MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015947	GTTG	2	8	2284153	2284160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015947	CCG	2	6	2284216	2284221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_015947	GAC	2	6	2284730	2284735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015947	CCA	2	6	2284829	2284834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_015947	CAA	2	6	2284845	2284850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015947	CGG	2	6	2284980	2284985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015947	ACC	2	6	2284990	2284995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_015947	GGC	2	6	2285068	2285073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015947	AGGCCA	2	12	2285258	2285269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_015947	CT	3	6	2286739	2286744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_015947	CTGGC	2	10	2286761	2286770	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5012	NC_015947	GGT	2	6	2286784	2286789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015947	GC	3	6	2286812	2286817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_015947	CGG	2	6	2286831	2286836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015947	GAT	2	6	2290823	2290828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015947	GC	3	6	2291745	2291750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_015947	GC	3	6	2291802	2291807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_015947	GC	3	6	2291900	2291905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_015947	GCC	2	6	2291920	2291925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015947	GAT	2	6	2292324	2292329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015947	GGCA	2	8	2292337	2292344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_015947	CGGC	2	8	2292396	2292403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_015947	GTG	2	6	2292963	2292968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015947	GTG	2	6	2292974	2292979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015947	C	7	7	2293075	2293081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5026	NC_015947	CA	3	6	2293095	2293100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_015947	CGGCC	2	10	2293108	2293117	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5028	NC_015947	GCA	2	6	2293446	2293451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_015947	TCAT	2	8	2295262	2295269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_015947	ATGGC	2	10	2295304	2295313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_015947	CTG	2	6	2295348	2295353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_015947	CCTCC	2	10	2295400	2295409	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5033	NC_015947	GCC	2	6	2296022	2296027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_015947	CGC	2	6	2296062	2296067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015947	AAC	2	6	2298770	2298775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015947	ACG	2	6	2299661	2299666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015947	CGA	2	6	2299683	2299688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_015947	TCT	2	6	2299742	2299747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_015947	GCT	2	6	2299784	2299789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_015947	CAT	2	6	2299809	2299814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015947	CCG	2	6	2299820	2299825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_015947	TCC	4	12	2299830	2299841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_015947	TGGA	2	8	2299878	2299885	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015947	GCT	2	6	2302849	2302854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_015947	CGCC	2	8	2302882	2302889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5046	NC_015947	GCG	2	6	2302899	2302904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_015947	TC	3	6	2304490	2304495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_015947	GGT	3	9	2304502	2304510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015947	TGG	2	6	2304539	2304544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015947	GCA	2	6	2304560	2304565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015947	C	7	7	2304638	2304644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5052	NC_015947	TCG	2	6	2305809	2305814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015947	CG	3	6	2305852	2305857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_015947	CTG	2	6	2305977	2305982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015947	CGGG	2	8	2306738	2306745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_015947	TGCCC	2	10	2307722	2307731	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5057	NC_015947	CTG	2	6	2307735	2307740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015947	CGT	2	6	2307758	2307763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015947	CGCA	2	8	2309620	2309627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_015947	GGGCG	2	10	2309658	2309667	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5061	NC_015947	CGG	2	6	2311069	2311074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015947	GCC	2	6	2311097	2311102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_015947	C	6	6	2311101	2311106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5064	NC_015947	CGG	2	6	2311129	2311134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015947	TTG	2	6	2311138	2311143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015947	GCGCT	2	10	2311155	2311164	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5067	NC_015947	CGG	2	6	2311168	2311173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015947	GCG	2	6	2311182	2311187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015947	GCG	2	6	2311210	2311215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_015947	CGG	2	6	2311229	2311234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015947	GCG	2	6	2311278	2311283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_015947	CGC	2	6	2311316	2311321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_015947	GCA	3	9	2311334	2311342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015947	CCG	2	6	2311413	2311418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_015947	ACC	2	6	2312587	2312592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_015947	CAC	2	6	2312602	2312607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_015947	GA	4	8	2312613	2312620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_015947	CTC	2	6	2313997	2314002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_015947	CTCC	2	8	2314019	2314026	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5080	NC_015947	TGC	2	6	2314027	2314032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_015947	AGG	2	6	2314749	2314754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015947	CAC	2	6	2315512	2315517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_015947	GCG	2	6	2315521	2315526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015947	CCCG	2	8	2316860	2316867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5085	NC_015947	CGA	2	6	2316874	2316879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_015947	CGT	2	6	2316893	2316898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_015947	TG	4	8	2316928	2316935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015947	ATC	2	6	2316975	2316980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_015947	CCG	2	6	2316985	2316990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_015947	CGC	2	6	2316997	2317002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_015947	CCGC	2	8	2317017	2317024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5092	NC_015947	CGG	2	6	2317048	2317053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015947	GCAGGA	2	12	2317146	2317157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5094	NC_015947	CGT	2	6	2317452	2317457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_015947	GGCA	2	8	2317769	2317776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_015947	ACC	2	6	2318412	2318417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_015947	GCC	2	6	2319287	2319292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_015947	CGCC	2	8	2319301	2319308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5099	NC_015947	GCC	2	6	2319673	2319678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_015947	GCAG	2	8	2320803	2320810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_015947	GCC	2	6	2320849	2320854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_015947	AGA	2	6	2320883	2320888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015947	GGC	2	6	2320905	2320910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_015947	C	6	6	2320948	2320953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5105	NC_015947	CAG	2	6	2320961	2320966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_015947	TGC	2	6	2322854	2322859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015947	CGC	2	6	2322868	2322873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_015947	GCCA	2	8	2322881	2322888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_015947	CGA	2	6	2322955	2322960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_015947	CGGA	2	8	2322970	2322977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_015947	CG	3	6	2322989	2322994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_015947	TGA	2	6	2323048	2323053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015947	GCA	2	6	2323092	2323097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015947	TGC	2	6	2323119	2323124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_015947	GC	3	6	2323123	2323128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_015947	ATG	2	6	2323154	2323159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015947	CAC	2	6	2324091	2324096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_015947	GCT	2	6	2324111	2324116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_015947	GGCA	2	8	2324133	2324140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_015947	TGCC	2	8	2324144	2324151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_015947	CAG	2	6	2325314	2325319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_015947	CGC	2	6	2326969	2326974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_015947	ACG	3	9	2326976	2326984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_015947	GCT	2	6	2327049	2327054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015947	TAC	2	6	2327066	2327071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015947	CGC	2	6	2327072	2327077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_015947	GCG	2	6	2327113	2327118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_015947	GCCG	2	8	2327139	2327146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_015947	GCC	2	6	2327154	2327159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_015947	TTCA	2	8	2332205	2332212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_015947	GACG	2	8	2333825	2333832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_015947	GCG	2	6	2333842	2333847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_015947	GC	3	6	2333924	2333929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5234	NC_015947	CTGTT	2	10	2378203	2378212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5242	NC_015947	GC	3	6	2386635	2386640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5243	NC_015947	CGA	2	6	2386655	2386660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_015947	TTG	2	6	2395510	2395515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5260	NC_015947	TGG	2	6	2399675	2399680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_015947	CCA	2	6	2399769	2399774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_015947	GGC	2	6	2399795	2399800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_015947	C	6	6	2399814	2399819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5265	NC_015947	CCG	2	6	2402485	2402490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5266	NC_015947	G	6	6	2402514	2402519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5292	NC_015947	GGCTC	2	10	2414355	2414364	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5295	NC_015947	GTAA	2	8	2415014	2415021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_015947	GCG	2	6	2469219	2469224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5393	NC_015947	CAT	2	6	2479217	2479222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5397	NC_015947	GCC	2	6	2480829	2480834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5424	NC_015947	GGA	2	6	2495209	2495214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5427	NC_015947	CG	3	6	2495282	2495287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5479	NC_015947	CCAC	2	8	2523745	2523752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5480	NC_015947	GCCG	2	8	2523772	2523779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5491	NC_015947	AATC	2	8	2539619	2539626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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