MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016810	CTC	2	6	2045049	2045054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_016810	CTCCAG	2	12	2050919	2050930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_016810	CGC	2	6	2050943	2050948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016810	CCG	2	6	2050949	2050954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_016810	AGT	2	6	2053202	2053207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016810	TCA	2	6	2053213	2053218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016810	CCT	2	6	2053228	2053233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_016810	CCA	2	6	2055311	2055316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_016810	CCG	2	6	2058420	2058425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_016810	CTG	2	6	2058431	2058436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016810	CCA	2	6	2058457	2058462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_016810	CAA	3	9	2058493	2058501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_016810	CCG	2	6	2058505	2058510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_016810	CCA	2	6	2058562	2058567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_016810	GGGC	2	8	2060880	2060887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_016810	ATT	2	6	2060947	2060952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016810	TAA	2	6	2061340	2061345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016810	CCT	2	6	2061673	2061678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_016810	CAT	2	6	2061714	2061719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016810	CTG	2	6	2061740	2061745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016810	TTCA	2	8	2061806	2061813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_016810	CCA	2	6	2061852	2061857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_016810	TGA	2	6	2062324	2062329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016810	CA	3	6	2062337	2062342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_016810	CG	3	6	2062423	2062428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_016810	GCC	2	6	2064022	2064027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_016810	CAG	2	6	2064031	2064036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016810	CG	3	6	2064052	2064057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_016810	GGC	2	6	2064060	2064065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_016810	TTG	2	6	2064084	2064089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016810	ATC	2	6	2064151	2064156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016810	GCCA	2	8	2064223	2064230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_016810	GGTAT	2	10	2064231	2064240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016810	AGA	2	6	2064286	2064291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016810	TGC	2	6	2064292	2064297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_016810	TCA	2	6	2064298	2064303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_016810	ATT	2	6	2064305	2064310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016810	CTG	2	6	2064313	2064318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016810	CAC	2	6	2064337	2064342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_016810	GGA	2	6	2064372	2064377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016810	TAT	2	6	2064411	2064416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016810	CAG	2	6	2064446	2064451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_016810	CGCT	2	8	2064469	2064476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_016810	T	7	7	2064863	2064869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016810	TCGTGA	2	12	2067418	2067429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6046	NC_016810	CCA	2	6	2067466	2067471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_016810	GTC	2	6	2067491	2067496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_016810	TGT	2	6	2067538	2067543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016810	GAT	2	6	2067584	2067589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016810	GCT	2	6	2067597	2067602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_016810	CGT	2	6	2067627	2067632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016810	GCAG	2	8	2067653	2067660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_016810	GAC	2	6	2067697	2067702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_016810	GC	3	6	2067726	2067731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_016810	GCA	2	6	2069968	2069973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_016810	CCT	2	6	2072151	2072156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_016810	A	6	6	2072222	2072227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016810	TAATG	2	10	2072229	2072238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016810	CCA	2	6	2072958	2072963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_016810	TGG	2	6	2072967	2072972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016810	T	9	9	2072974	2072982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016810	AT	3	6	2072996	2073001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016810	AGC	2	6	2073054	2073059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016810	CAGG	2	8	2073063	2073070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_016810	GCC	2	6	2073085	2073090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_016810	GAT	2	6	2073110	2073115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016810	ACC	2	6	2073158	2073163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_016810	ACA	2	6	2073184	2073189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016810	CCCG	2	8	2073258	2073265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6070	NC_016810	GGC	2	6	2073298	2073303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_016810	CG	3	6	2073367	2073372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_016810	AG	4	8	2073390	2073397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016810	CAC	2	6	2073522	2073527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_016810	ACC	2	6	2074147	2074152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_016810	TAA	2	6	2074168	2074173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_016810	AAAT	2	8	2075122	2075129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016810	GCA	2	6	2075752	2075757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_016810	TTG	2	6	2075794	2075799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016810	GCG	3	9	2075839	2075847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_016810	TTC	2	6	2075914	2075919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_016810	TGA	2	6	2075954	2075959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016810	AAAG	2	8	2075960	2075967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016810	AGC	2	6	2075975	2075980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_016810	T	7	7	2079808	2079814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_016810	T	6	6	2079832	2079837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016810	TCA	2	6	2079851	2079856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_016810	GA	4	8	2079893	2079900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016810	CGG	2	6	2079915	2079920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_016810	TC	3	6	2079971	2079976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_016810	ATG	2	6	2079988	2079993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_016810	TTAA	2	8	2080880	2080887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016810	AATTG	2	10	2080890	2080899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016810	TAT	2	6	2080940	2080945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016810	CGG	2	6	2080988	2080993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_016810	CTT	2	6	2081102	2081107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_016810	ACTG	2	8	2081212	2081219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_016810	ATT	2	6	2081691	2081696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016810	TGCC	2	8	2081704	2081711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_016810	TCA	2	6	2081725	2081730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_016810	TGT	2	6	2081843	2081848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016810	CAAA	2	8	2081858	2081865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_016810	CGG	2	6	2081958	2081963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_016810	A	6	6	2082051	2082056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016810	T	7	7	2082101	2082107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016810	CCT	2	6	2082167	2082172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_016810	TTTAC	2	10	2082689	2082698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6107	NC_016810	TGC	2	6	2082728	2082733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016810	CAA	2	6	2083024	2083029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_016810	CAG	2	6	2083829	2083834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_016810	T	6	6	2083866	2083871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016810	TA	3	6	2083964	2083969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016810	TAA	2	6	2083975	2083980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016810	TCA	2	6	2083981	2083986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016810	TTA	2	6	2083992	2083997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016810	AAC	2	6	2084008	2084013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_016810	ATT	2	6	2084031	2084036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016810	GAA	2	6	2084050	2084055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016810	CT	3	6	2084058	2084063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_016810	CTC	2	6	2084078	2084083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_016810	TTA	2	6	2084137	2084142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016810	CCCG	2	8	2088126	2088133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6122	NC_016810	GGC	2	6	2088157	2088162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016810	AATC	2	8	2088173	2088180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_016810	GCC	2	6	2088217	2088222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_016810	CTGC	2	8	2088240	2088247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_016810	TCG	2	6	2088251	2088256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_016810	GAG	2	6	2088378	2088383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016810	GAC	4	12	2088393	2088404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_016810	CTG	2	6	2088408	2088413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_016810	GCC	2	6	2088425	2088430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_016810	CTG	2	6	2088471	2088476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_016810	ACC	2	6	2088488	2088493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_016810	ACG	2	6	2088503	2088508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6243	NC_016810	T	6	6	2145091	2145096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_016810	GATT	2	8	2145177	2145184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_016810	A	6	6	2147055	2147060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_016810	GCTT	2	8	2147063	2147070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6251	NC_016810	ACC	2	6	2147155	2147160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6252	NC_016810	ATC	2	6	2147161	2147166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6255	NC_016810	GTG	2	6	2147225	2147230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_016810	ATC	2	6	2147259	2147264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6258	NC_016810	GC	3	6	2147285	2147290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6259	NC_016810	GCGCT	2	10	2148244	2148253	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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