MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016810	AAGAGA	2	12	1125359	1125370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016810	A	7	7	1125370	1125376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016810	GC	3	6	1125379	1125384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_016810	TAA	2	6	1126091	1126096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016810	GAT	2	6	1128315	1128320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016810	TTC	2	6	1128439	1128444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016810	GAA	2	6	1128479	1128484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016810	ACGG	2	8	1130526	1130533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_016810	A	6	6	1130543	1130548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016810	GAT	2	6	1131227	1131232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016810	CT	3	6	1131256	1131261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_016810	TAAT	2	8	1131273	1131280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016810	AAT	2	6	1131288	1131293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016810	CGTTTA	2	12	1131340	1131351	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3015	NC_016810	CGT	2	6	1131380	1131385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_016810	GGC	2	6	1131426	1131431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_016810	A	7	7	1131455	1131461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016810	GAA	2	6	1131523	1131528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016810	T	7	7	1131768	1131774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016810	A	6	6	1131821	1131826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016810	CTT	2	6	1132553	1132558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_016810	ATT	2	6	1132580	1132585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016810	AAT	2	6	1132596	1132601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016810	CAA	2	6	1132655	1132660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_016810	TTAT	2	8	1132678	1132685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016810	TTTA	2	8	1132706	1132713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016810	CTT	2	6	1132742	1132747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_016810	CTT	2	6	1133656	1133661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_016810	AGTCA	2	10	1133692	1133701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_016810	AAT	2	6	1133715	1133720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016810	A	7	7	1133721	1133727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016810	TGAGTA	2	12	1133762	1133773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016810	GAT	2	6	1133798	1133803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016810	AAT	2	6	1133843	1133848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016810	AAC	2	6	1136288	1136293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_016810	A	7	7	1136332	1136338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016810	CTT	2	6	1136490	1136495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016810	GT	4	8	1136562	1136569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016810	CT	3	6	1136860	1136865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_016810	ATA	2	6	1136874	1136879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016810	ATT	2	6	1136880	1136885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016810	AT	3	6	1140737	1140742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016810	CGC	2	6	1141268	1141273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_016810	GCG	2	6	1141276	1141281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_016810	TAC	2	6	1141317	1141322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016810	GC	3	6	1141341	1141346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_016810	TGG	2	6	1141381	1141386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016810	CGC	2	6	1141411	1141416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_016810	CGG	2	6	1141439	1141444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_016810	GGT	2	6	1141485	1141490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016810	CCT	2	6	1142036	1142041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_016810	TAA	2	6	1143645	1143650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016810	TGT	2	6	1143664	1143669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016810	CGG	2	6	1143718	1143723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016810	GAA	3	9	1143744	1143752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016810	CGG	2	6	1143804	1143809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_016810	ATT	2	6	1144289	1144294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016810	AAT	2	6	1144303	1144308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016810	TTTA	2	8	1144372	1144379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016810	ATGT	2	8	1144390	1144397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016810	TAA	3	9	1144401	1144409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016810	ATCAC	2	10	1144429	1144438	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3063	NC_016810	AT	3	6	1144494	1144499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016810	GAG	2	6	1144530	1144535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016810	GCGCT	2	10	1148558	1148567	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3066	NC_016810	A	7	7	1148580	1148586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016810	CAG	2	6	1148649	1148654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_016810	A	6	6	1149487	1149492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016810	AGCGC	2	10	1150300	1150309	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3070	NC_016810	GTA	2	6	1150322	1150327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_016810	A	7	7	1152660	1152666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016810	ATG	2	6	1153625	1153630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016810	ATT	2	6	1153686	1153691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016810	T	6	6	1153690	1153695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016810	ACT	2	6	1153702	1153707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3080	NC_016810	AGT	2	6	1153971	1153976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_016810	T	6	6	1154498	1154503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016810	TTAT	2	8	1154510	1154517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016810	GTG	2	6	1154567	1154572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_016810	TGT	2	6	1154628	1154633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016810	TTAT	2	8	1154639	1154646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016810	AG	3	6	1154717	1154722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016810	AT	3	6	1154740	1154745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016810	A	6	6	1154795	1154800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016810	TTTA	2	8	1154820	1154827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016810	GAT	2	6	1154831	1154836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_016810	TAT	2	6	1154945	1154950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016810	CAT	2	6	1156244	1156249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_016810	ATAC	2	8	1156262	1156269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_016810	GTT	2	6	1156365	1156370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016810	GC	3	6	1156392	1156397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_016810	A	6	6	1156880	1156885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016810	AAC	2	6	1160002	1160007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_016810	TCC	2	6	1161530	1161535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016810	TAC	2	6	1162145	1162150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_016810	GT	3	6	1162167	1162172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016810	AAT	2	6	1162252	1162257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016810	TTG	2	6	1162272	1162277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016810	TTAT	2	8	1162328	1162335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016810	TTA	2	6	1162345	1162350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016810	CTA	2	6	1162398	1162403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_016810	TGA	2	6	1162442	1162447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016810	GAG	2	6	1162467	1162472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016810	CTC	2	6	1162476	1162481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_016810	ATG	2	6	1162496	1162501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016810	CCG	3	9	1162750	1162758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_016810	CGG	2	6	1162765	1162770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_016810	T	7	7	1162771	1162777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016810	TTAA	2	8	1163903	1163910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016810	CCA	2	6	1167937	1167942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_016810	ATGA	2	8	1167996	1168003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016810	A	7	7	1168010	1168016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016810	ATTT	2	8	1168050	1168057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016810	A	6	6	1168096	1168101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016810	GA	3	6	1168105	1168110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016810	GT	3	6	1168163	1168168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016810	ACC	2	6	1168186	1168191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_016810	AATA	2	8	1168279	1168286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016810	ATT	2	6	1169829	1169834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016810	GGC	2	6	1169856	1169861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016810	CGCC	2	8	1169868	1169875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3129	NC_016810	ACTA	2	8	1169997	1170004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_016810	AT	3	6	1170008	1170013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_016810	ATAA	2	8	1170118	1170125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016810	GA	3	6	1170143	1170148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016810	ATT	2	6	1170159	1170164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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