MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016822	CTG	2	6	1008806	1008811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016822	CGC	2	6	1011726	1011731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_016822	GATGC	2	10	1011757	1011766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2504	NC_016822	TCT	2	6	1013924	1013929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_016822	CT	3	6	1016073	1016078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_016822	T	7	7	1016097	1016103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016822	GA	3	6	1016137	1016142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016822	AAAG	2	8	1016193	1016200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016822	TA	3	6	1016206	1016211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016822	ATTT	2	8	1016220	1016227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_016822	ATT	2	6	1016355	1016360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016822	TTA	3	9	1016362	1016370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_016822	TGC	2	6	1016399	1016404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_016822	ATG	2	6	1016424	1016429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016822	GAT	2	6	1017194	1017199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016822	ATTA	2	8	1017767	1017774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016822	T	6	6	1017809	1017814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016822	AG	3	6	1018545	1018550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016822	ACA	2	6	1018572	1018577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_016822	TGG	2	6	1018593	1018598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_016822	TGG	2	6	1018614	1018619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016822	TGG	2	6	1018622	1018627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016822	T	6	6	1018680	1018685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016822	GAT	2	6	1018690	1018695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016822	TGG	2	6	1018703	1018708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016822	A	6	6	1018736	1018741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016822	TTG	2	6	1018811	1018816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_016822	GCC	2	6	1018840	1018845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_016822	GAC	2	6	1018851	1018856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_016822	AAC	2	6	1018907	1018912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_016822	ACAA	2	8	1018916	1018923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_016822	GT	3	6	1018926	1018931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_016822	ATT	2	6	1018945	1018950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_016822	C	6	6	1019043	1019048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2535	NC_016822	AGC	2	6	1019119	1019124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_016822	CAA	2	6	1019199	1019204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_016822	AGT	2	6	1019221	1019226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016822	GAA	2	6	1019244	1019249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_016822	CAG	2	6	1019253	1019258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_016822	GCGG	2	8	1019268	1019275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_016822	TGA	2	6	1019307	1019312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016822	T	6	6	1019328	1019333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_016822	GTG	2	6	1019351	1019356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016822	ACA	2	6	1019375	1019380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_016822	TGC	2	6	1019381	1019386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_016822	CGT	2	6	1019528	1019533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_016822	AAG	2	6	1019561	1019566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_016822	CAG	2	6	1019683	1019688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_016822	ATGGT	2	10	1019742	1019751	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_016822	GCC	2	6	1019779	1019784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_016822	TTCG	2	8	1019826	1019833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_016822	GTCA	2	8	1019882	1019889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2553	NC_016822	ATGG	2	8	1020004	1020011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_016822	TGA	3	9	1020030	1020038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_016822	TTA	2	6	1020060	1020065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_016822	TTTA	2	8	1020137	1020144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_016822	ACA	2	6	1020206	1020211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_016822	TC	3	6	1020225	1020230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_016822	G	6	6	1020234	1020239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016822	A	7	7	1020355	1020361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016822	ACT	2	6	1020437	1020442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_016822	CAA	3	9	1020582	1020590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_016822	GCA	2	6	1020678	1020683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_016822	ACTG	2	8	1020729	1020736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_016822	CTT	2	6	1020766	1020771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_016822	AATCG	2	10	1020780	1020789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_016822	AACGT	2	10	1020811	1020820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_016822	AGT	2	6	1020836	1020841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_016822	CCA	2	6	1020853	1020858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_016822	ATT	2	6	1020990	1020995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_016822	GAT	3	9	1020996	1021004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_016822	GCTC	2	8	1021006	1021013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_016822	AAC	2	6	1021105	1021110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_016822	T	8	8	1024019	1024026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_016822	ATA	2	6	1024063	1024068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_016822	GTT	2	6	1025171	1025176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_016822	TTG	2	6	1025220	1025225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_016822	TTA	2	6	1025229	1025234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_016822	AGCGA	2	10	1025235	1025244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2580	NC_016822	TGC	2	6	1025258	1025263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_016822	TAGGG	2	10	1025271	1025280	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_016822	ATGAC	2	10	1026975	1026984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2583	NC_016822	TTA	2	6	1026989	1026994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_016822	CAA	2	6	1027006	1027011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_016822	TATTT	2	10	1027038	1027047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_016822	TGTCCA	2	12	1027114	1027125	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_016822	GACT	2	8	1027126	1027133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2588	NC_016822	CAA	2	6	1027135	1027140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_016822	TGA	2	6	1031260	1031265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_016822	CAT	2	6	1031321	1031326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_016822	T	7	7	1034847	1034853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016822	GTT	2	6	1034874	1034879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_016822	T	6	6	1034890	1034895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_016822	TTTTC	2	10	1035013	1035022	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2595	NC_016822	TTATT	2	10	1035823	1035832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_016822	T	6	6	1037646	1037651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016822	TGT	2	6	1037656	1037661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_016822	TTCTT	2	10	1037756	1037765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2599	NC_016822	A	8	8	1038307	1038314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_016822	GCA	2	6	1038319	1038324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_016822	ATC	2	6	1039407	1039412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_016822	A	8	8	1039581	1039588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_016822	T	6	6	1039613	1039618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_016822	AGA	2	6	1039635	1039640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_016822	A	7	7	1039714	1039720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_016822	AATC	2	8	1040256	1040263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_016822	GTACA	2	10	1040290	1040299	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2608	NC_016822	ACA	2	6	1040307	1040312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_016822	TTATG	2	10	1040447	1040456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_016822	GGC	2	6	1043717	1043722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_016822	T	7	7	1043733	1043739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016822	AAT	2	6	1043780	1043785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_016822	AAT	3	9	1047137	1047145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016822	TACT	2	8	1047169	1047176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_016822	TCAT	2	8	1047207	1047214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_016822	GGA	2	6	1047272	1047277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_016822	GAT	2	6	1048177	1048182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016822	CGGC	2	8	1048221	1048228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_016822	GAT	2	6	1048247	1048252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_016822	AAAT	2	8	1048259	1048266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_016822	TCA	2	6	1048273	1048278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_016822	TTCA	2	8	1048313	1048320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_016822	CAA	2	6	1048390	1048395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_016822	CGG	2	6	1048400	1048405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_016822	CGCGAT	2	12	1048435	1048446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_016822	GCA	2	6	1048453	1048458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_016822	CAT	2	6	1048468	1048473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_016822	AGG	2	6	1048549	1048554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_016822	ACC	2	6	1048607	1048612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_016822	GCG	2	6	1048655	1048660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_016822	GGC	2	6	1048669	1048674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_016822	GTA	2	6	1048691	1048696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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