MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016810	A	6	6	4591477	4591482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_016810	TAC	2	6	4591511	4591516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_016810	CTT	2	6	4592969	4592974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_016810	AC	3	6	4593005	4593010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_016810	AT	3	6	4593014	4593019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016810	CGA	2	6	4593042	4593047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_016810	TTAT	2	8	4593140	4593147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016810	TAC	2	6	4593179	4593184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016810	CAC	2	6	4593223	4593228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_016810	ATCGA	2	10	4593232	4593241	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13011	NC_016810	CGG	2	6	4595092	4595097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_016810	GAC	2	6	4595114	4595119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_016810	CA	3	6	4595138	4595143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_016810	T	6	6	4595210	4595215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_016810	AGA	2	6	4595221	4595226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016810	T	8	8	4595228	4595235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_016810	C	6	6	4595241	4595246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13018	NC_016810	CCCCAT	2	12	4595261	4595272	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_016810	CT	3	6	4595273	4595278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_016810	ACTT	2	8	4597391	4597398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_016810	GCC	2	6	4597427	4597432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_016810	AAT	2	6	4598862	4598867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_016810	AT	3	6	4598893	4598898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016810	AG	3	6	4598991	4598996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016810	GAG	2	6	4599046	4599051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016810	TCG	2	6	4599095	4599100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_016810	CAT	2	6	4600987	4600992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_016810	TGT	2	6	4601002	4601007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016810	TAT	2	6	4601009	4601014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016810	ACAA	2	8	4601028	4601035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13031	NC_016810	CGT	2	6	4601227	4601232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_016810	T	6	6	4601827	4601832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016810	CTTT	2	8	4601855	4601862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13034	NC_016810	CAT	2	6	4601877	4601882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_016810	A	7	7	4601953	4601959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_016810	TC	3	6	4601981	4601986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_016810	GAC	2	6	4602022	4602027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_016810	ATTA	2	8	4602060	4602067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_016810	TCG	2	6	4602400	4602405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_016810	TTCC	2	8	4602956	4602963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13041	NC_016810	T	6	6	4602968	4602973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_016810	GAAAA	2	10	4603009	4603018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_016810	A	6	6	4603015	4603020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016810	CGT	2	6	4603048	4603053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_016810	TCC	2	6	4606359	4606364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_016810	ATT	2	6	4606367	4606372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_016810	ACA	2	6	4606453	4606458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_016810	T	7	7	4606499	4606505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_016810	TTGATT	2	12	4606531	4606542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_016810	T	7	7	4606572	4606578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_016810	CG	3	6	4606625	4606630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_016810	T	6	6	4607713	4607718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_016810	T	7	7	4607789	4607795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_016810	A	6	6	4607811	4607816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_016810	GGC	2	6	4607820	4607825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_016810	GCG	2	6	4607838	4607843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_016810	TC	3	6	4613149	4613154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_016810	TTG	2	6	4614144	4614149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_016810	A	6	6	4614181	4614186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_016810	ACG	2	6	4614200	4614205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_016810	TGT	2	6	4616749	4616754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_016810	T	7	7	4616771	4616777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016810	ATTCTG	2	12	4616791	4616802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13064	NC_016810	GGCGT	2	10	4616811	4616820	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13065	NC_016810	T	6	6	4616827	4616832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_016810	T	6	6	4616857	4616862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_016810	CAAA	2	8	4616890	4616897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13068	NC_016810	A	6	6	4616905	4616910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016810	ACG	2	6	4616964	4616969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13074	NC_016810	ACC	2	6	4617336	4617341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_016810	GGC	2	6	4617368	4617373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_016810	AAGT	2	8	4617402	4617409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016810	GGC	2	6	4617637	4617642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_016810	A	6	6	4617661	4617666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016810	A	6	6	4617712	4617717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016810	T	6	6	4617753	4617758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_016810	TTTTTA	2	12	4617779	4617790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13083	NC_016810	TTA	2	6	4625517	4625522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13085	NC_016810	A	6	6	4626892	4626897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13089	NC_016810	ACC	2	6	4629327	4629332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_016810	GGT	2	6	4629349	4629354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13092	NC_016810	A	7	7	4629457	4629463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016810	CGT	2	6	4629502	4629507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_016810	GGC	2	6	4629511	4629516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016810	CTA	2	6	4629543	4629548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13097	NC_016810	T	6	6	4631078	4631083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016810	AAAT	2	8	4631098	4631105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_016810	ATC	2	6	4631131	4631136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13101	NC_016810	AGA	2	6	4634101	4634106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016810	AAC	2	6	4634157	4634162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016810	T	6	6	4634916	4634921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_016810	A	6	6	4634925	4634930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_016810	CCAT	2	8	4634931	4634938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_016810	T	9	9	4634949	4634957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016810	A	6	6	4634976	4634981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_016810	TTTA	2	8	4635004	4635011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_016810	GAGATA	2	12	4635019	4635030	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13113	NC_016810	AGCC	2	8	4635664	4635671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_016810	GGC	2	6	4635688	4635693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13117	NC_016810	GAA	2	6	4635773	4635778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_016810	AGC	2	6	4635861	4635866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_016810	GC	4	8	4635901	4635908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_016810	GAC	2	6	4635919	4635924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016810	CGG	3	9	4635957	4635965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_016810	GCC	2	6	4636019	4636024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_016810	GT	3	6	4636116	4636121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_016810	CAA	2	6	4636139	4636144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_016810	AGG	2	6	4640180	4640185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_016810	GTA	2	6	4641827	4641832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_016810	TGTT	2	8	4642193	4642200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_016810	AATC	2	8	4642254	4642261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13129	NC_016810	ATT	2	6	4642711	4642716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_016810	GA	3	6	4642771	4642776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_016810	GAT	2	6	4644312	4644317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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