MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015947	GCCG	2	8	548982	548989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_015947	TCG	2	6	549048	549053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015947	CG	3	6	549074	549079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_015947	TCG	2	6	549108	549113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015947	AGG	3	9	549141	549149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015947	CGGC	2	8	549160	549167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015947	CGG	2	6	549202	549207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015947	GAA	2	6	549236	549241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015947	A	7	7	549267	549273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015947	AGGG	2	8	549284	549291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015947	G	6	6	549314	549319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015947	ATGCA	2	10	549719	549728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_015947	CAA	2	6	549753	549758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015947	CGC	2	6	550189	550194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_015947	GCC	2	6	550197	550202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_015947	GAA	2	6	550233	550238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015947	GAT	2	6	550261	550266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015947	ACT	2	6	550324	550329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015947	TCG	2	6	550338	550343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015947	ACC	2	6	550349	550354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_015947	GCCG	2	8	553039	553046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_015947	CG	3	6	553045	553050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_015947	ACC	2	6	553051	553056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_015947	CTGG	2	8	555702	555709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_015947	GGC	2	6	555774	555779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015947	GCAA	2	8	555812	555819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_015947	CCAT	2	8	555850	555857	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_015947	CCTG	2	8	555870	555877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_015947	GCAAAA	4	24	555946	555969	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1530	NC_015947	TTGAAT	2	12	555986	555997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015947	TCTT	2	8	556002	556009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_015947	CGG	2	6	556022	556027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015947	GCAGGC	2	12	556033	556044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_015947	ATGG	2	8	556093	556100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015947	TCA	2	6	556186	556191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015947	CAA	2	6	556204	556209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015947	A	7	7	556208	556214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015947	GGGC	2	8	557870	557877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_015947	ACGG	2	8	557918	557925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_015947	G	6	6	557991	557996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015947	CT	3	6	557997	558002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_015947	CCTGCA	2	12	558015	558026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_015947	CGTCAA	2	12	558046	558057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015947	GGCCC	2	10	558124	558133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1545	NC_015947	GGC	2	6	558141	558146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_015947	GCAA	2	8	558179	558186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_015947	CGC	2	6	558213	558218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_015947	ACCC	2	8	558248	558255	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1549	NC_015947	ATGG	2	8	558469	558476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015947	GCTGTT	2	12	558529	558540	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1551	NC_015947	C	6	6	558595	558600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_015947	ACCC	2	8	558691	558698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1553	NC_015947	GGC	2	6	559696	559701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_015947	AGA	2	6	563198	563203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015947	GGAG	2	8	563210	563217	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015947	GAC	2	6	564455	564460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015947	TTGT	2	8	565778	565785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015947	CCCCG	2	10	565815	565824	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1559	NC_015947	CGGAC	2	10	565907	565916	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_015947	GGGCC	2	10	565924	565933	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_015947	CCG	2	6	566375	566380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_015947	CCG	2	6	566407	566412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_015947	GGC	2	6	566417	566422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_015947	CAC	2	6	566433	566438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_015947	GGT	2	6	566443	566448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015947	GCGG	2	8	566478	566485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_015947	TCG	2	6	566497	566502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015947	GGCG	2	8	566535	566542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_015947	ATC	2	6	566586	566591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015947	TCC	2	6	566622	566627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_015947	CGC	2	6	568010	568015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_015947	GCT	2	6	568021	568026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015947	CG	3	6	578115	578120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_015947	CAT	2	6	578165	578170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015947	GAT	2	6	578264	578269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015947	GGGC	2	8	578339	578346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_015947	GCC	2	6	579770	579775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_015947	GCA	2	6	579847	579852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_015947	GGT	2	6	579857	579862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015947	CGTC	2	8	579925	579932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_015947	ATG	2	6	581346	581351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015947	AGG	2	6	581352	581357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015947	TC	3	6	585555	585560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_015947	CACC	2	8	592355	592362	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1585	NC_015947	CCTT	2	8	593805	593812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_015947	G	7	7	595267	595273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015947	GGCG	2	8	595288	595295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_015947	TCCA	2	8	595373	595380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_015947	TGC	2	6	595499	595504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_015947	GGC	2	6	598937	598942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015947	CGG	2	6	598955	598960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_015947	GAA	2	6	599567	599572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015947	GCG	2	6	599635	599640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_015947	GCA	2	6	603168	603173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_015947	TAC	2	6	603242	603247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_015947	CA	3	6	604529	604534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_015947	A	6	6	604550	604555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015947	TAA	2	6	605002	605007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015947	CGG	2	6	605036	605041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_015947	GCAG	2	8	605075	605082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_015947	GGC	2	6	605093	605098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015947	GCAG	2	8	605163	605170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_015947	G	6	6	606955	606960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015947	CCG	2	6	606990	606995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_015947	GCCG	2	8	607000	607007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_015947	GGGT	2	8	607061	607068	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015947	G	6	6	607077	607082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015947	CGC	2	6	607112	607117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_015947	CCCG	2	8	607176	607183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1610	NC_015947	ACCC	2	8	607226	607233	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1611	NC_015947	GGGGC	2	10	607390	607399	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_015947	ATGG	2	8	607428	607435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015947	TTGC	2	8	607466	607473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_015947	GCC	2	6	607506	607511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_015947	CCGCC	2	10	607566	607575	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1616	NC_015947	GCA	2	6	608080	608085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_015947	CGGC	2	8	609917	609924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_015947	GAT	2	6	610793	610798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015947	GGTG	2	8	610855	610862	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015947	CCG	2	6	610873	610878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_015947	TTGG	2	8	610894	610901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015947	GCG	2	6	610915	610920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015947	CAGG	2	8	614434	614441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_015947	CTGG	2	8	614466	614473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_015947	GGCC	2	8	614478	614485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_015947	GGC	2	6	616043	616048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_015947	CGAA	2	8	616053	616060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_015947	ACC	2	6	616074	616079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_015947	GTT	2	6	618276	618281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015947	AGC	2	6	618286	618291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_015947	GGCTC	2	10	618300	618309	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1632	NC_015947	TCT	3	9	619925	619933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015947	GC	3	6	622966	622971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_015947	CG	3	6	622987	622992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_015947	GA	3	6	623060	623065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_015947	TCA	2	6	623093	623098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_015947	GCG	2	6	623151	623156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_015947	GC	3	6	623159	623164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1639	NC_015947	CGG	2	6	623168	623173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1769	NC_015947	CACC	2	8	697685	697692	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1770	NC_015947	AGC	2	6	697695	697700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_015947	GGC	2	6	764124	764129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1930	NC_015947	TGG	2	6	767023	767028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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