MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015952	CCGG	2	8	140263	140270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015952	CGGCAC	2	12	140279	140290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
503	NC_015952	GTC	2	6	140792	140797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015952	ACC	2	6	140811	140816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_015952	CCGC	2	8	140820	140827	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
506	NC_015952	TCC	2	6	140848	140853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_015952	ATC	2	6	140880	140885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015952	GC	3	6	140886	140891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015952	GAG	2	6	140943	140948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015952	AGG	2	6	140955	140960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015952	TCG	2	6	140961	140966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015952	CCGGG	2	10	141003	141012	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
513	NC_015952	C	7	7	141015	141021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
514	NC_015952	CCGG	2	8	141986	141993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_015952	GCT	3	9	142053	142061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015952	CA	3	6	142432	142437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015952	GCA	3	9	142462	142470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015952	ACCC	2	8	142486	142493	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
519	NC_015952	GT	3	6	144108	144113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015952	CAA	2	6	144130	144135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015952	CGC	2	6	144251	144256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015952	CGC	2	6	144276	144281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015952	CGC	2	6	144292	144297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_015952	ACC	2	6	144587	144592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_015952	CCTT	2	8	144636	144643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_015952	CG	3	6	144658	144663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015952	GCC	2	6	144666	144671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015952	GCC	2	6	145733	145738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015952	CGG	2	6	145754	145759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015952	CTC	2	6	146033	146038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015952	GCT	2	6	146142	146147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015952	TG	3	6	146158	146163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015952	GCA	2	6	146653	146658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015952	GAG	2	6	146672	146677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015952	TGC	2	6	147909	147914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015952	TCCCG	2	10	147981	147990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
537	NC_015952	CTG	2	6	148046	148051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015952	C	6	6	149424	149429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_015952	TG	3	6	149445	149450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015952	TAG	2	6	149455	149460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015952	ACC	2	6	149467	149472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_015952	GAG	2	6	149518	149523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015952	CGG	2	6	149534	149539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015952	CCCG	2	8	149552	149559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
545	NC_015952	GCG	2	6	149565	149570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015952	CGG	2	6	149580	149585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015952	CG	3	6	149592	149597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_015952	CCG	2	6	149610	149615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_015952	CGGC	2	8	149623	149630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015952	CG	3	6	149641	149646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015952	CGG	2	6	149656	149661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015952	AGC	2	6	149665	149670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015952	C	6	6	149679	149684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
554	NC_015952	GCC	2	6	149685	149690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015952	GAG	2	6	149708	149713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015952	TCG	2	6	154053	154058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015952	GGT	2	6	154970	154975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015952	GGC	2	6	155566	155571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015952	CCT	2	6	155588	155593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_015952	GGC	2	6	156460	156465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015952	GC	3	6	156514	156519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015952	GC	3	6	156531	156536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015952	GGC	2	6	158468	158473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015952	TGA	2	6	158529	158534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015952	CCT	2	6	158567	158572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015952	TCC	2	6	158633	158638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_015952	CCG	2	6	158681	158686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015952	GGGC	2	8	158724	158731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
569	NC_015952	CGGG	2	8	158744	158751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
570	NC_015952	CGG	2	6	158755	158760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015952	CATC	2	8	160037	160044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_015952	CG	3	6	160464	160469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_015952	CAGG	2	8	160502	160509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_015952	TGG	2	6	161886	161891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015952	AGG	2	6	161981	161986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015952	CCT	2	6	162028	162033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015952	C	6	6	162035	162040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
578	NC_015952	CCCA	2	8	162813	162820	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
579	NC_015952	CG	3	6	163342	163347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_015952	CCGG	2	8	164272	164279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_015952	TTC	2	6	165602	165607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015952	CGGT	2	8	165611	165618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_015952	GC	3	6	167136	167141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015952	GCC	2	6	167182	167187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_015952	GCC	2	6	167222	167227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015952	GGC	2	6	167237	167242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015952	GGCCC	2	10	167256	167265	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
588	NC_015952	GGC	2	6	167294	167299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015952	ACCG	2	8	167303	167310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_015952	GCG	2	6	167311	167316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015952	GCG	2	6	167888	167893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015952	GGC	2	6	167901	167906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015952	GCC	2	6	167912	167917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_015952	AG	3	6	167931	167936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015952	TGC	2	6	167949	167954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015952	GCC	2	6	168001	168006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_015952	TCA	2	6	168348	168353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015952	ACC	2	6	168394	168399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_015952	CCGGG	2	10	169727	169736	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
600	NC_015952	CTC	2	6	171626	171631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_015952	GCC	2	6	171641	171646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015952	TCC	2	6	171654	171659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_015952	CCT	2	6	171661	171666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_015952	AGG	2	6	171674	171679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015952	GTGGG	2	10	174363	174372	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015952	GCG	2	6	174390	174395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015952	GCC	2	6	174401	174406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015952	GGT	2	6	174419	174424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015952	GTGCCG	2	12	174470	174481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015952	GCG	2	6	174512	174517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015952	CAG	2	6	174565	174570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015952	CGC	2	6	174580	174585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_015952	CGG	2	6	174594	174599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015952	CCGG	2	8	174635	174642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_015952	GGC	2	6	174679	174684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015952	GTG	2	6	178073	178078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015952	TCC	2	6	178522	178527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015952	GAG	2	6	178531	178536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015952	GCG	2	6	179585	179590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015952	CGC	2	6	179619	179624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_015952	GTG	2	6	179653	179658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015952	CGC	2	6	179667	179672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_015952	AGGGG	2	10	179848	179857	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015952	CA	3	6	181250	181255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_015952	ACC	2	6	181351	181356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_015952	CTGC	2	8	181365	181372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015952	CCCAC	2	10	181404	181413	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
628	NC_015952	GAA	2	6	181461	181466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015952	TAC	2	6	181474	181479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015952	CCA	2	6	183254	183259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015952	GAG	2	6	183541	183546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015952	GCC	2	6	183561	183566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015952	GAC	2	6	183619	183624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015952	GGC	2	6	183636	183641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015952	GGC	2	6	183966	183971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015952	GCC	2	6	183991	183996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_015952	CGGG	2	8	184006	184013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
638	NC_015952	TGC	2	6	184019	184024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_015952	GCG	2	6	184060	184065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015952	CTCC	2	8	184075	184082	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
641	NC_015952	AAG	2	6	184086	184091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015952	CCG	2	6	184154	184159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_015952	TCC	2	6	184162	184167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_015952	TCG	2	6	184169	184174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_015952	CGA	2	6	184183	184188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_015952	CAT	3	9	184237	184245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_015952	CCA	2	6	184247	184252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_015952	CGA	2	6	184275	184280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_015952	CTA	2	6	184308	184313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_015952	AGCT	2	8	184420	184427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
651	NC_015952	CCA	2	6	185191	185196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_015952	GTC	2	6	185197	185202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_015952	CATG	2	8	185243	185250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
654	NC_015952	CT	3	6	185282	185287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
655	NC_015952	AAG	2	6	185291	185296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_015952	CT	3	6	185306	185311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
657	NC_015952	GCG	2	6	185412	185417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_015952	TGGC	2	8	185421	185428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
659	NC_015952	GAT	2	6	185488	185493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
660	NC_015952	TC	3	6	185505	185510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
661	NC_015952	GT	3	6	185531	185536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
662	NC_015952	CTTG	2	8	185543	185550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
663	NC_015952	GCG	2	6	185593	185598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_015952	TGC	2	6	185655	185660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_015952	GC	3	6	185742	185747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
666	NC_015952	GC	3	6	185756	185761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
667	NC_015952	CGC	2	6	185769	185774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_015952	CAT	2	6	185779	185784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_015952	CT	3	6	186092	186097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
670	NC_015952	TCA	2	6	187757	187762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_015952	GCCTC	2	10	187794	187803	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
672	NC_015952	AG	3	6	188668	188673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
673	NC_015952	TAC	2	6	190763	190768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_015952	GCC	2	6	190785	190790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
675	NC_015952	G	6	6	190797	190802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
676	NC_015952	CGC	2	6	190817	190822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
677	NC_015952	CGC	2	6	190829	190834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
678	NC_015952	ATC	2	6	190842	190847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
679	NC_015952	CGT	2	6	190853	190858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
680	NC_015952	GGA	2	6	191025	191030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.