MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	AAG	2	6	86	91	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015760	CTA	5	15	1580	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015760	ATA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015760	TAA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015760	TCT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015760	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015760	GAT	2	6	11993	11998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015760	TAA	2	6	12015	12020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015760	CTT	2	6	14605	14610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015760	GAT	2	6	14703	14708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015760	AGA	2	6	14869	14874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015760	GAC	2	6	14911	14916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015760	ATT	2	6	14940	14945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015760	GGC	2	6	14989	14994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015760	CTT	2	6	15039	15044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015760	TAG	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015760	CGA	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015760	GCA	2	6	15308	15313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015760	CGC	2	6	15355	15360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015760	TGT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015760	CAG	2	6	15477	15482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015760	GGA	2	6	15667	15672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015760	GAA	2	6	15931	15936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015760	GGT	2	6	16005	16010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015760	GTC	2	6	16019	16024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015760	CAT	2	6	16087	16092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015760	TAA	2	6	16122	16127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015760	GGA	2	6	16131	16136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015760	ATC	2	6	16155	16160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015760	CGC	2	6	16321	16326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015760	CAC	2	6	16366	16371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015760	GAT	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015760	CCT	2	6	16492	16497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015760	AGG	2	6	16594	16599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015760	ACG	2	6	16837	16842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015760	TAG	2	6	17008	17013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015760	AGA	2	6	17095	17100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015760	TCG	2	6	17198	17203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015760	GGA	2	6	17211	17216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015760	ACA	2	6	17329	17334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015760	ATG	2	6	17396	17401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015760	GGA	2	6	17529	17534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015760	ACC	2	6	17794	17799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015760	AGC	2	6	17874	17879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015760	GAA	2	6	18008	18013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015760	GAG	2	6	18024	18029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015760	ACA	2	6	18180	18185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015760	TAG	2	6	18337	18342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015760	GAT	2	6	18583	18588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015760	CGG	2	6	18673	18678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015760	GTT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015760	TAC	2	6	18943	18948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015760	CCT	2	6	19031	19036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015760	GGT	2	6	19167	19172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015760	TCG	2	6	19282	19287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015760	CGT	2	6	19362	19367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015760	GTT	2	6	19465	19470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015760	GTG	2	6	19957	19962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015760	ACC	2	6	20319	20324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015760	CGT	2	6	20356	20361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015760	GAG	2	6	20368	20373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015760	ATA	2	6	20458	20463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015760	TAA	2	6	20464	20469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015760	CTC	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015760	CGC	2	6	20698	20703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015760	GGA	2	6	20815	20820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015760	TCC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015760	TCG	2	6	20938	20943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015760	CGG	2	6	21038	21043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015760	TGT	2	6	21112	21117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015760	GGT	2	6	21224	21229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015760	GTA	2	6	21340	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015760	AGT	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015760	TAG	2	6	26222	26227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015760	GGA	2	6	26235	26240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015760	TAA	3	9	29323	29331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015760	ATA	2	6	29333	29338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015760	ATA	3	9	30711	30719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015760	TAA	2	6	30720	30725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015760	TTG	2	6	30749	30754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015760	ATT	2	6	30817	30822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015760	GTT	2	6	30859	30864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015760	GAA	2	6	30928	30933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015760	AGT	2	6	37053	37058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015760	ACT	2	6	37115	37120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015760	ATT	2	6	41300	41305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015760	TAA	2	6	43987	43992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015760	TCA	2	6	44026	44031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015760	CTT	2	6	44044	44049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015760	ATA	2	6	45068	45073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015760	TAG	2	6	45702	45707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015760	AAT	2	6	47271	47276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015760	GTG	2	6	47284	47289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015760	ACC	2	6	51586	51591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015760	CTG	2	6	51971	51976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015760	TAA	3	9	53412	53420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015760	AAT	2	6	53461	53466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015760	TTA	2	6	53475	53480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015760	TAT	2	6	54106	54111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015760	TAA	2	6	54200	54205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015760	AGC	2	6	54206	54211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015760	GAA	2	6	54263	54268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015760	TCT	2	6	54290	54295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015760	TTA	2	6	54307	54312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015760	GGA	2	6	54398	54403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015760	GAA	2	6	54408	54413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015760	CTG	2	6	54460	54465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015760	AAC	2	6	54597	54602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015760	ATT	2	6	56436	56441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015760	AAG	2	6	59887	59892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015760	CTT	2	6	59909	59914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015760	GAG	2	6	60834	60839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015760	CCT	2	6	60841	60846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015760	TTA	2	6	60860	60865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015760	TGA	2	6	63332	63337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015760	TCT	2	6	63348	63353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015760	CAT	2	6	63366	63371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015760	AGG	2	6	63400	63405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015760	CAG	2	6	63685	63690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015760	ATT	2	6	65010	65015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015760	TCT	2	6	68081	68086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015760	TAA	2	6	68148	68153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015760	GAT	2	6	68230	68235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015760	GCT	2	6	68247	68252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015760	GCG	2	6	68262	68267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015760	AGA	2	6	68394	68399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015760	GAC	2	6	68436	68441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015760	ATT	2	6	68465	68470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015760	GGC	2	6	68514	68519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015760	CTT	2	6	68564	68569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015760	TAG	2	6	68731	68736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015760	CGA	2	6	68759	68764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015760	GCA	2	6	68833	68838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015760	CGC	2	6	68880	68885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015760	TGT	2	6	68919	68924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015760	CAG	2	6	69002	69007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015760	GGA	2	6	69192	69197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015760	GAA	2	6	69456	69461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015760	GGT	2	6	69530	69535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015760	GTC	2	6	69544	69549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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