MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016633	T	7	7	1484836	1484842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016633	T	8	8	1484846	1484853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016633	TCT	2	6	1484872	1484877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016633	AATGA	2	10	1484919	1484928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016633	GAA	2	6	1484961	1484966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016633	T	8	8	1485548	1485555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016633	TGCT	2	8	1485557	1485564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_016633	GAA	2	6	1485595	1485600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016633	ACCAA	2	10	1485675	1485684	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_016633	GGAC	2	8	1485688	1485695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_016633	CTG	2	6	1485888	1485893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016633	TC	3	6	1485902	1485907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_016633	TCC	2	6	1486035	1486040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_016633	CTT	2	6	1486087	1486092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016633	TTG	2	6	1486135	1486140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016633	TAA	2	6	1486184	1486189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016633	TC	3	6	1486197	1486202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_016633	ATTTAT	2	12	1486290	1486301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016633	TA	4	8	1486308	1486315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016633	ATT	2	6	1486390	1486395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016633	A	6	6	1486416	1486421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016633	CTT	2	6	1487102	1487107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_016633	TCAG	2	8	1487124	1487131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3025	NC_016633	CCA	3	9	1487167	1487175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3027	NC_016633	AGCC	2	8	1487228	1487235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3031	NC_016633	TATAG	2	10	1487606	1487615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016633	T	7	7	1487625	1487631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016633	ATT	2	6	1487632	1487637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3035	NC_016633	T	6	6	1487689	1487694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3038	NC_016633	TGTC	2	8	1488329	1488336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_016633	T	6	6	1488364	1488369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_016633	TCACA	2	10	1488421	1488430	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_016633	TC	3	6	1488471	1488476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_016633	TGT	2	6	1488536	1488541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016633	TAT	2	6	1488557	1488562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3050	NC_016633	T	8	8	1489427	1489434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016633	CTT	2	6	1489437	1489442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016633	TA	3	6	1489448	1489453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016633	T	8	8	1489474	1489481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016633	AT	3	6	1489500	1489505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016633	TA	3	6	1489541	1489546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016633	AAGG	2	8	1490248	1490255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_016633	AAG	2	6	1490387	1490392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3063	NC_016633	T	6	6	1490501	1490506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016633	GAG	2	6	1492466	1492471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3073	NC_016633	AGGTC	2	10	1500886	1500895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_016633	T	6	6	1500898	1500903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016633	TCA	2	6	1500911	1500916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_016633	CAT	2	6	1501203	1501208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3083	NC_016633	T	6	6	1503546	1503551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016633	TTTG	2	8	1503618	1503625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_016633	AG	4	8	1503706	1503713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_016633	T	7	7	1509723	1509729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016633	AATT	2	8	1509788	1509795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016633	TCAT	2	8	1509812	1509819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_016633	GAG	2	6	1509821	1509826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016633	AG	3	6	1509825	1509830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016633	GGGA	2	8	1510890	1510897	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_016633	AAG	2	6	1514640	1514645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016633	AT	3	6	1514654	1514659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016633	TAA	3	9	1514660	1514668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_016633	ATG	2	6	1515738	1515743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016633	A	7	7	1515747	1515753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016633	AGG	2	6	1515775	1515780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3112	NC_016633	T	8	8	1515817	1515824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016633	CTC	2	6	1515877	1515882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_016633	CAA	2	6	1515886	1515891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_016633	AT	3	6	1515933	1515938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016633	AAC	2	6	1515995	1516000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_016633	TACA	2	8	1518676	1518683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_016633	TCC	2	6	1518919	1518924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_016633	TGA	2	6	1518929	1518934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016633	AAAC	2	8	1518936	1518943	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_016633	TTC	2	6	1518970	1518975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_016633	CTT	2	6	1519059	1519064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_016633	A	6	6	1521257	1521262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016633	TGG	2	6	1521271	1521276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016633	GA	3	6	1521279	1521284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016633	AAT	2	6	1521291	1521296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016633	TCTA	2	8	1521307	1521314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_016633	GTTTC	2	10	1522344	1522353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3129	NC_016633	GTTTTT	2	12	1522392	1522403	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016633	ACA	2	6	1522424	1522429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016633	CTT	2	6	1522484	1522489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_016633	TTAC	2	8	1522502	1522509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_016633	TCT	2	6	1522526	1522531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_016633	CAG	2	6	1522600	1522605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3258	NC_016633	CTTT	2	8	1598483	1598490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_016633	TC	3	6	1598506	1598511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_016633	AAGAG	2	10	1598569	1598578	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_016633	A	6	6	1602738	1602743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_016633	TAC	2	6	1602748	1602753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3443	NC_016633	GAAA	2	8	1685505	1685512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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