MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016810	CAA	2	6	539563	539568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016810	CAGGCG	2	12	539639	539650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016810	AT	3	6	539722	539727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016810	AG	3	6	540311	540316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016810	AG	5	10	542356	542365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016810	GGC	2	6	543313	543318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016810	TTG	2	6	543396	543401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016810	AGCGCC	2	12	545367	545378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_016810	T	6	6	545387	545392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016810	ATA	2	6	545393	545398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016810	GGC	2	6	545443	545448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016810	TGG	2	6	545470	545475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016810	A	6	6	545494	545499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016810	T	6	6	546174	546179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016810	CTG	2	6	546204	546209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016810	GGC	2	6	546261	546266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016810	GCA	2	6	546332	546337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016810	TTC	2	6	546343	546348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016810	CAA	2	6	546374	546379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016810	GGC	2	6	546395	546400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016810	A	6	6	548363	548368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016810	TCG	2	6	548391	548396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_016810	CGTC	2	8	548416	548423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_016810	GC	3	6	548424	548429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_016810	GC	3	6	549811	549816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_016810	A	6	6	551587	551592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016810	TAG	2	6	552984	552989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016810	ATT	2	6	552998	553003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016810	GAAG	2	8	553034	553041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016810	TAT	2	6	553067	553072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016810	GA	3	6	553113	553118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016810	GC	3	6	554803	554808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_016810	CTG	2	6	554833	554838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016810	CTT	2	6	555378	555383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016810	A	6	6	555428	555433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016810	ATA	3	9	555515	555523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016810	TCGG	2	8	556443	556450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_016810	A	7	7	557302	557308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016810	TGT	2	6	557319	557324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016810	T	6	6	557324	557329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016810	TA	3	6	557360	557365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016810	TAA	2	6	557391	557396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016810	TGC	2	6	557413	557418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016810	TCA	2	6	559958	559963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_016810	CCT	2	6	561835	561840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_016810	C	6	6	561910	561915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1547	NC_016810	TTA	2	6	561916	561921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016810	AAC	2	6	561955	561960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016810	GAT	2	6	563427	563432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016810	GAC	2	6	563459	563464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016810	GC	3	6	563480	563485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_016810	AG	3	6	563495	563500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016810	CT	3	6	564365	564370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_016810	GC	3	6	564405	564410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_016810	CGTT	2	8	565263	565270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_016810	GCC	2	6	565317	565322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_016810	ATG	2	6	569028	569033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016810	AAT	2	6	569036	569041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016810	T	6	6	569071	569076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016810	TAG	2	6	569107	569112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016810	A	6	6	569124	569129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016810	ACA	2	6	569133	569138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016810	TTA	2	6	569157	569162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016810	CTAT	2	8	569189	569196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_016810	AC	3	6	570416	570421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_016810	GCCT	2	8	570430	570437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_016810	AC	3	6	570451	570456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_016810	CAT	2	6	570464	570469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_016810	AAT	2	6	570472	570477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016810	CAG	2	6	570486	570491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016810	ATC	2	6	574289	574294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016810	CCT	2	6	575274	575279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_016810	AGT	2	6	575322	575327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016810	ATA	2	6	575333	575338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016810	CTT	2	6	575984	575989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016810	CGCT	2	8	576880	576887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_016810	T	6	6	576898	576903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016810	AAT	2	6	579533	579538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016810	T	8	8	579550	579557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016810	GAA	2	6	580563	580568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016810	AAT	2	6	581819	581824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016810	CTA	2	6	581830	581835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_016810	TTTAT	2	10	581840	581849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016810	ATTT	2	8	581850	581857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016810	AAC	2	6	581879	581884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016810	CGT	2	6	584827	584832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016810	ACG	2	6	584834	584839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016810	A	7	7	587340	587346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016810	AGG	2	6	587398	587403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016810	CCG	2	6	587409	587414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_016810	ACG	2	6	590533	590538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_016810	AAAAT	2	10	590571	590580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016810	A	7	7	590602	590608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016810	ATTT	2	8	590619	590626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016810	TAAA	2	8	590656	590663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016810	T	6	6	590668	590673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016810	GTT	2	6	590700	590705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016810	TAA	2	6	590719	590724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016810	AT	3	6	590763	590768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016810	TGCAAT	2	12	590797	590808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1601	NC_016810	TGCAAT	2	12	590812	590823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1602	NC_016810	ATT	2	6	590831	590836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016810	GTT	2	6	590842	590847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016810	GGC	2	6	595508	595513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_016810	GCC	2	6	595526	595531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_016810	GCT	2	6	597144	597149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016810	TGCG	2	8	597196	597203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_016810	CGA	2	6	597221	597226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016810	AG	3	6	598468	598473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016810	TGC	2	6	598552	598557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016810	AAT	2	6	598568	598573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016810	ATT	2	6	598589	598594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016810	CA	3	6	598598	598603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_016810	GAT	2	6	601906	601911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016810	AG	3	6	603058	603063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016810	GC	3	6	603205	603210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_016810	TCA	2	6	603235	603240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016810	TCG	2	6	603266	603271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016810	GGC	2	6	603284	603289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_016810	CTT	2	6	603325	603330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_016810	T	6	6	603378	603383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016810	TTA	2	6	603403	603408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016810	ATTA	2	8	603436	603443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016810	TAAT	2	8	603477	603484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016810	ATCT	2	8	603492	603499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_016810	ATA	2	6	603540	603545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016810	GT	4	8	603579	603586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016810	AGGGA	2	10	604178	604187	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016810	T	6	6	604804	604809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016810	AG	3	6	605508	605513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016810	TAA	2	6	610415	610420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016810	AC	3	6	610459	610464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_016810	CA	3	6	610465	610470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_016810	AAT	2	6	610478	610483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016810	TAA	2	6	610527	610532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_016810	A	6	6	610561	610566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_016810	GCG	2	6	704457	704462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_016810	A	6	6	704465	704470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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