MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_016822	TCA	2	6	2635267	2635272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_016822	T	6	6	2635318	2635323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_016822	CCTA	2	8	2635347	2635354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7504	NC_016822	T	6	6	2635367	2635372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_016822	CAG	2	6	2635873	2635878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_016822	A	6	6	2639021	2639026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_016822	CGG	2	6	2639039	2639044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_016822	A	6	6	2639615	2639620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_016822	CTC	2	6	2651466	2651471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7510	NC_016822	AG	3	6	2651475	2651480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_016822	A	7	7	2652530	2652536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_016822	A	7	7	2652543	2652549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_016822	GGC	2	6	2652558	2652563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_016822	TGA	2	6	2652570	2652575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_016822	CTTT	2	8	2658549	2658556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7516	NC_016822	TAAA	2	8	2658570	2658577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_016822	GAA	3	9	2658594	2658602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_016822	CG	3	6	2658647	2658652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_016822	ATA	2	6	2658701	2658706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_016822	ATC	2	6	2658710	2658715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_016822	AAT	2	6	2658756	2658761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_016822	AAC	2	6	2658813	2658818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_016822	TAC	2	6	2659146	2659151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_016822	TTC	2	6	2659579	2659584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_016822	ATG	2	6	2659609	2659614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_016822	ATT	2	6	2659655	2659660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_016822	CGA	2	6	2659725	2659730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_016822	ATG	2	6	2661075	2661080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_016822	AGTTA	2	10	2661120	2661129	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_016822	GCT	2	6	2661207	2661212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_016822	CTG	2	6	2661254	2661259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_016822	AAC	2	6	2661264	2661269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_016822	CCA	2	6	2661315	2661320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_016822	T	6	6	2661330	2661335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_016822	AGG	2	6	2661346	2661351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_016822	GTT	2	6	2661400	2661405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_016822	TGG	2	6	2661425	2661430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7539	NC_016822	A	7	7	2662434	2662440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_016822	TAC	2	6	2663649	2663654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_016822	A	6	6	2663721	2663726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_016822	CGG	2	6	2663744	2663749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_016822	TG	3	6	2663758	2663763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_016822	TGC	2	6	2663804	2663809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_016822	ATG	2	6	2663829	2663834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_016822	T	6	6	2664571	2664576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_016822	ACGT	2	8	2664577	2664584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7548	NC_016822	CAA	2	6	2664657	2664662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_016822	CAA	2	6	2664668	2664673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_016822	ATTT	2	8	2664768	2664775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_016822	A	6	6	2664811	2664816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_016822	AAT	2	6	2664879	2664884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_016822	CAT	2	6	2664919	2664924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_016822	T	6	6	2664924	2664929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_016822	AAT	2	6	2664930	2664935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_016822	A	7	7	2664941	2664947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_016822	TA	3	6	2666139	2666144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_016822	TA	3	6	2666155	2666160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_016822	TAA	2	6	2666200	2666205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_016822	CAA	2	6	2666661	2666666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_016822	TGA	2	6	2668169	2668174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_016822	GTT	2	6	2668227	2668232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_016822	GATT	2	8	2668259	2668266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_016822	ATT	2	6	2669246	2669251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_016822	TAT	2	6	2669255	2669260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_016822	CTT	2	6	2669261	2669266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_016822	TGC	2	6	2669281	2669286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_016822	ATG	2	6	2669306	2669311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_016822	CCT	2	6	2669356	2669361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_016822	T	6	6	2672287	2672292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_016822	AGGT	2	8	2672299	2672306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7574	NC_016822	TAA	2	6	2673638	2673643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_016822	TCAT	2	8	2673662	2673669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_016822	GTC	2	6	2673730	2673735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7578	NC_016822	TG	3	6	2673836	2673841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_016822	TCA	2	6	2673874	2673879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_016822	TGC	2	6	2673945	2673950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_016822	GGC	2	6	2674026	2674031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_016822	GATT	2	8	2674036	2674043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_016822	T	6	6	2674053	2674058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_016822	GCA	2	6	2674349	2674354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7586	NC_016822	TGC	2	6	2674834	2674839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7588	NC_016822	GTTGG	2	10	2674881	2674890	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_016822	A	6	6	2674955	2674960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_016822	TA	3	6	2675604	2675609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_016822	CGAT	2	8	2675689	2675696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_016822	TGA	2	6	2675704	2675709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7597	NC_016822	TCG	2	6	2676552	2676557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_016822	TC	4	8	2676562	2676569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7599	NC_016822	AACG	2	8	2676615	2676622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7600	NC_016822	ACC	3	9	2676697	2676705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7601	NC_016822	AT	3	6	2676764	2676769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_016822	GC	3	6	2678538	2678543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7603	NC_016822	T	7	7	2680066	2680072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7605	NC_016822	GTTAAC	2	12	2680236	2680247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7606	NC_016822	GAT	2	6	2680272	2680277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7608	NC_016822	CAATA	2	10	2682802	2682811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7609	NC_016822	A	6	6	2682811	2682816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_016822	AAT	2	6	2682821	2682826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_016822	AAGT	2	8	2682885	2682892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_016822	GAA	2	6	2682924	2682929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_016822	GCA	2	6	2684526	2684531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_016822	TGC	2	6	2684558	2684563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_016822	CCT	2	6	2684608	2684613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_016822	TAT	2	6	2687323	2687328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_016822	TGAAT	2	10	2687355	2687364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_016822	ATTC	2	8	2687374	2687381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7619	NC_016822	A	8	8	2687453	2687460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7622	NC_016822	CATTT	2	10	2687583	2687592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7623	NC_016822	TAC	2	6	2687693	2687698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7625	NC_016822	A	6	6	2693166	2693171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_016822	TAA	2	6	2695937	2695942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_016822	TTAA	2	8	2697253	2697260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_016822	TTTA	2	8	2697279	2697286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_016822	ATAA	2	8	2697303	2697310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_016822	ATT	2	6	2697372	2697377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7632	NC_016822	AGA	2	6	2697427	2697432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7634	NC_016822	AAG	2	6	2697502	2697507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7845	NC_016822	GCG	2	6	2761616	2761621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7861	NC_016822	TAA	2	6	2771891	2771896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7862	NC_016822	T	6	6	2771954	2771959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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