MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015947	AGG	2	6	374715	374720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015947	AGC	2	6	374731	374736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015947	AAAG	2	8	374745	374752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015947	CTG	2	6	374890	374895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015947	GTTG	2	8	375113	375120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015947	ACCGT	2	10	375256	375265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1007	NC_015947	GA	3	6	375307	375312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015947	TGG	2	6	375373	375378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015947	CGG	2	6	375558	375563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015947	GCG	2	6	375640	375645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015947	TGAAAT	2	12	375667	375678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015947	ACC	2	6	375829	375834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015947	TGG	2	6	375889	375894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015947	TCC	2	6	375915	375920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_015947	GGA	2	6	375932	375937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015947	TG	3	6	375976	375981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015947	GGT	2	6	376052	376057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015947	CGG	2	6	376139	376144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015947	TCA	2	6	376167	376172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015947	CGT	2	6	376247	376252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015947	GCT	2	6	376301	376306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015947	GC	3	6	376422	376427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_015947	GT	3	6	376498	376503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015947	CGT	2	6	376590	376595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015947	ACC	2	6	376707	376712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_015947	ATCCC	2	10	376715	376724	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1027	NC_015947	GCT	2	6	376816	376821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015947	TTA	2	6	376840	376845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015947	GCT	2	6	376915	376920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015947	ACC	2	6	376955	376960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_015947	ATCCC	2	10	376963	376972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1032	NC_015947	GCT	2	6	377064	377069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015947	GGT	3	9	377107	377115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015947	CGG	2	6	377126	377131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015947	GCC	2	6	377148	377153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015947	CGGC	2	8	377167	377174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_015947	CCACG	2	10	377188	377197	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_015947	CCAA	2	8	377230	377237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_015947	CACC	2	8	377244	377251	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1040	NC_015947	GC	3	6	377259	377264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_015947	A	6	6	377265	377270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015947	GCG	2	6	377271	377276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015947	ACGA	2	8	382787	382794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_015947	CGGC	2	8	382819	382826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_015947	GAC	2	6	383548	383553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015947	A	6	6	383592	383597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015947	CGT	2	6	383651	383656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015947	GC	3	6	383676	383681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_015947	GCCG	2	8	383698	383705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015947	GGCGCA	2	12	383706	383717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015947	GA	4	8	383743	383750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015947	AGG	2	6	385212	385217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015947	CG	3	6	385221	385226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015947	CTTT	2	8	385235	385242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_015947	GGCTC	2	10	387027	387036	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_015947	GAAGCA	2	12	387042	387053	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1057	NC_015947	A	6	6	387055	387060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015947	T	6	6	387077	387082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015947	GGT	2	6	390422	390427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015947	GT	3	6	390435	390440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015947	GCC	2	6	390482	390487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_015947	GCA	2	6	390504	390509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015947	GTG	2	6	392075	392080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015947	GCAG	2	8	395423	395430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_015947	GCCG	2	8	396433	396440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_015947	AGC	2	6	399244	399249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015947	GGCTC	2	10	399258	399267	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_015947	AAGGA	2	10	399315	399324	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015947	GAT	2	6	400226	400231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015947	CAA	2	6	400239	400244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015947	CG	3	6	400247	400252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_015947	CAGGG	2	10	403532	403541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_015947	GCC	2	6	403546	403551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015947	GC	3	6	403555	403560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_015947	GCG	2	6	403568	403573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015947	AGC	2	6	404548	404553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015947	GTG	2	6	405095	405100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015947	GGGGC	2	10	405107	405116	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_015947	CG	3	6	405156	405161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_015947	CGC	2	6	405195	405200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_015947	GCG	2	6	405488	405493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015947	GGC	2	6	405573	405578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015947	ATA	2	6	405588	405593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015947	GGT	2	6	407337	407342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015947	AGG	2	6	407345	407350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015947	ACC	2	6	407378	407383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_015947	CGT	2	6	407393	407398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015947	CG	3	6	407403	407408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_015947	GAC	2	6	407433	407438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015947	ACCTG	2	10	407440	407449	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1091	NC_015947	C	6	6	407537	407542	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1092	NC_015947	GTA	2	6	407554	407559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015947	CACC	2	8	407617	407624	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1094	NC_015947	CCG	2	6	407645	407650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_015947	GCCG	2	8	408055	408062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_015947	CAA	3	9	408077	408085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015947	C	6	6	409391	409396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_015947	TGG	2	6	409418	409423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015947	TCA	2	6	409494	409499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015947	CTG	2	6	409504	409509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015947	A	6	6	411691	411696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015947	T	6	6	411753	411758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015947	GCG	3	9	411771	411779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015947	GATG	2	8	411802	411809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015947	GGC	2	6	412413	412418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015947	CGGC	2	8	412422	412429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_015947	ACC	2	6	412433	412438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_015947	CGT	2	6	413673	413678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015947	C	6	6	413696	413701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_015947	CTGC	2	8	413758	413765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_015947	TCC	2	6	414286	414291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_015947	CCG	2	6	414428	414433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_015947	GTG	2	6	414450	414455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015947	ACC	2	6	414460	414465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_015947	CAA	2	6	414475	414480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015947	GTG	2	6	415492	415497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015947	GGCTC	2	10	415513	415522	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_015947	GTT	2	6	415873	415878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015947	CGGG	2	8	418986	418993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_015947	CAG	2	6	418997	419002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015947	GTT	2	6	419023	419028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015947	CGAGC	2	10	419056	419065	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_015947	GAG	2	6	419140	419145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015947	GCA	2	6	419164	419169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015947	CGGC	2	8	419180	419187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015947	AGAA	2	8	419220	419227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015947	CTC	2	6	421840	421845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_015947	ATT	2	6	421895	421900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015947	ACC	2	6	421934	421939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_015947	GA	3	6	423483	423488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015947	GCG	2	6	428730	428735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015947	CCTGCA	2	12	428737	428748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_015947	CAACAG	2	12	428765	428776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015947	GGCGG	2	10	428794	428803	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_015947	CCGCC	2	10	428886	428895	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1136	NC_015947	GCT	2	6	428943	428948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_015947	GCCC	2	8	503422	503429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1407	NC_015947	GTG	2	6	503481	503486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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