	2	8	1452408	1452415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016822	TAC	2	6	1453136	1453141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016822	GTA	2	6	1453193	1453198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016822	GAA	2	6	1453215	1453220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016822	TTC	2	6	1453238	1453243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_016822	CGC	2	6	1454638	1454643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_016822	AAAC	2	8	1454654	1454661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_016822	T	6	6	1463933	1463938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016822	AGA	2	6	1466899	1466904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016822	AAT	2	6	1466939	1466944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016822	GGT	2	6	1466954	1466959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016822	AAT	2	6	1467015	1467020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016822	CTT	2	6	1467042	1467047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_016822	T	7	7	1467046	1467052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016822	AAT	2	6	1467081	1467086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016822	CAT	3	9	1467090	1467098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_016822	CCA	2	6	1467200	1467205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_016822	TTG	2	6	1467227	1467232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016822	CAT	2	6	1467267	1467272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_016822	CTTT	2	8	1467278	1467285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_016822	AAC	2	6	1467326	1467331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016822	A	8	8	1467373	1467380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016822	TAAA	3	12	1467397	1467408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016822	AGA	2	6	1467412	1467417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016822	GTG	2	6	1470855	1470860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016822	TGC	2	6	1470883	1470888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_016822	AAAT	2	8	1470913	1470920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016822	ATA	2	6	1470984	1470989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016822	TGT	2	6	1474355	1474360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016822	ATT	2	6	1474916	1474921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016822	GAA	2	6	1475030	1475035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016822	ACAATA	5	30	1476015	1476044	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4124	NC_016822	ACA	2	6	1476045	1476050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_016822	TAA	2	6	1478512	1478517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016822	GATTT	2	10	1478532	1478541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016822	AT	3	6	1479347	1479352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016822	T	7	7	1479371	1479377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016822	GTT	2	6	1479381	1479386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016822	TTC	2	6	1479401	1479406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_016822	TAT	2	6	1479437	1479442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016822	CGT	2	6	1479827	1479832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016822	A	6	6	1479839	1479844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016822	TAG	2	6	1480605	1480610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_016822	TAG	2	6	1480687	1480692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_016822	A	7	7	1519144	1519150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4391	NC_016822	TGCG	2	8	1550967	1550974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4392	NC_016822	TGT	2	6	1550993	1550998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4394	NC_016822	TGG	2	6	1551040	1551045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4397	NC_016822	GGC	2	6	1552803	1552808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_016822	CTGA	2	8	1552823	1552830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4399	NC_016822	CATGC	2	10	1557320	1557329	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4400	NC_016822	TGCC	2	8	1557458	1557465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4431	NC_016822	ATTA	2	8	1575570	1575577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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