MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	ACC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015952	CGA	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015952	GGT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015952	CGG	2	6	2851	2856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015952	CCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015952	GCT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015952	CGC	2	6	5043	5048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015952	CGG	3	9	5144	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015952	CAC	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015952	ATG	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015952	CCG	2	6	5634	5639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015952	GCC	2	6	5660	5665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015952	GAG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015952	CCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015952	TGA	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015952	CCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015952	CAC	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015952	GAG	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015952	TGC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015952	ACT	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015952	TCG	2	6	12627	12632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015952	CGG	2	6	12644	12649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015952	GCG	2	6	12652	12657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015952	CAG	2	6	12658	12663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015952	AGG	2	6	14135	14140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015952	AGT	2	6	14173	14178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015952	CTG	2	6	14193	14198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015952	CAC	2	6	14956	14961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015952	GTG	2	6	15447	15452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015952	TGA	3	9	16178	16186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015952	TCG	2	6	16193	16198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015952	GTC	2	6	16212	16217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015952	GGT	2	6	16706	16711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015952	AGG	2	6	17042	17047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015952	CCG	2	6	17440	17445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015952	TCC	2	6	19987	19992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015952	CCG	2	6	21475	21480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015952	CGC	2	6	25386	25391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015952	GTC	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015952	GCC	2	6	27204	27209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015952	TTC	2	6	29657	29662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015952	GCT	2	6	31025	31030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015952	GAT	2	6	31045	31050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015952	GGC	2	6	31155	31160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015952	GGA	2	6	31161	31166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015952	GCC	2	6	31216	31221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015952	GGA	2	6	33678	33683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015952	GCG	2	6	33760	33765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015952	CGC	2	6	33766	33771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015952	GCC	2	6	33834	33839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015952	GGC	2	6	33901	33906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015952	TCC	2	6	34537	34542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015952	CTT	2	6	34617	34622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015952	TCG	2	6	39898	39903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015952	ATC	2	6	40043	40048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015952	GGA	3	9	40060	40068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015952	ACG	2	6	40070	40075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015952	GAA	2	6	40498	40503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015952	CCG	2	6	40515	40520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015952	ACG	2	6	41358	41363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015952	TGC	2	6	41378	41383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015952	GCG	2	6	41532	41537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015952	GTG	2	6	42594	42599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015952	CAC	2	6	42642	42647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015952	CGG	2	6	42673	42678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015952	CGC	2	6	43882	43887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015952	GTG	2	6	43896	43901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015952	TCC	2	6	45834	45839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015952	GTG	2	6	45851	45856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015952	CCG	2	6	49510	49515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015952	TCC	2	6	49526	49531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015952	AGC	2	6	49563	49568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015952	GCC	2	6	49587	49592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015952	GGC	2	6	49636	49641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015952	GGC	2	6	49667	49672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015952	GCT	2	6	50706	50711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015952	GCT	2	6	50713	50718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015952	CAT	2	6	51305	51310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015952	CAC	2	6	51365	51370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015952	CTG	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015952	CCT	2	6	51410	51415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015952	GGC	2	6	53156	53161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015952	GAT	2	6	53166	53171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015952	TCG	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015952	CGA	2	6	53213	53218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015952	GCG	2	6	53253	53258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015952	CCG	2	6	53292	53297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015952	GGT	2	6	53450	53455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015952	ATC	2	6	53461	53466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015952	TGG	2	6	53706	53711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015952	CGG	2	6	62234	62239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015952	CCA	2	6	62249	62254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015952	GCA	2	6	62615	62620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015952	CAC	2	6	62623	62628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015952	GCC	2	6	62655	62660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015952	CGG	2	6	63182	63187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015952	CCG	2	6	63214	63219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015952	ATG	2	6	63245	63250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015952	CTC	2	6	63362	63367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015952	TGG	2	6	63411	63416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015952	CGG	2	6	63437	63442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015952	GGA	2	6	64800	64805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015952	CGG	2	6	65715	65720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015952	CCG	2	6	67139	67144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015952	CGG	2	6	67160	67165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015952	CGG	2	6	67849	67854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015952	GCA	2	6	69574	69579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015952	ACG	2	6	69581	69586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015952	GGA	2	6	69589	69594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015952	CCG	2	6	71532	71537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015952	CGG	2	6	71546	71551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015952	CGA	3	9	74016	74024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015952	CCT	2	6	75478	75483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015952	GCC	2	6	75558	75563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015952	GGC	2	6	75575	75580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015952	GTG	2	6	75591	75596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015952	GCG	2	6	76152	76157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015952	CAG	2	6	76212	76217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015952	GAC	2	6	77309	77314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015952	CGA	2	6	77936	77941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015952	ACG	2	6	78890	78895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015952	CGG	2	6	78910	78915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015952	ACC	2	6	78944	78949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015952	CCG	2	6	79518	79523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015952	ATG	2	6	80903	80908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015952	GCT	2	6	81645	81650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015952	CGC	2	6	81671	81676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015952	CGG	2	6	81682	81687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015952	TGG	2	6	82586	82591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015952	CCG	2	6	82634	82639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015952	CAC	2	6	82676	82681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015952	ACG	2	6	82716	82721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015952	GCC	2	6	84379	84384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015952	GCT	2	6	84700	84705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015952	GCG	2	6	84726	84731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015952	CCT	2	6	84733	84738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015952	CAG	2	6	84844	84849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015952	GCC	3	9	84852	84860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015952	CAT	2	6	85058	85063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015952	CCG	2	6	85874	85879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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407	NC_015952	GCG	2	6	185412	185417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_015952	GAT	2	6	185488	185493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_015952	GCG	2	6	185593	185598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_015952	TGC	2	6	185655	185660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_015952	CGC	2	6	185769	185774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_015952	CAT	2	6	185779	185784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_015952	TCA	2	6	187757	187762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_015952	TAC	2	6	190763	190768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_015952	GCC	2	6	190785	190790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
416	NC_015952	CGC	2	6	190817	190822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_015952	CGC	2	6	190829	190834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_015952	ATC	2	6	190842	190847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_015952	CGT	2	6	190853	190858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_015952	GGA	2	6	191025	191030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.