MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016810	CTA	2	6	1604461	1604466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_016810	GCC	2	6	1604540	1604545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_016810	TCA	2	6	1604555	1604560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_016810	TTAC	2	8	1604602	1604609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_016810	TAA	2	6	1604629	1604634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016810	GCT	2	6	1604653	1604658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_016810	CA	3	6	1604664	1604669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_016810	ATC	2	6	1604672	1604677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_016810	GTC	2	6	1605671	1605676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_016810	ACAG	2	8	1605684	1605691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_016810	T	6	6	1610353	1610358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016810	CCT	2	6	1610372	1610377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_016810	GCA	2	6	1610385	1610390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_016810	T	6	6	1610451	1610456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016810	A	6	6	1610533	1610538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016810	TTG	2	6	1610651	1610656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016810	CGGG	2	8	1611508	1611515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_016810	GATATT	2	12	1611518	1611529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016810	CTC	2	6	1611622	1611627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_016810	TAATG	2	10	1611686	1611695	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016810	AT	3	6	1611714	1611719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016810	TTA	2	6	1611742	1611747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_016810	ATA	2	6	1611754	1611759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016810	TAC	2	6	1611769	1611774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_016810	AT	3	6	1611816	1611821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016810	TTA	2	6	1611823	1611828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016810	CA	3	6	1611880	1611885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_016810	AAT	2	6	1611892	1611897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016810	TTA	2	6	1611915	1611920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016810	TGT	2	6	1613118	1613123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016810	GGCT	2	8	1613152	1613159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_016810	GC	3	6	1615241	1615246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_016810	TAA	2	6	1615860	1615865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016810	CAT	2	6	1615904	1615909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016810	CGCGC	2	10	1615920	1615929	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4536	NC_016810	T	6	6	1615938	1615943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016810	A	7	7	1615968	1615974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016810	T	6	6	1616015	1616020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016810	TTC	2	6	1616027	1616032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_016810	CGT	2	6	1624242	1624247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_016810	ATG	2	6	1624268	1624273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016810	TTC	2	6	1624275	1624280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_016810	A	6	6	1625222	1625227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016810	CATTAA	2	12	1626084	1626095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4545	NC_016810	CA	3	6	1626109	1626114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_016810	A	7	7	1626179	1626185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016810	CGC	2	6	1626270	1626275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_016810	GCG	2	6	1626283	1626288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_016810	CTC	2	6	1627033	1627038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_016810	TC	3	6	1627037	1627042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_016810	TCAA	2	8	1627057	1627064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_016810	TGC	2	6	1627132	1627137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_016810	GGT	2	6	1627151	1627156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016810	ATTA	2	8	1627210	1627217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016810	CAC	2	6	1627282	1627287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_016810	CA	3	6	1627295	1627300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_016810	CCG	2	6	1627372	1627377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_016810	TTCCCC	2	12	1628998	1629009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_016810	GCC	2	6	1629044	1629049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_016810	ATC	2	6	1629353	1629358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_016810	CGG	2	6	1629366	1629371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_016810	GAC	2	6	1630500	1630505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_016810	GCT	2	6	1630529	1630534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_016810	ACT	2	6	1630539	1630544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_016810	TTA	2	6	1630572	1630577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016810	AAT	3	9	1630587	1630595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016810	ATT	2	6	1630597	1630602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016810	CTTAA	2	10	1630665	1630674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4569	NC_016810	TCCT	2	8	1633618	1633625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_016810	AAC	2	6	1633640	1633645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016810	GAA	2	6	1633662	1633667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016810	A	6	6	1633686	1633691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016810	AAAT	2	8	1633714	1633721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016810	ACA	2	6	1633760	1633765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_016810	ATG	2	6	1633875	1633880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016810	GCC	2	6	1633934	1633939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_016810	T	6	6	1633941	1633946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016810	GCC	2	6	1635145	1635150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_016810	TAT	2	6	1636441	1636446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016810	CGC	3	9	1636476	1636484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_016810	CCG	2	6	1636560	1636565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_016810	TTGC	2	8	1636567	1636574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_016810	GAA	2	6	1636601	1636606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016810	AAC	2	6	1636618	1636623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_016810	TAT	2	6	1643424	1643429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016810	ATG	2	6	1643468	1643473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016810	AATG	2	8	1643486	1643493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016810	CGT	2	6	1643507	1643512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_016810	TGC	3	9	1643528	1643536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_016810	TGC	2	6	1643604	1643609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_016810	T	6	6	1643653	1643658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016810	GCC	2	6	1645154	1645159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_016810	GC	3	6	1645179	1645184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_016810	GCT	2	6	1646690	1646695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_016810	GTT	2	6	1646723	1646728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_016810	CAA	2	6	1646792	1646797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_016810	CCT	2	6	1647738	1647743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_016810	AAT	2	6	1647757	1647762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016810	GGC	2	6	1647777	1647782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_016810	GAGT	2	8	1647787	1647794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016810	GCG	2	6	1648091	1648096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_016810	CCT	2	6	1648504	1648509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_016810	ACA	2	6	1648566	1648571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_016810	TTG	2	6	1648661	1648666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016810	TAA	2	6	1648673	1648678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016810	CTT	2	6	1648693	1648698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_016810	ATA	2	6	1648746	1648751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016810	TAAT	2	8	1648759	1648766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016810	ATG	3	9	1648782	1648790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016810	AGG	2	6	1648848	1648853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016810	AAT	2	6	1648897	1648902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016810	ATA	2	6	1648970	1648975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016810	ACC	2	6	1648984	1648989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_016810	AT	3	6	1650054	1650059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016810	AAT	2	6	1650070	1650075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016810	AGTATA	2	12	1650126	1650137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016810	AAT	2	6	1650197	1650202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016810	ATT	2	6	1650214	1650219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016810	CAT	2	6	1650222	1650227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_016810	ACG	2	6	1650234	1650239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_016810	GGC	2	6	1652484	1652489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016810	C	6	6	1653072	1653077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4623	NC_016810	TGAC	2	8	1653127	1653134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_016810	TGG	2	6	1654338	1654343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016810	ATG	2	6	1655084	1655089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_016810	ATA	2	6	1655098	1655103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_016810	A	7	7	1655172	1655178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016810	GTT	2	6	1656861	1656866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016810	CTT	2	6	1658444	1658449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_016810	GTT	2	6	1658451	1658456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_016810	ATT	2	6	1658533	1658538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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