MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016810	CGC	2	6	1418538	1418543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_016810	GCG	2	6	1418554	1418559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016810	GTT	2	6	1418576	1418581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016810	GT	3	6	1420866	1420871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016810	GGCAG	2	10	1420872	1420881	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_016810	ATA	2	6	1420903	1420908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016810	TGT	2	6	1422924	1422929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016810	AAT	2	6	1422990	1422995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016810	AT	3	6	1423065	1423070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016810	CGA	2	6	1423170	1423175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016810	CAA	2	6	1428041	1428046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_016810	A	6	6	1428086	1428091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016810	GAT	2	6	1428096	1428101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016810	TTG	3	9	1428159	1428167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016810	ACA	2	6	1428175	1428180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016810	AGA	2	6	1430624	1430629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016810	CGA	2	6	1430657	1430662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016810	GGCG	2	8	1430941	1430948	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_016810	CCG	2	6	1430955	1430960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_016810	ACG	2	6	1431960	1431965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016810	T	7	7	1432024	1432030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016810	T	8	8	1432050	1432057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016810	GAA	2	6	1432092	1432097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016810	CTA	2	6	1432867	1432872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016810	GAT	2	6	1432945	1432950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016810	TCA	2	6	1432975	1432980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_016810	TGC	2	6	1433660	1433665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_016810	ATA	2	6	1433682	1433687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016810	TCA	2	6	1436518	1436523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016810	AT	3	6	1436568	1436573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016810	TAA	2	6	1436602	1436607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016810	TTTA	2	8	1436635	1436642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016810	ATAA	2	8	1436643	1436650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016810	AAG	2	6	1436770	1436775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016810	AAAT	2	8	1436786	1436793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016810	CCA	2	6	1440214	1440219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_016810	GC	3	6	1440255	1440260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_016810	GTA	2	6	1440279	1440284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016810	GCC	2	6	1440318	1440323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_016810	GCG	2	6	1440328	1440333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_016810	TTAG	2	8	1440412	1440419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016810	TATC	2	8	1440429	1440436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_016810	ATG	2	6	1440453	1440458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016810	CAAT	2	8	1444365	1444372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_016810	TA	3	6	1446307	1446312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016810	TATT	2	8	1446366	1446373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016810	TTA	2	6	1446607	1446612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016810	CGA	2	6	1446614	1446619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_016810	TGC	2	6	1446631	1446636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_016810	TCA	2	6	1450137	1450142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_016810	ATA	2	6	1455543	1455548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016810	ATA	2	6	1455559	1455564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016810	GA	3	6	1455584	1455589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016810	CTT	2	6	1458356	1458361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_016810	GA	3	6	1458422	1458427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016810	AAT	2	6	1458433	1458438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016810	TAT	2	6	1458471	1458476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016810	CCA	2	6	1458532	1458537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_016810	GGT	2	6	1458544	1458549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016810	ATG	2	6	1458582	1458587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016810	CCA	2	6	1458619	1458624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_016810	GGT	2	6	1458631	1458636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016810	TTC	2	6	1458734	1458739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016810	GCC	2	6	1458788	1458793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_016810	TCG	2	6	1458806	1458811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_016810	TGT	2	6	1460205	1460210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016810	GCC	2	6	1460229	1460234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_016810	A	6	6	1460307	1460312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016810	GTT	2	6	1460315	1460320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016810	TATT	2	8	1460381	1460388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016810	T	6	6	1462286	1462291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016810	GAG	2	6	1462356	1462361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016810	CCAT	2	8	1462377	1462384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_016810	TAA	2	6	1462420	1462425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016810	AAC	2	6	1462439	1462444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016810	TGA	2	6	1462471	1462476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016810	TCTT	2	8	1463740	1463747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_016810	CAGA	2	8	1463750	1463757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_016810	AC	4	8	1465856	1465863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_016810	GA	3	6	1466018	1466023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016810	TG	3	6	1466065	1466070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016810	TGA	2	6	1466091	1466096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016810	TAC	2	6	1466122	1466127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_016810	CT	3	6	1466187	1466192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_016810	CT	3	6	1466224	1466229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_016810	TC	3	6	1466851	1466856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_016810	TTA	3	9	1466858	1466866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016810	GCAC	2	8	1466874	1466881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_016810	AGA	2	6	1466934	1466939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016810	A	7	7	1467926	1467932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016810	ATA	2	6	1468033	1468038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016810	ATG	2	6	1468043	1468048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016810	AGT	2	6	1468107	1468112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016810	T	6	6	1468511	1468516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016810	GCG	2	6	1468536	1468541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_016810	A	6	6	1469219	1469224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016810	TAT	2	6	1469234	1469239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016810	AAC	2	6	1469267	1469272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016810	CGG	2	6	1469292	1469297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_016810	GCG	2	6	1469749	1469754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_016810	GTC	2	6	1470901	1470906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_016810	TAA	2	6	1470910	1470915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016810	GCAG	2	8	1471535	1471542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_016810	TAG	2	6	1471545	1471550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016810	CTA	2	6	1471561	1471566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_016810	GAG	2	6	1471625	1471630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016810	ATT	2	6	1471902	1471907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016810	A	6	6	1476622	1476627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016810	ATA	2	6	1476702	1476707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016810	TTC	2	6	1477702	1477707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_016810	TCT	2	6	1477771	1477776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_016810	TTAA	2	8	1477808	1477815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016810	GAC	2	6	1477868	1477873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016810	A	6	6	1477879	1477884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016810	CCAC	2	8	1479527	1479534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4116	NC_016810	ATT	2	6	1479537	1479542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016810	CCG	2	6	1480253	1480258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_016810	GCT	2	6	1482539	1482544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016810	A	9	9	1483248	1483256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016810	TGT	2	6	1483285	1483290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016810	T	6	6	1484817	1484822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016810	TGA	2	6	1484855	1484860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016810	TCCG	2	8	1484871	1484878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_016810	TAA	2	6	1484945	1484950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016810	TTC	2	6	1485014	1485019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016810	GAA	2	6	1485024	1485029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016810	TCT	2	6	1485081	1485086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_016810	A	6	6	1485127	1485132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016810	GATA	2	8	1485244	1485251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016810	T	6	6	1485255	1485260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016810	A	7	7	1485267	1485273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016810	TGAT	2	8	1485338	1485345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_016810	A	6	6	1533729	1533734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_016810	ATT	2	6	1536297	1536302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_016810	ATG	2	6	1536312	1536317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_016810	ATT	2	6	1536346	1536351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_016810	AGG	3	9	1536392	1536400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_016810	ATG	2	6	1536778	1536783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4287	NC_016810	GAAA	2	8	1542035	1542042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_016810	CTGG	2	8	1542140	1542147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4289	NC_016810	CCTT	2	8	1542196	1542203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4294	NC_016810	ATT	2	6	1542363	1542368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_016810	GGC	2	6	1542428	1542433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4297	NC_016810	G	6	6	1542552	1542557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4298	NC_016810	TGG	2	6	1542559	1542564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4334	NC_016810	A	6	6	1551057	1551062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4335	NC_016810	TATT	2	8	1551114	1551121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4341	NC_016810	AAAAG	2	10	1552605	1552614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4350	NC_016810	ATG	2	6	1557999	1558004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4389	NC_016810	TTAAT	2	10	1571902	1571911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_016810	GCTC	2	8	1572042	1572049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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