MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015947	CCGG	2	8	220579	220586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015947	TGC	2	6	220617	220622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015947	CAG	2	6	220630	220635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015947	TGT	2	6	220643	220648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015947	CGCA	2	8	220649	220656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_015947	GGT	2	6	221254	221259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015947	GCCG	2	8	221260	221267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_015947	CGGC	2	8	221316	221323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015947	CCG	2	6	221340	221345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_015947	CGTC	2	8	221428	221435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_015947	GGGA	2	8	222904	222911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015947	TGC	2	6	222928	222933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015947	CGC	2	6	223169	223174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015947	CAGGG	2	10	224052	224061	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
515	NC_015947	CGGC	2	8	225884	225891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_015947	GCCG	2	8	225917	225924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015947	CCG	2	6	225936	225941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_015947	CG	3	6	225940	225945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_015947	CCG	2	6	226845	226850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015947	CAC	2	6	226907	226912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015947	TCA	2	6	226941	226946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015947	ACC	2	6	226991	226996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015947	GCG	2	6	227080	227085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015947	GTCG	2	8	227153	227160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_015947	ATGTC	2	10	227267	227276	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_015947	AC	3	6	227326	227331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015947	CCG	2	6	229746	229751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015947	CG	3	6	229750	229755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_015947	GCCG	2	8	229761	229768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_015947	ATC	2	6	229792	229797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015947	GCC	2	6	231706	231711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_015947	GCA	2	6	232285	232290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015947	CCT	2	6	235861	235866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_015947	CTC	2	6	235879	235884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_015947	TG	3	6	235929	235934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015947	AC	3	6	235943	235948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_015947	ATC	2	6	235977	235982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015947	GCA	2	6	236804	236809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015947	CG	3	6	236813	236818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_015947	ATCC	2	8	236827	236834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_015947	GCG	2	6	236857	236862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015947	GACC	2	8	238915	238922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015947	GCCG	2	8	239882	239889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_015947	CGGC	2	8	239927	239934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015947	CGG	2	6	239967	239972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015947	ACA	2	6	240619	240624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015947	CCG	2	6	241352	241357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015947	CGG	2	6	241362	241367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015947	CG	4	8	241423	241430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015947	CG	3	6	241433	241438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015947	CG	3	6	241441	241446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015947	GAC	3	9	241461	241469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015947	GGCCGG	2	12	241529	241540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015947	CTA	2	6	241574	241579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015947	GC	3	6	241660	241665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_015947	TCCC	2	8	241695	241702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
557	NC_015947	GGGA	2	8	241717	241724	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015947	CGG	2	6	243264	243269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015947	GCCGG	2	10	243288	243297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
560	NC_015947	TGC	2	6	244395	244400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015947	GCT	2	6	244481	244486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015947	CGG	2	6	244531	244536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015947	GGCA	2	8	247499	247506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_015947	TAG	2	6	247540	247545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015947	TGGA	2	8	247560	247567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015947	ATCGAA	2	12	247573	247584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
567	NC_015947	GAA	2	6	247602	247607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015947	GCATG	2	10	247615	247624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
569	NC_015947	ACCC	2	8	247651	247658	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
570	NC_015947	CAG	2	6	247660	247665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015947	GGGT	2	8	247685	247692	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015947	GCG	2	6	247722	247727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015947	ACCC	2	8	247771	247778	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
574	NC_015947	GGTG	2	8	249290	249297	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015947	AAT	2	6	249303	249308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015947	GTC	2	6	249338	249343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015947	AGC	2	6	250857	250862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015947	GC	3	6	254927	254932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_015947	AAC	2	6	254940	254945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015947	GGAT	2	8	254966	254973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015947	GC	3	6	254974	254979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_015947	T	7	7	255064	255070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015947	CG	4	8	255075	255082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015947	GCCG	2	8	255089	255096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_015947	GCA	2	6	255104	255109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015947	TTC	2	6	255196	255201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015947	CG	3	6	255210	255215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015947	TCT	2	6	255238	255243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015947	GTTG	2	8	255271	255278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015947	CTCTT	2	10	255288	255297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
591	NC_015947	G	6	6	255378	255383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015947	CAG	2	6	257065	257070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015947	GAA	2	6	257173	257178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015947	AGA	2	6	257183	257188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015947	AGC	2	6	257202	257207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015947	AAGCT	2	10	257219	257228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
597	NC_015947	TCT	2	6	257272	257277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015947	GTG	2	6	257723	257728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015947	GTGG	2	8	257739	257746	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015947	AGC	2	6	258820	258825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015947	GCA	2	6	258848	258853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015947	GCC	2	6	258855	258860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_015947	CTT	2	6	258987	258992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015947	GC	3	6	259005	259010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_015947	GCC	2	6	259111	259116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_015947	GC	3	6	259119	259124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015947	CATC	2	8	259142	259149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_015947	AGG	2	6	259155	259160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015947	CCG	2	6	260440	260445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015947	T	9	9	260450	260458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015947	GCCC	3	12	265466	265477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
612	NC_015947	GGC	2	6	271371	271376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015947	GCC	2	6	271384	271389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_015947	CGA	2	6	271428	271433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015947	CCG	2	6	271486	271491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_015947	GC	3	6	271543	271548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_015947	CGA	2	6	273036	273041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015947	CGC	2	6	276239	276244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_015947	C	6	6	276306	276311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
620	NC_015947	TC	3	6	276348	276353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_015947	GC	3	6	276382	276387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015947	CG	3	6	276431	276436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015947	GCA	2	6	277066	277071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015947	CTTC	2	8	277086	277093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_015947	TCG	2	6	277130	277135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015947	GC	4	8	277320	277327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015947	TAC	2	6	277329	277334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015947	AAT	2	6	277336	277341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015947	ATG	2	6	277547	277552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015947	GA	3	6	277603	277608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015947	CGC	2	6	277648	277653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015947	CGT	2	6	278726	278731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_015947	GCG	2	6	278754	278759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015947	CG	4	8	281521	281528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_015947	ACC	2	6	281535	281540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_015947	CAA	2	6	281556	281561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015947	GTG	2	6	281565	281570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_015947	CGGC	2	8	281639	281646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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