MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	CA	4	8	422	429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015951	AT	3	6	482	487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015951	GC	3	6	894	899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015951	CG	3	6	2961	2966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015951	GA	3	6	4612	4617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015951	TG	3	6	4734	4739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015951	GT	3	6	7859	7864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015951	GT	3	6	10896	10901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015951	GT	3	6	10943	10948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015951	CG	3	6	11647	11652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015951	GC	3	6	13699	13704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015951	GC	4	8	13978	13985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015951	GT	3	6	14032	14037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015951	GC	3	6	17630	17635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015951	GC	3	6	17790	17795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015951	GC	4	8	17866	17873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015951	GC	3	6	18083	18088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015951	CG	3	6	18190	18195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015951	CG	3	6	18373	18378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015951	CG	3	6	18682	18687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015951	GC	3	6	18827	18832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015951	CG	3	6	29302	29307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015951	GC	3	6	31388	31393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015951	GT	3	6	31648	31653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015951	CG	3	6	31710	31715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015951	CG	3	6	32569	32574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015951	GA	3	6	33114	33119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015951	GC	3	6	37461	37466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015951	GC	3	6	37483	37488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015951	GC	3	6	38207	38212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015951	CA	3	6	38281	38286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015951	GC	3	6	43808	43813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015951	GC	3	6	44769	44774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015951	GC	3	6	44786	44791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015951	CA	3	6	45596	45601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015951	CG	3	6	50743	50748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015951	CG	3	6	50832	50837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015951	GC	3	6	50948	50953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015951	CA	3	6	52748	52753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015951	TG	3	6	61241	61246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015951	CT	3	6	65014	65019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015951	CT	3	6	65071	65076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015951	GT	3	6	65804	65809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015951	CG	3	6	71742	71747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015951	GC	3	6	72362	72367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015951	CA	3	6	74661	74666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015951	GC	3	6	75509	75514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015951	CT	3	6	77150	77155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015951	GT	3	6	77196	77201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015951	CA	3	6	77807	77812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015951	CT	3	6	79275	79280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015951	CA	3	6	79971	79976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015951	GC	3	6	80918	80923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015951	GC	3	6	81027	81032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015951	GC	3	6	81738	81743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015951	TC	3	6	82247	82252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015951	GA	3	6	83196	83201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015951	CG	3	6	83212	83217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015951	GA	3	6	83224	83229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015951	GC	4	8	83430	83437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015951	TG	3	6	83576	83581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015951	CT	3	6	87084	87089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015951	GC	3	6	87430	87435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015951	TC	3	6	87737	87742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015951	GC	3	6	87757	87762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015951	CG	3	6	87860	87865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015951	TC	3	6	87939	87944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015951	GA	3	6	88853	88858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015951	GC	3	6	92976	92981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015951	CG	3	6	93028	93033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015951	GC	3	6	93698	93703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015951	CG	3	6	94365	94370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015951	CG	3	6	102609	102614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015951	CA	3	6	103043	103048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015951	CG	3	6	103654	103659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015951	CG	3	6	104621	104626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015951	CG	3	6	104682	104687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015951	CG	3	6	104743	104748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015951	CG	3	6	104804	104809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015951	AG	3	6	104870	104875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015951	CG	3	6	106961	106966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015951	AG	3	6	107028	107033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015951	CG	3	6	107084	107089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015951	CG	3	6	107145	107150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015951	CG	3	6	107206	107211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015951	CG	3	6	107267	107272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015951	CG	3	6	107328	107333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015951	GA	3	6	107408	107413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015951	CG	3	6	113872	113877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015951	GC	3	6	116887	116892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015951	CG	3	6	116967	116972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015951	CG	3	6	117028	117033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015951	CG	3	6	117089	117094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015951	CG	3	6	117150	117155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015951	CG	3	6	117211	117216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015951	CG	3	6	117272	117277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015951	CG	3	6	117330	117335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015951	CG	3	6	117391	117396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015951	CG	3	6	119545	119550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015951	CG	4	8	120815	120822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015951	CT	3	6	120828	120833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015951	CG	3	6	121529	121534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015951	CG	3	6	121590	121595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015951	CG	3	6	121615	121620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015951	CG	3	6	121676	121681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015951	CT	3	6	125575	125580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015951	CG	3	6	125609	125614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015951	CG	3	6	125670	125675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015951	CG	3	6	125731	125736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015951	CG	3	6	125778	125783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015951	GC	3	6	125913	125918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015951	CG	3	6	125973	125978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015951	CG	3	6	126034	126039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015951	CG	4	8	129762	129769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015951	CG	3	6	131114	131119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015951	GC	3	6	134455	134460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015951	CG	3	6	134611	134616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015951	GC	3	6	134670	134675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015951	CT	3	6	134684	134689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015951	GC	3	6	138483	138488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015951	GC	3	6	139935	139940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015951	GC	3	6	140015	140020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015951	GC	3	6	140032	140037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015951	TG	3	6	141204	141209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015951	GC	3	6	142133	142138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015951	CG	3	6	149022	149027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015951	CA	3	6	150714	150719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015951	GC	3	6	151782	151787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015951	TG	3	6	155979	155984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015951	GA	3	6	156226	156231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015951	CG	3	6	156290	156295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015951	GA	3	6	157558	157563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015951	CG	3	6	158220	158225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015951	GC	3	6	158377	158382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015951	CG	3	6	159357	159362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015951	GC	3	6	159592	159597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015951	GC	3	6	159711	159716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015951	CG	3	6	159785	159790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015951	GA	3	6	161572	161577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015951	GA	3	6	164434	164439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015951	GA	3	6	169810	169815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015951	GC	3	6	175886	175891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015951	AG	3	6	176146	176151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015951	CA	3	6	176979	176984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015951	GA	3	6	178868	178873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015951	GC	3	6	185173	185178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_015951	TC	3	6	196466	196471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015951	CG	3	6	197723	197728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015951	GC	4	8	198208	198215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_015951	CG	3	6	202377	202382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_015951	TG	3	6	207603	207608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015951	CA	3	6	209204	209209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015951	CA	3	6	209887	209892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_015951	GC	3	6	217506	217511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_015951	GA	3	6	217735	217740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015951	CG	3	6	217932	217937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015951	TG	3	6	218768	218773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015951	CG	3	6	231383	231388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_015951	GC	3	6	283524	283529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_015951	AC	3	6	283572	283577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.