MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016633	AT	3	6	552201	552206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016633	AT	3	6	552224	552229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016633	AT	3	6	552242	552247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016633	T	6	6	552279	552284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016633	T	6	6	552357	552362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016633	ATT	3	9	552367	552375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016633	TA	3	6	552377	552382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016633	ACCT	2	8	552514	552521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_016633	GAG	2	6	552561	552566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016633	GCAAGC	2	12	552637	552648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016633	GT	3	6	552649	552654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016633	AC	3	6	552699	552704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_016633	AGGAA	2	10	552753	552762	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016633	CAGCC	2	10	552764	552773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1015	NC_016633	AGCC	2	8	552808	552815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_016633	GAA	2	6	552819	552824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016633	A	7	7	553707	553713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016633	CAT	2	6	553715	553720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016633	T	7	7	553745	553751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016633	T	6	6	553794	553799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016633	A	7	7	553823	553829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016633	ATA	2	6	553859	553864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016633	TGGA	2	8	553893	553900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016633	TTCC	2	8	553998	554005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_016633	GAT	2	6	554848	554853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016633	TTTC	2	8	555852	555859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_016633	CTGTA	2	10	556726	556735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_016633	A	8	8	556799	556806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016633	A	6	6	556819	556824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016633	TC	3	6	556976	556981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_016633	GAT	2	6	557058	557063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016633	CTTTT	2	10	557068	557077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_016633	TGGG	2	8	557120	557127	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016633	ACG	2	6	557212	557217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016633	GCA	2	6	557275	557280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016633	TGA	2	6	557282	557287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016633	TCA	2	6	557373	557378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016633	A	6	6	557396	557401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016633	ACCCA	2	10	557452	557461	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1040	NC_016633	T	6	6	557515	557520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016633	TCTG	2	8	559025	559032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_016633	CT	3	6	562114	562119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_016633	CTC	2	6	563463	563468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_016633	AAT	2	6	565592	565597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016633	T	7	7	565610	565616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016633	T	7	7	565621	565627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016633	ATT	2	6	565827	565832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016633	TCTT	2	8	565872	565879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1050	NC_016633	A	6	6	565905	565910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016633	AAC	2	6	565917	565922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016633	TAA	2	6	566023	566028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016633	A	6	6	566027	566032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016633	A	6	6	566043	566048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016633	AGG	2	6	566053	566058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_016633	T	6	6	569566	569571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_016633	GTT	2	6	569618	569623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016633	T	6	6	569633	569638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016633	ATG	2	6	569657	569662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016633	ATT	2	6	569674	569679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016633	GGA	2	6	569697	569702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016633	A	8	8	574569	574576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016633	GAA	2	6	574773	574778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016633	GTT	2	6	576764	576769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_016633	T	6	6	576886	576891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_016633	TCTA	2	8	587469	587476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_016633	ATA	2	6	589119	589124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_016633	TAGGTA	2	12	589209	589220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_016633	AAAG	2	8	589277	589284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016633	TCT	2	6	592077	592082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1094	NC_016633	TA	3	6	592234	592239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016633	T	6	6	592282	592287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016633	CCAAA	2	10	592358	592367	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_016633	GCC	2	6	592440	592445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1099	NC_016633	T	7	7	594228	594234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_016633	TTCA	2	8	595080	595087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_016633	TAC	3	9	596976	596984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_016633	CCA	2	6	598020	598025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_016633	TAT	2	6	598104	598109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016633	TGT	2	6	598142	598147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016633	A	6	6	598156	598161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016633	AT	3	6	598166	598171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016633	TCGT	2	8	598978	598985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_016633	A	7	7	598994	599000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016633	A	6	6	599018	599023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016633	TC	3	6	599035	599040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1118	NC_016633	AAT	2	6	600146	600151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016633	CA	3	6	600727	600732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_016633	TA	3	6	600770	600775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016633	CA	3	6	600874	600879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_016633	ATT	2	6	600885	600890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016633	GGA	2	6	600896	600901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016633	AAC	2	6	601218	601223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_016633	GATG	2	8	601245	601252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_016633	TGG	2	6	609526	609531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016633	A	6	6	609556	609561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016633	AAG	2	6	609578	609583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016633	TCA	2	6	609588	609593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_016633	GCT	2	6	612377	612382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016633	TC	3	6	612383	612388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_016633	TA	4	8	612435	612442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016633	TCC	2	6	614946	614951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_016633	TCCA	2	8	618123	618130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_016633	GAAAA	2	10	618196	618205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016633	TTG	2	6	618222	618227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016633	CAGG	2	8	618329	618336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1140	NC_016633	ACG	3	9	618373	618381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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