MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016633	CTT	2	6	260827	260832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016633	AGGT	2	8	260861	260868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016633	TGC	2	6	260941	260946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016633	A	7	7	260973	260979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016633	TTTTC	2	10	260985	260994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
506	NC_016633	T	6	6	261048	261053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016633	CCGG	2	8	261061	261068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_016633	T	7	7	261127	261133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016633	A	7	7	261159	261165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016633	T	7	7	262885	262891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016633	ACT	2	6	262941	262946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016633	TTG	2	6	267888	267893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016633	AAT	2	6	267922	267927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016633	AAG	2	6	267935	267940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016633	A	6	6	267942	267947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016633	GGGT	2	8	267991	267998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016633	GT	3	6	268012	268017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016633	AGC	2	6	268023	268028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_016633	AGCAA	2	10	268766	268775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_016633	GA	3	6	268810	268815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016633	C	6	6	268897	268902	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
522	NC_016633	TCC	2	6	269944	269949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_016633	GGAAA	2	10	270103	270112	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016633	TGA	2	6	270120	270125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016633	GTT	2	6	270184	270189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016633	TTG	2	6	270231	270236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016633	TGCT	2	8	270357	270364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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529	NC_016633	AGT	2	6	270398	270403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016633	TTACA	2	10	270464	270473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_016633	TA	3	6	270536	270541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016633	ACC	3	9	270792	270800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016633	AT	3	6	272592	272597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016633	TG	3	6	273149	273154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016633	TA	3	6	273215	273220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016633	CAT	2	6	273225	273230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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542	NC_016633	TAA	2	6	277585	277590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016633	AT	3	6	277597	277602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016633	GAA	2	6	277648	277653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016633	ATG	2	6	277674	277679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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547	NC_016633	A	8	8	278927	278934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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550	NC_016633	G	6	6	278962	278967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016633	TGT	2	6	282617	282622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016633	ACT	2	6	282627	282632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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554	NC_016633	GA	3	6	282654	282659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016633	GAT	2	6	282708	282713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016633	CAA	2	6	282722	282727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016633	AT	3	6	282837	282842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016633	TGGAT	2	10	282901	282910	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016633	GA	3	6	282919	282924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016633	A	8	8	282957	282964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016633	GTCG	2	8	283055	283062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_016633	TA	3	6	283067	283072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016633	GA	3	6	283087	283092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016633	GGT	2	6	283856	283861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016633	GTAT	2	8	283872	283879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016633	T	6	6	283879	283884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016633	A	6	6	283905	283910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_016633	ATA	2	6	284050	284055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_016633	TTAC	2	8	284126	284133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_016633	ACT	2	6	284137	284142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016633	TTGG	2	8	284164	284171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016633	CTG	2	6	284203	284208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016633	GAA	2	6	284259	284264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016633	TCT	2	6	284296	284301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_016633	T	6	6	286911	286916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016633	AT	3	6	286955	286960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016633	ATC	2	6	286971	286976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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583	NC_016633	CCTG	2	8	287129	287136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
584	NC_016633	TA	3	6	287190	287195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016633	A	6	6	287197	287202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_016633	ATC	2	6	287347	287352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_016633	ATG	2	6	287537	287542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_016633	GA	3	6	290932	290937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016633	GA	3	6	291006	291011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016633	CGT	2	6	291060	291065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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611	NC_016633	AAT	2	6	291144	291149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016633	ATGC	2	8	292955	292962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_016633	T	6	6	292974	292979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016633	TGTAT	2	10	293313	293322	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016633	TACG	2	8	293342	293349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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619	NC_016633	TCG	2	6	294887	294892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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621	NC_016633	CTG	3	9	295008	295016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016633	ATC	2	6	295029	295034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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626	NC_016633	TTGA	2	8	295194	295201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016633	TGAA	2	8	295278	295285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016633	AGT	2	6	295353	295358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016633	T	7	7	295378	295384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016633	ATA	2	6	295437	295442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016633	T	6	6	298791	298796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016633	TAA	2	6	298840	298845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016633	AGTGT	2	10	298873	298882	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016633	AAG	2	6	298889	298894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016633	AAT	2	6	298917	298922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016633	AAC	2	6	298929	298934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016633	TGAA	2	8	298936	298943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016633	AATGG	2	10	299042	299051	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016633	TTC	2	6	299054	299059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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927	NC_016633	T	6	6	478237	478242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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