MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 7424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015875	TAT	2	6	1566181	1566186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015875	A	6	6	1566233	1566238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015875	TGCT	2	8	1566247	1566254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_015875	T	6	6	1566254	1566259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015875	GCT	2	6	1566316	1566321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015875	CT	3	6	1566330	1566335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_015875	A	7	7	1566341	1566347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015875	ATT	2	6	1567099	1567104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015875	CT	3	6	1568604	1568609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_015875	ATT	2	6	1569660	1569665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015875	CTA	2	6	1569676	1569681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_015875	T	6	6	1569717	1569722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015875	TCA	2	6	1569744	1569749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015875	CAA	2	6	1569774	1569779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015875	CCT	2	6	1569787	1569792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_015875	T	6	6	1569796	1569801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015875	AATG	2	8	1569805	1569812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015875	AGCT	2	8	1572537	1572544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_015875	GGCAA	2	10	1572564	1572573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_015875	AAG	2	6	1572665	1572670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015875	TATC	2	8	1572715	1572722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_015875	TAT	2	6	1572727	1572732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015875	TCA	2	6	1573683	1573688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_015875	TA	3	6	1574346	1574351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015875	TA	3	6	1574359	1574364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015875	TATT	2	8	1574368	1574375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_015875	AAAG	2	8	1574389	1574396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_015875	TAT	2	6	1576271	1576276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015875	TTCT	2	8	1576299	1576306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_015875	CTT	2	6	1576310	1576315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_015875	AGT	2	6	1576407	1576412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015875	CTC	2	6	1577079	1577084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_015875	CAT	2	6	1577085	1577090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5036	NC_015875	CAATT	2	10	1577708	1577717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5038	NC_015875	TCTAT	2	10	1577817	1577826	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_015875	AAG	2	6	1577919	1577924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5041	NC_015875	CT	3	6	1580460	1580465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_015875	T	6	6	1580479	1580484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015875	T	6	6	1580519	1580524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015875	C	6	6	1580589	1580594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5045	NC_015875	A	6	6	1580651	1580656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_015875	T	6	6	1582080	1582085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_015875	CTC	2	6	1582103	1582108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_015875	T	6	6	1582111	1582116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015875	AGTA	2	8	1582125	1582132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015875	C	7	7	1583658	1583664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5054	NC_015875	CTTT	2	8	1584383	1584390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_015875	T	6	6	1584388	1584393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015875	ATT	2	6	1584409	1584414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015875	TTAAAA	2	12	1584420	1584431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5060	NC_015875	CTT	2	6	1587766	1587771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_015875	CTT	2	6	1589505	1589510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015875	TTC	2	6	1590912	1590917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015875	TCT	2	6	1591382	1591387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_015875	CCT	2	6	1591390	1591395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_015875	TTC	2	6	1591429	1591434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015875	CTA	2	6	1591448	1591453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5068	NC_015875	CT	3	6	1591475	1591480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_015875	AGG	2	6	1591640	1591645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_015875	AGTT	2	8	1591678	1591685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015875	CCTT	2	8	1591696	1591703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_015875	GAAG	2	8	1591725	1591732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015875	T	6	6	1591744	1591749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_015875	TAG	2	6	1591950	1591955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_015875	T	9	9	1592071	1592079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015875	T	6	6	1592123	1592128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015875	AT	3	6	1592140	1592145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015875	AAT	2	6	1592162	1592167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015875	ATG	2	6	1592265	1592270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_015875	ATA	2	6	1592369	1592374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015875	T	7	7	1592380	1592386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_015875	A	6	6	1592559	1592564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015875	TC	3	6	1592580	1592585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5101	NC_015875	TATT	2	8	1593072	1593079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015875	TTAT	2	8	1593085	1593092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015875	AAT	2	6	1593104	1593109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015875	TAG	2	6	1593187	1593192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015875	CTTC	2	8	1593203	1593210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5109	NC_015875	TCC	2	6	1593389	1593394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_015875	CAG	2	6	1593415	1593420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015875	GCTC	2	8	1593440	1593447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_015875	GCT	2	6	1593450	1593455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015875	T	7	7	1593526	1593532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015875	TTGT	2	8	1593575	1593582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015875	AGT	2	6	1593651	1593656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5118	NC_015875	TTGA	2	8	1593748	1593755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015875	TGA	2	6	1593786	1593791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015875	A	6	6	1593791	1593796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015875	TGA	3	9	1593800	1593808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015875	GAT	2	6	1593820	1593825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015875	T	6	6	1593941	1593946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015875	CTA	2	6	1594116	1594121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015875	TATT	2	8	1594124	1594131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015875	AAAG	2	8	1594136	1594143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015875	ATT	2	6	1594168	1594173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015875	ATT	2	6	1594211	1594216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015875	A	6	6	1594237	1594242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015875	T	6	6	1594303	1594308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015875	TAC	2	6	1594310	1594315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015875	TCA	2	6	1594324	1594329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_015875	CAA	2	6	1598481	1598486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5392	NC_015875	ACC	2	6	1652970	1652975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5393	NC_015875	TTG	2	6	1653015	1653020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_015875	T	6	6	1653058	1653063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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