MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016822	GCTG	2	8	1134761	1134768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_016822	CAA	2	6	1134771	1134776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_016822	CAG	2	6	1134778	1134783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016822	TGT	2	6	1134794	1134799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016822	GTTT	2	8	1134825	1134832	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016822	TCG	2	6	1134833	1134838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016822	CCTGA	2	10	1135049	1135058	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3008	NC_016822	CCA	2	6	1135083	1135088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_016822	C	6	6	1135104	1135109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3010	NC_016822	GAC	2	6	1135118	1135123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016822	CTGG	2	8	1135147	1135154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_016822	GGGGTA	2	12	1135191	1135202	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016822	TA	4	8	1135201	1135208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016822	G	6	6	1135211	1135216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016822	AACTT	2	10	1135298	1135307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_016822	GTT	2	6	1136080	1136085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016822	CAAT	2	8	1137736	1137743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_016822	GATG	2	8	1137796	1137803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016822	CGAT	2	8	1137835	1137842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_016822	AGT	2	6	1137859	1137864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016822	A	7	7	1137874	1137880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016822	AAG	2	6	1137892	1137897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016822	AG	3	6	1137992	1137997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016822	GGA	2	6	1138014	1138019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016822	TAAGA	2	10	1138102	1138111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016822	AG	3	6	1138112	1138117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016822	TTA	2	6	1138143	1138148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016822	AAG	2	6	1138209	1138214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016822	AG	3	6	1138213	1138218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016822	GAA	2	6	1138223	1138228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016822	ATTA	2	8	1138290	1138297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016822	TATT	2	8	1138368	1138375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016822	TCGCT	2	10	1138422	1138431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3034	NC_016822	TCT	2	6	1138473	1138478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_016822	AAC	2	6	1138503	1138508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_016822	GAA	2	6	1138510	1138515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016822	TAA	2	6	1138533	1138538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016822	CTG	2	6	1139996	1140001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_016822	CA	3	6	1140064	1140069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_016822	CAGT	2	8	1140586	1140593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_016822	TCTCT	2	10	1140677	1140686	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_016822	TAT	2	6	1140708	1140713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016822	GCT	2	6	1140767	1140772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016822	AAG	2	6	1140787	1140792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016822	GGC	2	6	1140810	1140815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016822	CGA	2	6	1140842	1140847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016822	GTTTC	2	10	1140852	1140861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3048	NC_016822	AAG	2	6	1140934	1140939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016822	AG	3	6	1140989	1140994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016822	TGTA	2	8	1142021	1142028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016822	T	6	6	1142037	1142042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016822	AAT	2	6	1142103	1142108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016822	TG	3	6	1142135	1142140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016822	TGC	2	6	1144486	1144491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3056	NC_016822	TGA	2	6	1145249	1145254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016822	ATG	2	6	1145317	1145322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016822	CT	3	6	1146449	1146454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_016822	GTCAT	2	10	1146546	1146555	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3060	NC_016822	TAAG	2	8	1146893	1146900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016822	G	6	6	1146922	1146927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016822	TCAT	2	8	1146978	1146985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_016822	T	7	7	1146987	1146993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016822	ATT	2	6	1147007	1147012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016822	GTAA	2	8	1147047	1147054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016822	A	6	6	1147058	1147063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016822	CAAAAA	2	12	1147079	1147090	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3068	NC_016822	TTAT	2	8	1147372	1147379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016822	ACA	2	6	1147400	1147405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3073	NC_016822	CGG	2	6	1149224	1149229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_016822	T	7	7	1151267	1151273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_016822	AAT	2	6	1151316	1151321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016822	GCCT	2	8	1153652	1153659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_016822	TGCAG	2	10	1155249	1155258	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3083	NC_016822	ATA	2	6	1155266	1155271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016822	TTAT	2	8	1156027	1156034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_016822	CG	4	8	1156821	1156828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_016822	GGA	2	6	1156868	1156873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016822	AGTC	2	8	1158425	1158432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3091	NC_016822	AAG	2	6	1160536	1160541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_016822	GC	3	6	1160691	1160696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_016822	ACC	2	6	1160758	1160763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_016822	CAA	2	6	1160847	1160852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_016822	AGGGC	2	10	1160874	1160883	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_016822	TCA	2	6	1160911	1160916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_016822	TGG	2	6	1160963	1160968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016822	CAGC	2	8	1160979	1160986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_016822	CAA	2	6	1161051	1161056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_016822	CAC	2	6	1161095	1161100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016822	ATGA	2	8	1161105	1161112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016822	CGAA	2	8	1161172	1161179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_016822	CTG	2	6	1161207	1161212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_016822	CGG	2	6	1164167	1164172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_016822	ATA	2	6	1164183	1164188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016822	CTGC	2	8	1166869	1166876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_016822	T	7	7	1166899	1166905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016822	TTG	2	6	1166918	1166923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_016822	TAA	2	6	1170704	1170709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3121	NC_016822	T	7	7	1172438	1172444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016822	TGA	2	6	1172463	1172468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3124	NC_016822	ATT	2	6	1172560	1172565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016822	GC	3	6	1172626	1172631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_016822	GAG	2	6	1173194	1173199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016822	TGA	2	6	1173395	1173400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_016822	GCG	2	6	1173448	1173453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_016822	TA	3	6	1174572	1174577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016822	GC	3	6	1177273	1177278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_016822	TAA	2	6	1177297	1177302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016822	G	6	6	1177328	1177333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016822	T	6	6	1177755	1177760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_016822	CCCT	2	8	1177761	1177768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3250	NC_016822	CTGA	2	8	1223854	1223861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3256	NC_016822	T	7	7	1224247	1224253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_016822	CCG	2	6	1224279	1224284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3259	NC_016822	TCA	2	6	1224457	1224462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_016822	CAAAT	2	10	1224534	1224543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3261	NC_016822	ATTCC	2	10	1224545	1224554	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3262	NC_016822	CAG	2	6	1224591	1224596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3393	NC_016822	T	7	7	1243612	1243618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3397	NC_016822	AAT	2	6	1243775	1243780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3398	NC_016822	ATT	3	9	1243812	1243820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_016822	TTG	2	6	1246233	1246238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_016822	TCT	2	6	1246260	1246265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3401	NC_016822	A	8	8	1246272	1246279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_016822	CATC	2	8	1246281	1246288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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