MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015947	TGGT	2	8	1524266	1524273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_015947	GGTG	2	8	1524935	1524942	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015947	GGGT	2	8	1526950	1526957	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015947	AGGT	2	8	1526986	1526993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015947	GTT	2	6	1527025	1527030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015947	TG	3	6	1527040	1527045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015947	GC	3	6	1527046	1527051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_015947	GCC	2	6	1529776	1529781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_015947	GAG	2	6	1529833	1529838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015947	CGG	2	6	1529858	1529863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_015947	CGG	2	6	1530595	1530600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015947	CGC	2	6	1531088	1531093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_015947	GCG	2	6	1531102	1531107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_015947	GGTG	2	8	1531129	1531136	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015947	GGC	2	6	1531551	1531556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_015947	CG	3	6	1531560	1531565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_015947	TTC	2	6	1533820	1533825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_015947	CGGC	2	8	1535544	1535551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_015947	GGT	2	6	1535612	1535617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015947	GCCG	2	8	1536016	1536023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_015947	CGGC	2	8	1536073	1536080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_015947	CGC	2	6	1536098	1536103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_015947	CGG	2	6	1536706	1536711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015947	GGC	2	6	1536736	1536741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_015947	CGGT	2	8	1536769	1536776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_015947	GAC	2	6	1537899	1537904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015947	TTGCG	2	10	1537934	1537943	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3528	NC_015947	T	7	7	1538088	1538094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015947	CTG	2	6	1541352	1541357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_015947	AAACGG	2	12	1541359	1541370	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3531	NC_015947	GCAAG	2	10	1541419	1541428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3532	NC_015947	GCG	2	6	1541451	1541456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_015947	CGC	2	6	1541461	1541466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_015947	GCA	2	6	1541495	1541500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015947	CA	3	6	1541499	1541504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_015947	GGC	2	6	1541545	1541550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_015947	GAAG	2	8	1541569	1541576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015947	GTC	2	6	1543029	1543034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015947	GCC	2	6	1543076	1543081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_015947	CCA	2	6	1543115	1543120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_015947	CCCG	2	8	1550087	1550094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3542	NC_015947	GCTTTT	2	12	1550195	1550206	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3543	NC_015947	GCC	2	6	1550793	1550798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_015947	CAGC	2	8	1550836	1550843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_015947	GCA	2	6	1552928	1552933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3547	NC_015947	AGG	2	6	1553111	1553116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015947	GGC	2	6	1553180	1553185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015947	CAC	2	6	1553267	1553272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_015947	T	6	6	1553332	1553337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015947	GCC	2	6	1553372	1553377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_015947	TGCA	2	8	1553729	1553736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_015947	GGCC	2	8	1553746	1553753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_015947	CGA	2	6	1553773	1553778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015947	AGGC	3	12	1553800	1553811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_015947	CG	3	6	1554039	1554044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_015947	CTG	2	6	1554052	1554057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015947	GCC	2	6	1554075	1554080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_015947	GCG	2	6	1554089	1554094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_015947	CGTG	2	8	1554103	1554110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_015947	G	6	6	1554401	1554406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015947	CG	3	6	1555265	1555270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_015947	GCAT	2	8	1555275	1555282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_015947	CTG	2	6	1557392	1557397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015947	CGG	3	9	1557399	1557407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_015947	GGCT	2	8	1557410	1557417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_015947	GCG	3	9	1563681	1563689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015947	CCGC	2	8	1563743	1563750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_015947	TGGA	2	8	1568993	1569000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015947	TGC	2	6	1569046	1569051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_015947	GAT	2	6	1569059	1569064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015947	TGC	2	6	1569088	1569093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_015947	CGC	2	6	1569121	1569126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_015947	A	6	6	1569147	1569152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_015947	CG	3	6	1569364	1569369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_015947	GCA	2	6	1570583	1570588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_015947	CGAA	2	8	1570622	1570629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_015947	GGCG	2	8	1570802	1570809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_015947	GAC	2	6	1570884	1570889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_015947	CAA	2	6	1570916	1570921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_015947	TGT	2	6	1571018	1571023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015947	GT	4	8	1576488	1576495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_015947	CAT	2	6	1576616	1576621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015947	TTGTC	2	10	1576628	1576637	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3585	NC_015947	GC	3	6	1576653	1576658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_015947	TTTG	2	8	1576771	1576778	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_015947	TGAA	2	8	1577223	1577230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_015947	TGCA	2	8	1577251	1577258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_015947	CGC	2	6	1577259	1577264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3591	NC_015947	CGC	2	6	1579702	1579707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_015947	GGC	2	6	1580509	1580514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015947	GCG	2	6	1583502	1583507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015947	GAG	2	6	1583532	1583537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015947	TGG	3	9	1584089	1584097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015947	GGGC	2	8	1585435	1585442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_015947	CGA	2	6	1585455	1585460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015947	CCCCAT	2	12	1585516	1585527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_015947	GACC	2	8	1586062	1586069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_015947	GGT	2	6	1586376	1586381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015947	G	6	6	1586401	1586406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015947	GT	3	6	1586415	1586420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015947	TAA	2	6	1586475	1586480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015947	GCG	2	6	1588235	1588240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_015947	CCG	2	6	1588249	1588254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_015947	GCA	2	6	1588263	1588268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3609	NC_015947	GTC	2	6	1590291	1590296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015947	GC	3	6	1590304	1590309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_015947	CGG	2	6	1590352	1590357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_015947	GTG	2	6	1590399	1590404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015947	TCCGC	2	10	1590408	1590417	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3614	NC_015947	TCC	2	6	1591772	1591777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_015947	CAGCG	2	10	1591791	1591800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3616	NC_015947	GCT	2	6	1591805	1591810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015947	GGGA	2	8	1592745	1592752	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015947	GTA	2	6	1592811	1592816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015947	GC	4	8	1593043	1593050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_015947	AGC	2	6	1593139	1593144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_015947	GTG	2	6	1596490	1596495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015947	CGT	2	6	1596514	1596519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_015947	CGGC	2	8	1596527	1596534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_015947	CCCGG	2	10	1598933	1598942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3625	NC_015947	TGG	2	6	1598952	1598957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015947	CGA	2	6	1599029	1599034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_015947	CCTA	2	8	1599050	1599057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_015947	ATCG	2	8	1599376	1599383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_015947	GTG	2	6	1599393	1599398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_015947	TGC	2	6	1599419	1599424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_015947	TCG	2	6	1599530	1599535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3636	NC_015947	TCG	2	6	1599773	1599778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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