MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 9853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	CTG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015976	CTGTC	2	10	106	115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015976	CCG	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015976	AAG	3	9	3817	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015976	CGG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015976	GAT	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015976	GCGGG	2	10	4450	4459	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015976	CTCG	2	8	4471	4478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015976	ACCCC	2	10	4505	4514	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_015976	CGG	3	9	4519	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015976	CAT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015976	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015976	G	6	6	6008	6013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015976	CTTGTT	2	12	6749	6760	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015976	CGC	2	6	7331	7336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015976	GCT	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015976	GTCCG	2	10	7483	7492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015976	GA	3	6	7522	7527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015976	CCG	3	9	9478	9486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015976	CG	4	8	9485	9492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015976	CGGCG	2	10	9508	9517	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015976	CG	3	6	9516	9521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015976	TCAG	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015976	GA	3	6	9680	9685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015976	CCGCG	2	10	9721	9730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_015976	G	6	6	11103	11108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015976	CCG	2	6	11835	11840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015976	CGC	2	6	11863	11868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015976	CT	3	6	16531	16536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015976	GC	3	6	16562	16567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015976	TCG	2	6	18005	18010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015976	CCG	2	6	18013	18018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015976	TGT	2	6	18099	18104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015976	CGG	2	6	18135	18140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015976	GGA	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015976	GCCCGC	2	12	18175	18186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015976	CCGC	2	8	18191	18198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015976	CCA	2	6	18238	18243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015976	CTG	2	6	18244	18249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015976	GCC	2	6	18256	18261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015976	TTC	2	6	18403	18408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015976	CGG	2	6	18414	18419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015976	CCG	2	6	18480	18485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015976	GCC	2	6	18489	18494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015976	AGCGA	2	10	18537	18546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015976	ATG	2	6	18551	18556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015976	CGC	2	6	19201	19206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015976	CG	3	6	19215	19220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015976	GTC	2	6	19260	19265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015976	CGG	2	6	19298	19303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015976	GCA	2	6	19623	19628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015976	CCG	2	6	20371	20376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015976	GAT	2	6	20485	20490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015976	TGC	2	6	22396	22401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015976	GC	3	6	22412	22417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015976	GCGG	2	8	22419	22426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015976	CGA	2	6	22512	22517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015976	GCC	2	6	22536	22541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015976	CGAG	2	8	22544	22551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015976	CGA	2	6	22552	22557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015976	CGG	2	6	22579	22584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015976	ATT	2	6	22632	22637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015976	GAT	2	6	24393	24398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015976	CCTG	2	8	26718	26725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015976	CGG	2	6	26738	26743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015976	GCTCC	2	10	27833	27842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015976	CAT	3	9	27861	27869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015976	GCG	2	6	29397	29402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015976	ATG	2	6	29438	29443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015976	GC	3	6	29486	29491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015976	GGC	2	6	29501	29506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015976	GGC	2	6	29529	29534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015976	CG	3	6	29723	29728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015976	CGGAA	2	10	30351	30360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015976	AG	3	6	30370	30375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015976	GCG	2	6	32106	32111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015976	GC	3	6	32129	32134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015976	TGAA	2	8	32144	32151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015976	GCC	2	6	33518	33523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015976	CT	3	6	34091	34096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015976	TGC	2	6	38599	38604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015976	GATC	2	8	40231	40238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015976	CG	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015976	GCG	2	6	41333	41338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015976	GC	3	6	42155	42160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015976	CG	3	6	43768	43773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015976	GCG	2	6	45958	45963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015976	GAT	2	6	46033	46038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015976	TGG	2	6	46052	46057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015976	GC	3	6	46072	46077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015976	GGC	2	6	48772	48777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015976	CGA	2	6	50113	50118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015976	TC	3	6	50780	50785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015976	CGGG	2	8	52678	52685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015976	GCT	2	6	52722	52727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015976	GAT	2	6	52758	52763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015976	GC	3	6	52797	52802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015976	GCCC	2	8	52853	52860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_015976	CGG	3	9	55174	55182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015976	CGC	2	6	55193	55198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015976	ACCG	2	8	55199	55206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015976	CGGGA	2	10	55241	55250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015976	GCG	3	9	57655	57663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015976	GGCC	2	8	57679	57686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015976	CCA	2	6	58528	58533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015976	GTC	2	6	58543	58548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015976	CCAA	2	8	58556	58563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015976	TGCA	2	8	58575	58582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015976	TTG	2	6	58618	58623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015976	ATCC	2	8	58677	58684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015976	GGC	2	6	60374	60379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015976	CG	3	6	61879	61884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015976	GCG	2	6	61907	61912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015976	CGC	2	6	61983	61988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015976	GC	3	6	61987	61992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015976	TTCC	2	8	62808	62815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015976	GGCT	2	8	62817	62824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015976	CCG	2	6	62825	62830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015976	A	6	6	62969	62974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015976	CGA	2	6	63815	63820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015976	GAT	2	6	63824	63829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015976	CGG	2	6	63831	63836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015976	GCCGC	2	10	63853	63862	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015976	GCC	2	6	63875	63880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015976	GC	3	6	63889	63894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015976	AAAG	2	8	66428	66435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015976	TTCC	2	8	66495	66502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015976	CGG	2	6	68475	68480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015976	GCG	2	6	68504	68509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015976	CG	3	6	71370	71375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015976	AGG	2	6	71381	71386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015976	GCA	2	6	72673	72678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015976	GGCCC	2	10	72695	72704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_015976	GGC	2	6	75447	75452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015976	CGG	3	9	75471	75479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015976	GCCA	3	12	75525	75536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015976	GCGG	2	8	78588	78595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015976	GC	3	6	78598	78603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015976	GA	3	6	78673	78678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015976	GCT	2	6	78688	78693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015976	CGG	2	6	78711	78716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015976	AAC	2	6	78760	78765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015976	GAAC	2	8	78782	78789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015976	TCCA	2	8	79199	79206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015976	GCC	2	6	80898	80903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015976	CGG	2	6	80911	80916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015976	CTT	2	6	80918	80923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015976	TTCG	2	8	80984	80991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015976	CGG	2	6	81026	81031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015976	GCCGC	2	10	81058	81067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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152	NC_015976	ATCC	2	8	81155	81162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015976	TCCC	2	8	81173	81180	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_015976	CGG	2	6	81958	81963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015976	GCCCG	2	10	82000	82009	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_015976	G	6	6	82031	82036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015976	CAGC	2	8	82384	82391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_015976	CCG	2	6	82819	82824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_015976	CTG	2	6	85653	85658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015976	AAC	2	6	89871	89876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_015976	CGG	2	6	119617	119622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_015976	GC	3	6	123580	123585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
274	NC_015976	CGGC	2	8	124782	124789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
275	NC_015976	TAT	2	6	124813	124818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015976	TCA	2	6	126118	126123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_015976	GAG	2	6	126165	126170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015976	GAG	2	6	126226	126231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015976	GAT	2	6	126359	126364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_015976	GAT	2	6	126462	126467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015976	TGCCT	2	10	126493	126502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_015976	GCG	2	6	126519	126524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_015976	GCG	2	6	126587	126592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_015976	GC	3	6	126605	126610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_015976	ACC	2	6	126731	126736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_015976	CAA	2	6	133554	133559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_015976	GAAT	2	8	133603	133610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_015976	C	6	6	205742	205747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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420	NC_015976	GCG	2	6	207727	207732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_015976	CGG	2	6	207738	207743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_015976	AG	3	6	207756	207761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015976	GC	3	6	207762	207767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_015976	CGGC	2	8	212805	212812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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442	NC_015976	GCTC	2	8	216510	216517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_015976	CGG	2	6	217916	217921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_015976	CG	3	6	229003	229008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_015976	GCC	2	6	229015	229020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_015976	GGA	2	6	229029	229034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015976	CGG	2	6	231613	231618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_015976	GGC	3	9	231621	231629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_015976	GAT	2	6	231658	231663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_015976	CGG	2	6	231796	231801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_015976	GCG	2	6	231811	231816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_015976	GCC	2	6	231835	231840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
476	NC_015976	CG	3	6	231887	231892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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479	NC_015976	CCT	2	6	234676	234681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
480	NC_015976	GCGCA	2	10	234751	234760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
481	NC_015976	GGA	2	6	234777	234782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_015976	CGT	2	6	238211	238216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_015976	GC	3	6	238245	238250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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