MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015947	ATG	2	6	1236564	1236569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015947	GGC	2	6	1238245	1238250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015947	GCG	2	6	1238276	1238281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_015947	GCCG	2	8	1242609	1242616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_015947	TGG	2	6	1243600	1243605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015947	TCCA	2	8	1243641	1243648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_015947	TGG	2	6	1243678	1243683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015947	GGTG	2	8	1243700	1243707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015947	GGGCA	2	10	1243773	1243782	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_015947	GGA	2	6	1243801	1243806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015947	GTT	2	6	1243813	1243818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015947	GTG	2	6	1248135	1248140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015947	TAC	2	6	1248169	1248174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015947	GC	3	6	1252491	1252496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_015947	AGAGG	2	10	1252505	1252514	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015947	CGA	2	6	1252570	1252575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015947	GA	5	10	1252704	1252713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015947	CCATC	2	10	1255629	1255638	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3019	NC_015947	TGC	2	6	1255647	1255652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015947	CCAG	2	8	1255673	1255680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_015947	CCG	2	6	1256708	1256713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_015947	CCG	2	6	1256742	1256747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_015947	GCG	2	6	1256767	1256772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015947	TTTG	2	8	1256855	1256862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015947	CGGCC	2	10	1256876	1256885	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3026	NC_015947	TCGG	2	8	1256925	1256932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_015947	CGT	2	6	1256948	1256953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_015947	TTGC	2	8	1256957	1256964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_015947	GCTGG	2	10	1256968	1256977	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_015947	TCAA	2	8	1256994	1257001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_015947	TTTCTG	2	12	1257507	1257518	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3032	NC_015947	TCC	2	6	1258557	1258562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_015947	GAC	2	6	1258614	1258619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015947	CCG	2	6	1258639	1258644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015947	GCC	2	6	1258666	1258671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_015947	CGC	2	6	1258687	1258692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_015947	TGG	2	6	1258771	1258776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015947	CCTG	2	8	1258817	1258824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_015947	CAGG	2	8	1258859	1258866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_015947	GCC	2	6	1262948	1262953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_015947	GGC	2	6	1262973	1262978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015947	GAGG	2	8	1265193	1265200	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015947	GCA	2	6	1265263	1265268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015947	CGGCT	2	10	1265278	1265287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_015947	ATC	2	6	1265318	1265323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015947	TGCC	2	8	1266703	1266710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_015947	GC	3	6	1266711	1266716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_015947	CCG	2	6	1266717	1266722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_015947	CG	3	6	1266744	1266749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_015947	GCG	2	6	1266758	1266763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015947	CGA	2	6	1266809	1266814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015947	GCACC	2	10	1268719	1268728	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3053	NC_015947	CGGC	2	8	1271138	1271145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_015947	CGGC	2	8	1271676	1271683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_015947	GTTG	2	8	1271706	1271713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015947	GTTG	2	8	1271738	1271745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015947	GTTG	2	8	1271770	1271777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015947	GGT	2	6	1272686	1272691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015947	GC	3	6	1274160	1274165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_015947	GCG	2	6	1274207	1274212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015947	GC	3	6	1276096	1276101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_015947	CGG	2	6	1276172	1276177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015947	AAC	2	6	1276192	1276197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015947	CGG	2	6	1276842	1276847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015947	TCA	2	6	1276862	1276867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015947	GCC	2	6	1276883	1276888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_015947	AGGC	2	8	1276913	1276920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_015947	CGGC	2	8	1278640	1278647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_015947	GC	4	8	1278646	1278653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_015947	GCA	2	6	1278672	1278677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_015947	GTT	2	6	1279162	1279167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3076	NC_015947	CGGC	2	8	1280630	1280637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3078	NC_015947	CGGC	2	8	1280669	1280676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_015947	GTG	2	6	1282142	1282147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3084	NC_015947	TGG	2	6	1285259	1285264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015947	ATGAA	2	10	1285313	1285322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_015947	TGG	2	6	1288111	1288116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015947	CAG	2	6	1288569	1288574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015947	GC	3	6	1288620	1288625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_015947	GGC	2	6	1288700	1288705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015947	CG	3	6	1288733	1288738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_015947	GCG	3	9	1288736	1288744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015947	GAA	2	6	1288861	1288866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015947	GTG	3	9	1288887	1288895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_015947	AGG	2	6	1301894	1301899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015947	CGT	2	6	1301907	1301912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015947	GGAT	2	8	1301939	1301946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015947	TCT	2	6	1301954	1301959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_015947	GATC	2	8	1301998	1302005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_015947	TAT	2	6	1302010	1302015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015947	ATT	2	6	1302021	1302026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015947	GTT	2	6	1302032	1302037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015947	CGC	2	6	1302093	1302098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_015947	GCGGG	2	10	1302167	1302176	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_015947	GCAG	2	8	1302812	1302819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_015947	GGC	2	6	1304187	1304192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015947	ATA	3	9	1304309	1304317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015947	CTGC	2	8	1304337	1304344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_015947	GCC	2	6	1304345	1304350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_015947	ATCG	2	8	1304351	1304358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_015947	GCA	2	6	1306611	1306616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015947	T	7	7	1306669	1306675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015947	CG	3	6	1306682	1306687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_015947	GGA	2	6	1306740	1306745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015947	TTC	2	6	1307210	1307215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_015947	GC	3	6	1312009	1312014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_015947	ATC	2	6	1312036	1312041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015947	GCG	2	6	1313005	1313010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015947	GCCTG	2	10	1313036	1313045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3123	NC_015947	AT	3	6	1314699	1314704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015947	GCCG	2	8	1315130	1315137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_015947	CGGC	2	8	1315185	1315192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_015947	CGGC	2	8	1315216	1315223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_015947	GAAA	2	8	1319418	1319425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015947	AGGC	2	8	1319458	1319465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_015947	TTCCT	2	10	1319477	1319486	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_015947	CGGG	2	8	1319505	1319512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3132	NC_015947	G	6	6	1324525	1324530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_015947	GGCG	2	8	1473935	1473942	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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