MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016810	CAA	2	6	2284305	2284310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_016810	TAT	2	6	2285347	2285352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_016810	A	7	7	2285367	2285373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016810	CCA	2	6	2285436	2285441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_016810	GC	3	6	2285476	2285481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6506	NC_016810	GTA	2	6	2285500	2285505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_016810	GCC	2	6	2285539	2285544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_016810	GCG	2	6	2285549	2285554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_016810	AACT	2	8	2285717	2285724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6510	NC_016810	GTTA	2	8	2285732	2285739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_016810	TCA	2	6	2285757	2285762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_016810	TAA	2	6	2285778	2285783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_016810	GGC	2	6	2286904	2286909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_016810	AATG	2	8	2286983	2286990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016810	ATT	2	6	2288902	2288907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_016810	TTG	2	6	2288950	2288955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_016810	ATG	2	6	2288997	2289002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016810	ATG	2	6	2289043	2289048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_016810	AAT	2	6	2289096	2289101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016810	TAT	2	6	2289105	2289110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_016810	GAA	2	6	2289111	2289116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016810	TAA	2	6	2291802	2291807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016810	T	6	6	2291885	2291890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016810	CGC	2	6	2291934	2291939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_016810	A	7	7	2296287	2296293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016810	ATA	2	6	2296442	2296447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016810	TAA	2	6	2296465	2296470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_016810	GAA	2	6	2296493	2296498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016810	A	6	6	2296497	2296502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016810	A	6	6	2296504	2296509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_016810	AGA	2	6	2296530	2296535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016810	CAGT	2	8	2296548	2296555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_016810	ATCC	2	8	2298085	2298092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_016810	A	6	6	2298093	2298098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_016810	GCC	2	6	2298235	2298240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_016810	CTC	2	6	2298250	2298255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_016810	ATTA	2	8	2299169	2299176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_016810	AT	3	6	2299180	2299185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_016810	ATTTT	2	10	2299191	2299200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_016810	ATT	2	6	2300297	2300302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_016810	TTC	2	6	2301242	2301247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_016810	A	6	6	2301255	2301260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_016810	GC	3	6	2301267	2301272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6544	NC_016810	T	6	6	2301279	2301284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_016810	CTG	2	6	2302996	2303001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_016810	CGC	2	6	2303862	2303867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_016810	TGG	2	6	2303919	2303924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016810	TCTCC	2	10	2305074	2305083	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6549	NC_016810	A	7	7	2305115	2305121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_016810	A	7	7	2305140	2305146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_016810	AAG	2	6	2305169	2305174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_016810	T	6	6	2305226	2305231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_016810	T	6	6	2305245	2305250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_016810	T	6	6	2305293	2305298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016810	CT	3	6	2305412	2305417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_016810	CAC	2	6	2305421	2305426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_016810	ATCG	2	8	2307525	2307532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6558	NC_016810	GATA	2	8	2307547	2307554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_016810	ATCG	2	8	2307575	2307582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_016810	AAT	2	6	2307588	2307593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_016810	ATAA	2	8	2307639	2307646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016810	GCG	2	6	2307711	2307716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_016810	AGG	2	6	2307779	2307784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016810	TCA	2	6	2308194	2308199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_016810	ACA	2	6	2308251	2308256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_016810	C	6	6	2308267	2308272	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6567	NC_016810	T	6	6	2308339	2308344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_016810	AGT	2	6	2308391	2308396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_016810	ACA	2	6	2308423	2308428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_016810	TATT	2	8	2309058	2309065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_016810	GCA	3	9	2309126	2309134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_016810	ATT	2	6	2309182	2309187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_016810	GTT	2	6	2309192	2309197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_016810	TGT	2	6	2309199	2309204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_016810	ATG	2	6	2311015	2311020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_016810	CAT	2	6	2311035	2311040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_016810	ATT	2	6	2311052	2311057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_016810	A	6	6	2311152	2311157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_016810	TCGC	2	8	2311168	2311175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_016810	CAA	2	6	2311184	2311189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_016810	ATT	2	6	2311226	2311231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_016810	TCA	2	6	2311310	2311315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6584	NC_016810	TCA	2	6	2311950	2311955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6589	NC_016810	TTA	2	6	2312022	2312027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6591	NC_016810	TTA	2	6	2313872	2313877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_016810	TTAC	2	8	2319842	2319849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_016810	CAT	2	6	2319863	2319868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6595	NC_016810	GCG	2	6	2319965	2319970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_016810	ATG	2	6	2320019	2320024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6598	NC_016810	AGG	2	6	2320066	2320071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_016810	ATG	2	6	2320075	2320080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6601	NC_016810	TTC	2	6	2320167	2320172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_016810	GC	3	6	2320190	2320195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_016810	TAA	2	6	2322130	2322135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_016810	A	6	6	2322160	2322165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_016810	CCCG	2	8	2324066	2324073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6606	NC_016810	ATT	2	6	2324129	2324134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_016810	AG	3	6	2324137	2324142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_016810	GAA	2	6	2324447	2324452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_016810	CCCCG	2	10	2324456	2324465	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6610	NC_016810	T	7	7	2324472	2324478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_016810	GAC	2	6	2324497	2324502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_016810	ACC	2	6	2326231	2326236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_016810	GCAA	2	8	2326251	2326258	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_016810	A	8	8	2326318	2326325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_016810	AACA	2	8	2326358	2326365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6616	NC_016810	GTA	2	6	2328449	2328454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_016810	GAA	2	6	2328556	2328561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_016810	T	7	7	2328580	2328586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_016810	AAT	2	6	2328619	2328624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6621	NC_016810	ATTTTC	2	12	2329546	2329557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6622	NC_016810	CTC	2	6	2329634	2329639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_016810	GTC	2	6	2329664	2329669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_016810	CTT	2	6	2329721	2329726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6627	NC_016810	ATC	2	6	2329791	2329796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_016810	TG	3	6	2329816	2329821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_016810	TTTTA	2	10	2331696	2331705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_016810	ACA	2	6	2331713	2331718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6632	NC_016810	GTT	2	6	2332243	2332248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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