MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_016633	ACC	2	6	3521151	3521156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_016633	AGA	2	6	3521234	3521239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_016633	TGA	2	6	3521378	3521383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_016633	TCG	2	6	3521386	3521391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_016633	GCG	2	6	3521573	3521578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_016633	AAC	2	6	3521613	3521618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_016633	AT	3	6	3521628	3521633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_016633	AGT	2	6	3521683	3521688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_016633	AG	3	6	3521821	3521826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_016633	CGT	2	6	3521908	3521913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_016633	CCAT	2	8	3521948	3521955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_016633	CAA	2	6	3521959	3521964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_016633	ATG	2	6	3522091	3522096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_016633	GGT	2	6	3522099	3522104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_016633	CTA	2	6	3522214	3522219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_016633	AC	3	6	3522275	3522280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7517	NC_016633	TAAGC	2	10	3522294	3522303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7518	NC_016633	T	6	6	3522358	3522363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_016633	ATT	2	6	3522632	3522637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_016633	CCA	2	6	3522753	3522758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7521	NC_016633	AAAC	2	8	3522805	3522812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7522	NC_016633	TGG	2	6	3522813	3522818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_016633	TTA	2	6	3522943	3522948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_016633	AAAC	2	8	3523001	3523008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7525	NC_016633	ATC	2	6	3523288	3523293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_016633	AGA	3	9	3523483	3523491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_016633	TA	3	6	3523556	3523561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_016633	AGC	2	6	3523610	3523615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_016633	GGGT	2	8	3523653	3523660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_016633	AGT	2	6	3523682	3523687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_016633	A	7	7	3523702	3523708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_016633	A	6	6	3523722	3523727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_016633	A	6	6	3523773	3523778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_016633	CTG	2	6	3524911	3524916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_016633	TGA	2	6	3524926	3524931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_016633	AAGA	2	8	3524940	3524947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_016633	CGTG	2	8	3524978	3524985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_016633	ACT	2	6	3525001	3525006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_016633	TA	3	6	3525027	3525032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_016633	GCAG	2	8	3525278	3525285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7541	NC_016633	T	7	7	3525288	3525294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_016633	GTTTT	2	10	3525295	3525304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_016633	CAA	2	6	3528253	3528258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_016633	CTT	2	6	3528274	3528279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_016633	TCC	2	6	3528355	3528360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_016633	TAT	2	6	3528368	3528373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_016633	CAGT	2	8	3529544	3529551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7548	NC_016633	GCAT	2	8	3529581	3529588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7549	NC_016633	A	6	6	3529666	3529671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_016633	CTG	2	6	3529675	3529680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_016633	TATG	2	8	3529694	3529701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_016633	GATTT	2	10	3529879	3529888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_016633	GCA	2	6	3529942	3529947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_016633	TC	3	6	3529967	3529972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7555	NC_016633	CTT	2	6	3530094	3530099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_016633	AGC	2	6	3530106	3530111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_016633	A	6	6	3530169	3530174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_016633	CAT	2	6	3531425	3531430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_016633	AATG	2	8	3531512	3531519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_016633	AGA	2	6	3531545	3531550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_016633	AAG	3	9	3531552	3531560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_016633	T	9	9	3531575	3531583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_016633	AT	3	6	3531644	3531649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_016633	AAAT	2	8	3531664	3531671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_016633	A	6	6	3531683	3531688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_016633	TGTT	2	8	3531711	3531718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_016633	TGT	2	6	3531760	3531765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7570	NC_016633	T	7	7	3531947	3531953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_016633	AGT	2	6	3532012	3532017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7575	NC_016633	GGT	2	6	3532110	3532115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_016633	TCCC	2	8	3532121	3532128	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7577	NC_016633	T	8	8	3532138	3532145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_016633	GGA	2	6	3532152	3532157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7589	NC_016633	T	6	6	3546380	3546385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_016633	CAGT	2	8	3548065	3548072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7593	NC_016633	T	7	7	3551279	3551285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7603	NC_016633	CT	3	6	3558465	3558470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_016633	TC	3	6	3558499	3558504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7605	NC_016633	AT	3	6	3562032	3562037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_016633	CAC	2	6	3562064	3562069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7607	NC_016633	TA	3	6	3562112	3562117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_016633	T	6	6	3562177	3562182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7612	NC_016633	T	7	7	3563694	3563700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_016633	AT	3	6	3563738	3563743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_016633	GGA	2	6	3563833	3563838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7620	NC_016633	ATA	2	6	3565667	3565672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_016633	TA	3	6	3565757	3565762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_016633	ACTA	2	8	3567722	3567729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7623	NC_016633	TTTA	2	8	3567732	3567739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7628	NC_016633	T	6	6	3574050	3574055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7633	NC_016633	TGTA	2	8	3575975	3575982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7634	NC_016633	TCA	2	6	3575988	3575993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7635	NC_016633	T	6	6	3576859	3576864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7636	NC_016633	TTGGGT	2	12	3576881	3576892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7637	NC_016633	TAAA	2	8	3576945	3576952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7638	NC_016633	TCC	2	6	3578612	3578617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7639	NC_016633	GAA	2	6	3578622	3578627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7641	NC_016633	ATA	2	6	3578698	3578703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7642	NC_016633	TTA	2	6	3578708	3578713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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