MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016633	AGG	2	6	1223424	1223429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016633	AAG	2	6	1223448	1223453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016633	TCT	2	6	1223467	1223472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_016633	T	6	6	1223472	1223477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016633	ATGA	2	8	1223493	1223500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016633	AAT	2	6	1223542	1223547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016633	TAAA	2	8	1223605	1223612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016633	T	6	6	1223617	1223622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016633	ATT	2	6	1226003	1226008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016633	ACA	2	6	1226046	1226051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_016633	AAT	2	6	1226056	1226061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016633	CTC	2	6	1226365	1226370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_016633	A	6	6	1226388	1226393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_016633	ATTT	2	8	1226460	1226467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016633	ATA	2	6	1226518	1226523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016633	A	6	6	1226542	1226547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016633	TAA	2	6	1226548	1226553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016633	CTA	2	6	1226555	1226560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_016633	AAG	2	6	1226583	1226588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016633	TTC	2	6	1226592	1226597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_016633	TGT	2	6	1227263	1227268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016633	ATG	2	6	1227310	1227315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016633	ATAC	2	8	1227342	1227349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_016633	TCTAT	2	10	1227350	1227359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2525	NC_016633	TGG	2	6	1227378	1227383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016633	ATA	2	6	1227404	1227409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2528	NC_016633	T	8	8	1227470	1227477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016633	CCTTCC	2	12	1227529	1227540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_016633	ACTC	2	8	1229127	1229134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_016633	A	6	6	1229159	1229164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016633	TTTC	2	8	1229173	1229180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_016633	CA	3	6	1229238	1229243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_016633	A	6	6	1229246	1229251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016633	A	6	6	1229362	1229367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_016633	GTT	2	6	1229376	1229381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2539	NC_016633	AGCA	2	8	1234302	1234309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_016633	A	6	6	1234420	1234425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_016633	AGA	2	6	1234532	1234537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2543	NC_016633	GTAT	2	8	1234621	1234628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016633	AATT	2	8	1235984	1235991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_016633	TA	3	6	1236026	1236031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016633	AAGA	2	8	1236032	1236039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_016633	A	6	6	1237202	1237207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2550	NC_016633	T	6	6	1237652	1237657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_016633	TAACC	2	10	1237676	1237685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2552	NC_016633	ACA	2	6	1237702	1237707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_016633	TCC	2	6	1240994	1240999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_016633	CGT	2	6	1242733	1242738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2556	NC_016633	GTT	2	6	1251922	1251927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_016633	A	8	8	1253915	1253922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016633	GTC	2	6	1253930	1253935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_016633	GGC	2	6	1253967	1253972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2562	NC_016633	A	9	9	1254421	1254429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_016633	TC	3	6	1254434	1254439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2564	NC_016633	ATA	2	6	1254510	1254515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_016633	AAG	2	6	1254557	1254562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2567	NC_016633	TTG	2	6	1254670	1254675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2569	NC_016633	GTTT	2	8	1254703	1254710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_016633	GGAA	2	8	1258574	1258581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_016633	GAAGT	2	10	1258585	1258594	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_016633	CAAG	2	8	1261467	1261474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2576	NC_016633	CGG	2	6	1262756	1262761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2578	NC_016633	CT	3	6	1264411	1264416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2580	NC_016633	TA	3	6	1264523	1264528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_016633	AAG	2	6	1264560	1264565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2583	NC_016633	A	6	6	1266181	1266186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_016633	TA	3	6	1269063	1269068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_016633	A	6	6	1271206	1271211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016633	T	6	6	1271269	1271274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2593	NC_016633	T	7	7	1272111	1272117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_016633	CTG	2	6	1272224	1272229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2597	NC_016633	AT	3	6	1272361	1272366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_016633	GAG	2	6	1272774	1272779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_016633	ATA	2	6	1273707	1273712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2601	NC_016633	A	6	6	1273784	1273789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_016633	AAT	2	6	1273844	1273849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_016633	CAG	2	6	1274981	1274986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_016633	T	7	7	1275019	1275025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_016633	AGG	3	9	1275047	1275055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_016633	TAC	2	6	1276398	1276403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_016633	G	6	6	1277791	1277796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_016633	GTATT	2	10	1277831	1277840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_016633	AT	3	6	1277941	1277946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016633	TCA	2	6	1277972	1277977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_016633	TGA	2	6	1277983	1277988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016633	GCT	2	6	1279428	1279433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2616	NC_016633	TA	3	6	1287963	1287968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_016633	TAA	2	6	1287978	1287983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016633	AC	3	6	1287991	1287996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_016633	AGAT	2	8	1288035	1288042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_016633	CTT	2	6	1288909	1288914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2622	NC_016633	TAT	2	6	1297315	1297320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_016633	CAG	2	6	1297343	1297348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_016633	G	7	7	1297370	1297376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2628	NC_016633	A	7	7	1299501	1299507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_016633	TCT	2	6	1299523	1299528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_016633	T	6	6	1299880	1299885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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