MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016822	GGA	2	6	236765	236770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016822	AGA	2	6	236812	236817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016822	CAG	2	6	236838	236843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016822	G	6	6	236985	236990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016822	GGA	2	6	237029	237034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016822	GGC	2	6	237049	237054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016822	GAA	2	6	237292	237297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016822	TGC	2	6	237368	237373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016822	GTC	2	6	237380	237385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016822	TTG	2	6	237441	237446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016822	CCGG	2	8	237455	237462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_016822	GGA	2	6	237493	237498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016822	TCA	2	6	237518	237523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016822	AC	3	6	237544	237549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_016822	CGT	2	6	237612	237617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016822	AC	3	6	237713	237718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_016822	GTAG	2	8	237754	237761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016822	CCT	2	6	237854	237859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016822	AAG	2	6	237867	237872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016822	CA	3	6	237889	237894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_016822	TGA	2	6	237902	237907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016822	GGT	2	6	237944	237949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016822	GGT	2	6	237979	237984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016822	AGG	2	6	238089	238094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016822	CCA	2	6	238119	238124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_016822	TAAA	2	8	238138	238145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016822	A	6	6	238143	238148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016822	GTT	2	6	238240	238245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016822	TC	3	6	238252	238257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_016822	GAT	2	6	238273	238278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016822	GCG	2	6	238552	238557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016822	AGC	2	6	238569	238574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016822	GT	5	10	238590	238599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016822	GC	3	6	238620	238625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_016822	G	6	6	238713	238718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016822	TCC	2	6	238723	238728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_016822	CTGA	2	8	238743	238750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_016822	GTAC	2	8	238827	238834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_016822	GGA	2	6	239032	239037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016822	AC	3	6	239250	239255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_016822	CGTC	2	8	239268	239275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_016822	AAC	2	6	239287	239292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016822	AGC	2	6	239377	239382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016822	CAT	2	6	239383	239388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016822	AAAG	2	8	239391	239398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016822	GTT	2	6	239486	239491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016822	G	6	6	239728	239733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016822	TGA	2	6	239827	239832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016822	CAA	2	6	239854	239859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016822	GGT	2	6	239926	239931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016822	GA	3	6	239956	239961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016822	GCTG	2	8	240070	240077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_016822	TTA	2	6	240085	240090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016822	CGG	2	6	240209	240214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016822	ATG	2	6	240285	240290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016822	ACC	2	6	240480	240485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_016822	TGG	2	6	240540	240545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016822	TCC	2	6	240566	240571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016822	GGA	2	6	240583	240588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016822	AGG	2	6	240621	240626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016822	GGT	2	6	240703	240708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016822	CGG	2	6	240790	240795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016822	TCA	2	6	240818	240823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016822	CGT	2	6	240898	240903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016822	G	6	6	240947	240952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016822	GAC	3	9	241129	241137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016822	GT	3	6	241151	241156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016822	GA	3	6	241238	241243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016822	GGC	2	6	241309	241314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016822	GGT	2	6	241323	241328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016822	GAA	2	6	241432	241437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016822	ACT	2	6	241462	241467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016822	AG	3	6	241473	241478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016822	GGT	2	6	241593	241598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016822	CCTG	2	8	241642	241649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_016822	CCGT	2	8	241677	241684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016822	TTA	2	6	241693	241698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016822	T	8	8	241724	241731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016822	TAT	2	6	241744	241749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016822	ATTT	2	8	243605	243612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016822	AAT	2	6	243662	243667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016822	A	6	6	245239	245244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016822	T	6	6	245266	245271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016822	GAC	2	6	246668	246673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016822	GCA	2	6	249530	249535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016822	CCTG	2	8	249646	249653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_016822	G	6	6	249661	249666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016822	CCGT	2	8	249681	249688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_016822	T	7	7	249748	249754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016822	TTC	2	6	249773	249778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_016822	AT	3	6	249872	249877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016822	TA	4	8	249920	249927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016822	TGTT	2	8	249938	249945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016822	TA	3	6	249961	249966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016822	GCC	2	6	250823	250828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_016822	ATA	2	6	250846	250851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016822	TGTT	2	8	250926	250933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016822	ACAT	2	8	251461	251468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_016822	AAC	2	6	251586	251591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_016822	AC	3	6	251595	251600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_016822	CTC	2	6	251621	251626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_016822	AAG	2	6	251666	251671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016822	ACC	2	6	251697	251702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_016822	ATA	2	6	251773	251778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016822	CTC	2	6	251849	251854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016822	GCCA	2	8	251855	251862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_016822	AT	3	6	251902	251907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016822	TGT	2	6	251940	251945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016822	TA	3	6	251952	251957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016822	TC	3	6	251960	251965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_016822	TCA	2	6	252034	252039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016822	TAAC	2	8	252065	252072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_016822	AATG	2	8	252116	252123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016822	ATG	2	6	252131	252136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016822	T	33	33	252152	252184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016822	ATG	2	6	252211	252216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016822	TCA	2	6	252236	252241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016822	CGT	2	6	252252	252257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016822	C	6	6	252300	252305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
620	NC_016822	GAA	2	6	252306	252311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016822	TG	3	6	252344	252349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016822	TTG	2	6	252350	252355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016822	TC	3	6	252380	252385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_016822	TAT	2	6	252399	252404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016822	TTA	2	6	252406	252411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016822	CCT	2	6	254283	254288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_016822	GT	3	6	254296	254301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016822	AAC	2	6	254322	254327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016822	GCGCG	2	10	254489	254498	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
630	NC_016822	TGT	2	6	254548	254553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016822	CCAGA	2	10	254558	254567	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
632	NC_016822	ACTG	2	8	254605	254612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016822	GCG	2	6	254630	254635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016822	GAA	2	6	254699	254704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016822	AAT	2	6	254741	254746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016822	AAT	2	6	254756	254761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016822	GTT	2	6	254765	254770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016822	TCC	2	6	254778	254783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_016822	CTG	2	6	254819	254824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_016822	CAC	2	6	254945	254950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_016822	CCA	2	6	254989	254994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_016822	CAC	2	6	254996	255001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_016822	AGTC	3	12	255013	255024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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649	NC_016822	TCC	2	6	255315	255320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_016822	TAAA	2	8	286992	286999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NC_016822	A	6	6	286997	287002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_016822	AAC	2	6	323746	323751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
917	NC_016822	AAG	2	6	324636	324641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
918	NC_016822	TAA	2	6	324661	324666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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921	NC_016822	TTTTCT	2	12	326150	326161	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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923	NC_016822	ATTAG	2	10	326207	326216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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931	NC_016822	ATT	2	6	327316	327321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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943	NC_016822	CT	3	6	330718	330723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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948	NC_016822	CT	3	6	331564	331569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
949	NC_016822	CCT	2	6	333297	333302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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952	NC_016822	ATTG	2	8	335424	335431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_016822	TGA	2	6	338344	338349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_016822	CT	3	6	341975	341980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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971	NC_016822	AAC	2	6	349577	349582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
972	NC_016822	ATC	2	6	352083	352088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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