MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	CCGT	2	8	788	795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015952	GCTG	2	8	2920	2927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015952	ACGG	2	8	5083	5090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015952	CCGC	2	8	5646	5653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015952	AGGT	2	8	5805	5812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015952	CCGG	2	8	7375	7382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015952	ACGG	2	8	15475	15482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015952	CTTC	2	8	31035	31042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015952	GTCC	2	8	31202	31209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015952	GAAC	2	8	33780	33787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015952	GACC	2	8	40659	40666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015952	TCCG	2	8	41522	41529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015952	CGGC	2	8	42576	42583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015952	TGGG	2	8	47620	47627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015952	CCGG	2	8	51373	51380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015952	TGCA	2	8	53499	53506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015952	TGCC	4	16	53566	53581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015952	ACAG	2	8	53815	53822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015952	CGTG	2	8	63198	63205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015952	AAGG	2	8	67193	67200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015952	CCGG	2	8	69538	69545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015952	CAGA	2	8	71653	71660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015952	GAAC	2	8	74074	74081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015952	AGGA	2	8	77992	77999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015952	AGGA	2	8	79592	79599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015952	TCGG	2	8	80861	80868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015952	CCTG	2	8	81656	81663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015952	GACC	2	8	82613	82620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015952	CGAT	2	8	84895	84902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015952	GCTG	2	8	84997	85004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015952	CGGG	2	8	85831	85838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015952	AGGA	2	8	85906	85913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015952	AGGA	2	8	88322	88329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015952	TCCT	2	8	89780	89787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015952	GCCC	2	8	89823	89830	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_015952	CCAC	2	8	92632	92639	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015952	CGAA	2	8	92700	92707	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015952	CGCC	2	8	92779	92786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015952	GAAT	2	8	92940	92947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015952	TCAC	2	8	95624	95631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015952	CCGC	2	8	96592	96599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_015952	GCAT	2	8	100037	100044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015952	CCGG	2	8	100924	100931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015952	AGTC	2	8	101117	101124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015952	ATCG	2	8	102291	102298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015952	GCGG	2	8	102323	102330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015952	TGAA	2	8	102379	102386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015952	GCTT	2	8	102609	102616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015952	CCGC	2	8	104180	104187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_015952	GGGC	2	8	110451	110458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015952	GACC	2	8	110807	110814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015952	CCGG	2	8	110822	110829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015952	GCAG	2	8	119528	119535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015952	TGAC	2	8	120566	120573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015952	GGGC	2	8	122513	122520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015952	ACCG	2	8	122992	122999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015952	CGTT	2	8	123598	123605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015952	TGGG	2	8	125180	125187	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015952	CCCG	2	8	125515	125522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015952	GCCT	2	8	129360	129367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015952	CCCG	2	8	130834	130841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_015952	CTGT	2	8	131251	131258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015952	TCCG	2	8	133021	133028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015952	GGCT	2	8	133030	133037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015952	TCCG	2	8	133120	133127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015952	CCGG	2	8	136074	136081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015952	AGGA	2	8	136429	136436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015952	CCGC	2	8	136448	136455	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_015952	CCCA	2	8	136536	136543	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_015952	CCGG	2	8	140263	140270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015952	CCGC	2	8	140820	140827	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_015952	CCGG	2	8	141986	141993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015952	ACCC	2	8	142486	142493	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_015952	CCTT	2	8	144636	144643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015952	CCCG	2	8	149552	149559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_015952	CGGC	2	8	149623	149630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015952	GGGC	2	8	158724	158731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015952	CGGG	2	8	158744	158751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015952	CATC	2	8	160037	160044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015952	CAGG	2	8	160502	160509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015952	CCCA	2	8	162813	162820	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015952	CCGG	2	8	164272	164279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015952	CGGT	2	8	165611	165618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015952	ACCG	2	8	167303	167310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015952	CCGG	2	8	174635	174642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015952	CTGC	2	8	181365	181372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015952	CGGG	2	8	184006	184013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015952	CTCC	2	8	184075	184082	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_015952	AGCT	2	8	184420	184427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015952	CATG	2	8	185243	185250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015952	TGGC	2	8	185421	185428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015952	CTTG	2	8	185543	185550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.